More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6091 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010557  BamMC406_6091  heat shock protein Hsp20  100 
 
 
146 aa  295  1e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6388  heat shock protein Hsp20  99.32 
 
 
146 aa  294  3e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0687951 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1572  HSP20 family protein  76.03 
 
 
215 aa  232  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.537516  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3047  HSP20 family protein  76.03 
 
 
145 aa  231  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1441  HSP20 family protein  76.03 
 
 
145 aa  231  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1472  HSP20 family protein  76.03 
 
 
145 aa  231  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.287102  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0530  HSP20 family protein  76.03 
 
 
145 aa  231  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0624  HSP20 family protein  76.03 
 
 
145 aa  231  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1247  HSP20 family protein  76.03 
 
 
145 aa  231  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5150  heat shock protein Hsp20  76.03 
 
 
146 aa  227  4e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2809  HSP20 family protein  72.6 
 
 
146 aa  223  7e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0002171  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2398  putative heat shock protein  71.43 
 
 
147 aa  222  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0850393  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5733  heat shock protein Hsp20  72.6 
 
 
146 aa  218  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.384471  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2580  putative small heat shock protein, Hsp20-related  72.6 
 
 
145 aa  217  5e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2612  Hsp20 family heat-shock protein  69.86 
 
 
146 aa  214  2.9999999999999998e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000112353  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4541  Hsp20 family heat-shock protein  69.86 
 
 
146 aa  214  2.9999999999999998e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000390119  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5262  heat shock protein Hsp20  69.18 
 
 
146 aa  214  4e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.100267 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3084  heat shock protein Hsp20  69.86 
 
 
147 aa  213  8e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3430  heat shock protein Hsp20  69.86 
 
 
147 aa  213  8e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.240603  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6252  heat shock protein Hsp20  67.79 
 
 
147 aa  211  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0400474  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6419  heat shock protein Hsp20  67.11 
 
 
147 aa  208  2e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6654  heat shock protein Hsp20  67.11 
 
 
147 aa  208  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.344847  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2055  heat shock protein Hsp20  69.18 
 
 
146 aa  207  3e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1204  HSP20 family protein  64.38 
 
 
146 aa  206  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3428  HSP20 family protein  64.38 
 
 
146 aa  206  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000574786  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0343  HSP20 family protein  64.38 
 
 
146 aa  206  1e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.439722  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2615  HSP20 family protein  64.38 
 
 
146 aa  206  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.696707  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3389  HSP20 family protein  64.38 
 
 
146 aa  206  1e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.134829  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3424  HSP20 family protein  64.38 
 
 
146 aa  206  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1235  heat shock protein Hsp20  67.12 
 
 
146 aa  202  1e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.346981  normal  0.252455 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0782  heat shock protein Hsp20  67.12 
 
 
146 aa  202  1e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1263  heat shock protein Hsp20  67.12 
 
 
146 aa  202  1e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.095432  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1142  heat shock protein Hsp20  65.07 
 
 
146 aa  198  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1154  heat shock protein Hsp20  64.38 
 
 
146 aa  196  6e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.408789 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4406  heat shock protein Hsp20  65.75 
 
 
146 aa  195  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4650  heat shock protein Hsp20  65.31 
 
 
145 aa  194  3e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.73287  normal  0.761162 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2602  Hsp20 family heat-shock protein  72.48 
 
 
118 aa  163  8e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0249408  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1730  HSP20 family protein  53.06 
 
 
149 aa  154  3e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.34799  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1974  heat shock protein Hsp20  47.52 
 
 
145 aa  139  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.285071  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1323  heat shock protein Hsp20  48.55 
 
 
148 aa  135  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0601396  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3375  heat shock protein Hsp20  45.39 
 
 
146 aa  131  1.9999999999999998e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2042  HSP20 family protein  46.04 
 
 
157 aa  131  3e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3314  HSP20 family protein  39.86 
 
 
151 aa  123  7e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.284188 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0391  heat shock protein Hsp20  39.34 
 
 
141 aa  90.5  7e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.854862  normal  0.714918 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4157  heat shock protein Hsp20  38.41 
 
 
150 aa  88.2  3e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0609  heat shock protein Hsp20  40.88 
 
 
156 aa  88.2  3e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.346897  normal  0.0142886 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4463  heat shock protein Hsp20  36.84 
 
 
141 aa  85.5  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4669  heat shock protein Hsp20  35.51 
 
 
147 aa  84.7  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0315  heat shock protein Hsp20  34.01 
 
 
149 aa  84.7  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2366  heat shock protein Hsp20  34.72 
 
 
151 aa  84.7  4e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.550987  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  31.65 
 
 
147 aa  84  7e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3256  heat shock protein Hsp20  34.85 
 
 
153 aa  84  7e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  31.65 
 
 
147 aa  83.6  8e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2532  HSP20 family protein  37.5 
 
 
144 aa  83.2  0.000000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2384  heat shock protein Hsp20  36.57 
 
 
164 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2957  HSP20 family protein  35.77 
 
 
143 aa  82.8  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2643  heat shock protein Hsp20  31.16 
 
 
151 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.840862  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7806  putative small heat-shock protein molecular chaperone  31.54 
 
 
146 aa  81.3  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00540773  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3773  heat shock protein Hsp20  33.11 
 
 
148 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3665  heat shock protein Hsp20  33.11 
 
 
148 aa  79  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0142367  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2958  heat shock protein Hsp20  33.79 
 
 
142 aa  79  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.206888 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  34.75 
 
 
148 aa  79  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1742  heat shock protein Hsp20  33.83 
 
 
152 aa  79  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.314982  hitchhiker  0.000988198 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2410  HSP20 family protein  34.9 
 
 
149 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.731962  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0182  heat shock protein Hsp20  32.89 
 
 
149 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0138231  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2730  heat shock protein Hsp20  37.32 
 
 
148 aa  77.4  0.00000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  35.92 
 
 
149 aa  76.6  0.00000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4943  heat shock protein Hsp20  34.31 
 
 
149 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0508199 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4119  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
149 aa  76.6  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00303961 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3765  heat shock protein Hsp20  33.58 
 
 
143 aa  76.6  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0793  heat shock protein Hsp20  34.06 
 
 
136 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.515708  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6319  heat shock protein Hsp20  39.29 
 
 
149 aa  75.5  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0052  heat shock protein Hsp20  32.39 
 
 
151 aa  75.1  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4342  heat shock protein Hsp20  32.61 
 
 
147 aa  75.1  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.204531 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4467  heat shock protein Hsp20  34.31 
 
 
149 aa  74.3  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.156372 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4761  heat shock protein Hsp20  34.31 
 
 
149 aa  74.3  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.735655  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1929  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
149 aa  74.7  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.638493  normal  0.0128011 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4380  heat shock protein Hsp20  34.31 
 
 
149 aa  74.3  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.642417  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2049  heat shock protein Hsp20  35.71 
 
 
164 aa  74.7  0.0000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0000140473  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2212  heat shock protein Hsp20  33.81 
 
 
171 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0125  heat shock protein Hsp20  36.03 
 
 
139 aa  74.3  0.0000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.369397  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3573  heat shock protein Hsp20  34.97 
 
 
144 aa  73.9  0.0000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  32.19 
 
 
150 aa  74.3  0.0000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1127  heat shock protein Hsp20  30.43 
 
 
142 aa  73.9  0.0000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3751  response regulator receiver protein  39.29 
 
 
150 aa  73.9  0.0000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.544355  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  35 
 
 
147 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6104  heat shock protein Hsp20  30.88 
 
 
158 aa  73.6  0.0000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0249434 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0788  heat shock protein Hsp20  34.03 
 
 
143 aa  73.6  0.0000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.351008  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2063  heat shock protein Hsp20  34.53 
 
 
155 aa  73.6  0.0000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.21571  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1805  heat shock protein Hsp20  31.88 
 
 
149 aa  72.8  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.642811  normal  0.803886 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0179  heat shock protein Hsp20  31.21 
 
 
149 aa  73.2  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1366  heat shock protein Hsp20  34.35 
 
 
176 aa  73.2  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.74874  normal  0.190619 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4812  heat shock protein Hsp20  33.81 
 
 
155 aa  72.8  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00238667  normal  0.807841 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3788  heat shock protein Hsp20  31.62 
 
 
144 aa  72.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3917  heat shock protein Hsp20  29.93 
 
 
142 aa  72  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6439  heat shock protein Hsp20  35.59 
 
 
153 aa  72.4  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.024706  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4413  heat shock protein Hsp20  39.29 
 
 
150 aa  72.4  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2320  heat shock protein Hsp20  31.43 
 
 
149 aa  72.4  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  34.29 
 
 
146 aa  72.4  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  34.29 
 
 
146 aa  72.4  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.106375 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>