More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2042 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2042  HSP20 family protein  100 
 
 
157 aa  316  1e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1730  HSP20 family protein  52.67 
 
 
149 aa  166  1e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.34799  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3314  HSP20 family protein  49.67 
 
 
151 aa  146  9e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.284188 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3375  heat shock protein Hsp20  49.33 
 
 
146 aa  144  6e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1974  heat shock protein Hsp20  48 
 
 
145 aa  139  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.285071  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2580  putative small heat shock protein, Hsp20-related  49.64 
 
 
145 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6388  heat shock protein Hsp20  46.76 
 
 
146 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0687951 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6091  heat shock protein Hsp20  46.04 
 
 
146 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3430  heat shock protein Hsp20  50 
 
 
147 aa  130  9e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.240603  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3084  heat shock protein Hsp20  50 
 
 
147 aa  130  9e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5262  heat shock protein Hsp20  47.48 
 
 
146 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.100267 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5150  heat shock protein Hsp20  48.2 
 
 
146 aa  124  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2398  putative heat shock protein  47.14 
 
 
147 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0850393  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4650  heat shock protein Hsp20  46.76 
 
 
145 aa  124  7e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.73287  normal  0.761162 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5733  heat shock protein Hsp20  43.88 
 
 
146 aa  121  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.384471  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1572  HSP20 family protein  43.17 
 
 
215 aa  120  6e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.537516  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0530  HSP20 family protein  43.17 
 
 
145 aa  120  7e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3047  HSP20 family protein  43.17 
 
 
145 aa  120  7e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0624  HSP20 family protein  43.17 
 
 
145 aa  120  7e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1247  HSP20 family protein  43.17 
 
 
145 aa  120  7e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1472  HSP20 family protein  43.17 
 
 
145 aa  120  7e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.287102  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1441  HSP20 family protein  43.17 
 
 
145 aa  120  7e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2809  HSP20 family protein  42.45 
 
 
146 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0002171  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1323  heat shock protein Hsp20  42.36 
 
 
148 aa  118  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0601396  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6252  heat shock protein Hsp20  42.57 
 
 
147 aa  118  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0400474  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2612  Hsp20 family heat-shock protein  42.57 
 
 
146 aa  118  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000112353  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4541  Hsp20 family heat-shock protein  42.57 
 
 
146 aa  118  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000390119  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6419  heat shock protein Hsp20  41.89 
 
 
147 aa  118  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6654  heat shock protein Hsp20  41.89 
 
 
147 aa  118  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.344847  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1142  heat shock protein Hsp20  41.38 
 
 
146 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2055  heat shock protein Hsp20  43.17 
 
 
146 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4406  heat shock protein Hsp20  42.45 
 
 
146 aa  115  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1154  heat shock protein Hsp20  40.69 
 
 
146 aa  115  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.408789 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1235  heat shock protein Hsp20  41.73 
 
 
146 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.346981  normal  0.252455 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0782  heat shock protein Hsp20  41.73 
 
 
146 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1263  heat shock protein Hsp20  41.73 
 
 
146 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.095432  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1204  HSP20 family protein  41.73 
 
 
146 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0343  HSP20 family protein  41.73 
 
 
146 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.439722  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3424  HSP20 family protein  41.73 
 
 
146 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3389  HSP20 family protein  41.73 
 
 
146 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.134829  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2615  HSP20 family protein  41.73 
 
 
146 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.696707  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3428  HSP20 family protein  41.73 
 
 
146 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000574786  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2602  Hsp20 family heat-shock protein  46.3 
 
 
118 aa  97.4  7e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0249408  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3665  heat shock protein Hsp20  32.19 
 
 
148 aa  92  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0142367  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2410  HSP20 family protein  30.61 
 
 
149 aa  90.1  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.731962  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0182  heat shock protein Hsp20  30.61 
 
 
149 aa  89.4  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0138231  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3773  heat shock protein Hsp20  31.51 
 
 
148 aa  89.4  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3256  heat shock protein Hsp20  36.84 
 
 
153 aa  84.3  6e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0391  heat shock protein Hsp20  34.81 
 
 
141 aa  80.9  0.000000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.854862  normal  0.714918 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0315  heat shock protein Hsp20  29.93 
 
 
149 aa  80.1  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  30.82 
 
 
147 aa  80.1  0.00000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2730  heat shock protein Hsp20  35.62 
 
 
148 aa  79.3  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  30.14 
 
 
147 aa  79  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2643  heat shock protein Hsp20  31.88 
 
 
151 aa  79.7  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.840862  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0357  Hsp20-like molecular chaperone  33.1 
 
 
148 aa  78.2  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2957  HSP20 family protein  35.42 
 
 
143 aa  77.4  0.00000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2532  HSP20 family protein  35.62 
 
 
144 aa  76.6  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2522  heat shock protein Hsp20  29.49 
 
 
150 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2074  heat shock protein Hsp20  38.24 
 
 
173 aa  76.3  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.145284  normal  0.308358 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4488  heat shock protein Hsp20  35.92 
 
 
145 aa  75.5  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2366  heat shock protein Hsp20  31.16 
 
 
151 aa  74.7  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.550987  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02640  low molecular weight heat shock protein  37.5 
 
 
158 aa  74.3  0.0000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4507  heat shock protein Hsp20  35.21 
 
 
145 aa  73.9  0.0000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5151  heat shock protein Hsp20  36.36 
 
 
135 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4352  heat shock protein Hsp20  34.51 
 
 
145 aa  73.2  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.735936  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0052  heat shock protein Hsp20  31.79 
 
 
151 aa  73.2  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0609  heat shock protein Hsp20  32.86 
 
 
156 aa  73.6  0.000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.346897  normal  0.0142886 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20170  heat shock protein Hsp20  31.33 
 
 
177 aa  72.8  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.638214  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3527  putative HspC2 heat shock protein  33.82 
 
 
173 aa  72  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0868338  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3146  heat shock protein Hsp20  36.03 
 
 
167 aa  71.6  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.754957 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3765  heat shock protein Hsp20  33.1 
 
 
143 aa  71.6  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1262  small heat shock protein  27.15 
 
 
151 aa  72  0.000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.753574  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2601  Hsp20 family heat-shock protein  35.51 
 
 
135 aa  72  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0188281  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1320  Hsp20/alpha crystallin family protein  27.15 
 
 
151 aa  72  0.000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1929  heat shock protein Hsp20  32.64 
 
 
149 aa  72  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.638493  normal  0.0128011 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2477  heat shock protein Hsp20  32.87 
 
 
143 aa  71.2  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3078  heat shock protein Hsp20  32.39 
 
 
145 aa  71.2  0.000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000700712  normal  0.0754711 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4119  heat shock protein Hsp20  31.25 
 
 
149 aa  70.5  0.000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00303961 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5151  heat shock protein Hsp20  29.93 
 
 
148 aa  70.1  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0184623  normal  0.32984 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4669  heat shock protein Hsp20  41.94 
 
 
147 aa  69.7  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4859  heat shock protein Hsp20  34.81 
 
 
204 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2384  heat shock protein Hsp20  33.78 
 
 
164 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3751  response regulator receiver protein  33.06 
 
 
150 aa  69.3  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.544355  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1434  low molecular weight heat shock protein  32.58 
 
 
160 aa  69.3  0.00000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1365  heat shock protein Hsp20  32.58 
 
 
160 aa  69.3  0.00000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.117276  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3234  HSP20 family protein  30.32 
 
 
231 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3076  heat shock protein Hsp20  26.43 
 
 
173 aa  68.6  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1127  heat shock protein Hsp20  29.71 
 
 
142 aa  68.6  0.00000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1742  heat shock protein Hsp20  34.56 
 
 
152 aa  68.6  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.314982  hitchhiker  0.000988198 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1296  heat shock protein Hsp20  32.14 
 
 
143 aa  68.2  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  30.77 
 
 
147 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2460  heat shock protein Hsp20  30.32 
 
 
186 aa  67.8  0.00000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0031555  normal  0.623789 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  29.86 
 
 
148 aa  67.8  0.00000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1824  heat shock protein Hsp20  28.17 
 
 
146 aa  67.4  0.00000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0843989  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0623  heat shock protein Hsp20  28.08 
 
 
152 aa  67  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.844177  normal  0.400233 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4463  heat shock protein Hsp20  34.58 
 
 
141 aa  67  0.00000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2287  heat shock protein Hsp20  28.78 
 
 
189 aa  67  0.00000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0788  heat shock protein Hsp20  35.45 
 
 
143 aa  67  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.351008  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  30.28 
 
 
150 aa  67  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0843  heat shock protein Hsp20  42.05 
 
 
144 aa  66.6  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.505886  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>