More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_4119 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_4119  heat shock protein Hsp20  100 
 
 
149 aa  307  2.9999999999999997e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00303961 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1929  heat shock protein Hsp20  91.28 
 
 
149 aa  285  1e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.638493  normal  0.0128011 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0463  heat shock protein Hsp20  39.58 
 
 
166 aa  110  6e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4342  heat shock protein Hsp20  40.41 
 
 
147 aa  107  5e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.204531 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0197  heat shock protein Hsp20  39.04 
 
 
147 aa  102  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0542117 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0383  heat shock protein Hsp20  36.73 
 
 
158 aa  101  4e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0539  heat shock protein Hsp20  35.37 
 
 
161 aa  100  8e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  34.46 
 
 
147 aa  97.4  5e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3765  heat shock protein Hsp20  36.36 
 
 
143 aa  97.4  6e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  40.85 
 
 
147 aa  95.5  2e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  34.42 
 
 
149 aa  94.7  4e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0936  heat shock protein Hsp20  35.81 
 
 
155 aa  93.6  8e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.172536  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  39.44 
 
 
147 aa  92.8  1e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1370  small heat shock protein  38.62 
 
 
144 aa  91.7  3e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0982961  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4669  heat shock protein Hsp20  32.65 
 
 
147 aa  89  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0160  heat shock protein Hsp20  37.61 
 
 
147 aa  87.8  5e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.248861  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4352  heat shock protein Hsp20  36.11 
 
 
145 aa  86.7  9e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.735936  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4499  heat shock protein Hsp20  36.3 
 
 
145 aa  86.7  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.100268 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4507  heat shock protein Hsp20  35.42 
 
 
145 aa  85.5  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4488  heat shock protein Hsp20  35.42 
 
 
145 aa  85.1  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  29.45 
 
 
146 aa  84.7  4e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  29.45 
 
 
146 aa  84.7  4e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1543  heat shock protein Hsp20  40.78 
 
 
146 aa  84.3  6e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000494204  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  30.41 
 
 
147 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2063  heat shock protein Hsp20  35.11 
 
 
155 aa  82.8  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.21571  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1824  heat shock protein Hsp20  37.82 
 
 
146 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0843989  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4462  heat shock protein Hsp20  40.18 
 
 
132 aa  82  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  33.56 
 
 
148 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3448  heat shock protein Hsp20  32.64 
 
 
142 aa  82.8  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2957  HSP20 family protein  35.37 
 
 
143 aa  82  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0357  Hsp20-like molecular chaperone  37.39 
 
 
148 aa  81.6  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3076  heat shock protein Hsp20  31.94 
 
 
148 aa  81.3  0.000000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3386  heat shock protein Hsp20  41.75 
 
 
147 aa  81.3  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1983  heat shock protein Hsp20  35.57 
 
 
153 aa  81.3  0.000000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00684856  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0891  heat shock protein Hsp20  34.03 
 
 
137 aa  80.9  0.000000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.805469  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1296  heat shock protein Hsp20  40.59 
 
 
143 aa  80.1  0.000000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3903  heat shock protein Hsp20  40.38 
 
 
194 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.534424 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1920  heat shock protein Hsp20  34.93 
 
 
162 aa  79.7  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.143113  normal  0.422548 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0179  heat shock protein Hsp20  29.58 
 
 
149 aa  80.1  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3113  heat shock protein Hsp20  37.61 
 
 
142 aa  79.7  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.800815  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4859  heat shock protein Hsp20  39.42 
 
 
204 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3905  heat shock protein Hsp20  30.14 
 
 
147 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000984381  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0315  heat shock protein Hsp20  39.09 
 
 
149 aa  79  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1474  heat shock protein Hsp20  35.14 
 
 
151 aa  79  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.242626  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2643  heat shock protein Hsp20  38.18 
 
 
151 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.840862  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0102  heat shock protein Hsp20  37.04 
 
 
142 aa  79.3  0.00000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0609  heat shock protein Hsp20  34.97 
 
 
156 aa  79.3  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.346897  normal  0.0142886 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4157  heat shock protein Hsp20  29.93 
 
 
150 aa  78.6  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4761  heat shock protein Hsp20  30.82 
 
 
149 aa  78.2  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.735655  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4467  heat shock protein Hsp20  30.82 
 
 
149 aa  78.2  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.156372 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2704  heat shock protein Hsp20  33.1 
 
 
145 aa  78.6  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.923873  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1743  heat shock protein Hsp20  39.81 
 
 
132 aa  78.6  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.174126  hitchhiker  0.00103153 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0610  heat shock protein Hsp20  40.82 
 
 
136 aa  78.6  0.00000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.335952  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4380  heat shock protein Hsp20  30.82 
 
 
149 aa  78.2  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.642417  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2522  heat shock protein Hsp20  35.29 
 
 
150 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1127  heat shock protein Hsp20  34.01 
 
 
142 aa  78.2  0.00000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6388  heat shock protein Hsp20  34.04 
 
 
146 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0687951 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0735  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
145 aa  77.8  0.00000000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000037192  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0403  heat shock protein Hsp20  34.03 
 
 
138 aa  77.8  0.00000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1343  HSP20 family protein  33.09 
 
 
135 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5262  heat shock protein Hsp20  36.29 
 
 
146 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.100267 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4198  heat shock protein Hsp20  38.89 
 
 
152 aa  77.4  0.00000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1204  HSP20 family protein  32.52 
 
 
146 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14610  heat shock protein Hsp20  32.62 
 
 
143 aa  77.4  0.00000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000610495  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3428  HSP20 family protein  32.52 
 
 
146 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000574786  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0343  HSP20 family protein  32.52 
 
 
146 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.439722  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0719  heat shock protein Hsp20  35.25 
 
 
137 aa  77  0.00000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00433386  normal  0.504335 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3424  HSP20 family protein  32.52 
 
 
146 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2615  HSP20 family protein  32.52 
 
 
146 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.696707  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3389  HSP20 family protein  32.52 
 
 
146 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.134829  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0460  heat shock protein Hsp20  35 
 
 
155 aa  77  0.00000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1320  Hsp20/alpha crystallin family protein  32.21 
 
 
151 aa  76.6  0.00000000000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1262  small heat shock protein  32.21 
 
 
151 aa  76.6  0.00000000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.753574  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0593  heat shock protein Hsp20  39.64 
 
 
191 aa  76.3  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.95349  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1731  HSP20 family protein  38 
 
 
126 aa  76.3  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.13098  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3573  heat shock protein Hsp20  30.99 
 
 
144 aa  76.3  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6091  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
146 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4943  heat shock protein Hsp20  31.29 
 
 
149 aa  76.3  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0508199 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1869  putative small heat shock protein  34.01 
 
 
142 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.309197  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16210  heat shock protein Hsp20  31.21 
 
 
163 aa  75.5  0.0000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.221164  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2459  heat shock protein Hsp20  37.61 
 
 
142 aa  75.5  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.134169  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0369  HSP20 family protein  36.54 
 
 
153 aa  75.9  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.93231e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2505  heat shock protein Hsp20  38.79 
 
 
138 aa  75.9  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.239492  normal  0.0462479 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4461  heat shock protein Hsp20  36.61 
 
 
163 aa  75.5  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3038  heat shock protein Hsp20  32.64 
 
 
140 aa  75.9  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.86939 
 
 
-
 
NC_011771  BCAH820_C0008  Hsp  29.66 
 
 
146 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0629  heat shock protein Hsp20  31.47 
 
 
189 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.185609 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0037  heat shock protein Hsp20  31.85 
 
 
142 aa  75.1  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1805  heat shock protein Hsp20  30.61 
 
 
149 aa  75.5  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.642811  normal  0.803886 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0793  heat shock protein Hsp20  33.04 
 
 
136 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.515708  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2365  heat shock protein Hsp20  36.07 
 
 
135 aa  75.1  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.181504  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1171  heat shock protein Hsp20  32.17 
 
 
189 aa  75.5  0.0000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.726376  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0623  heat shock protein Hsp20  34.67 
 
 
152 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.844177  normal  0.400233 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2320  heat shock protein Hsp20  33.79 
 
 
149 aa  75.1  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0182  heat shock protein Hsp20  39.81 
 
 
149 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0138231  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1528  heat shock protein Hsp20  32.17 
 
 
153 aa  74.7  0.0000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00309172  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3612  hypothetical protein  36.79 
 
 
177 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3412  small HspC2 heat shock protein  32.17 
 
 
189 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.260583  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3600  heat shock protein Hsp20  30.82 
 
 
165 aa  74.3  0.0000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.484768  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4528  heat shock protein Hsp20  41.28 
 
 
181 aa  74.3  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.550609  normal  0.0462291 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>