More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1343 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_1343  HSP20 family protein  100 
 
 
135 aa  274  4e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0793  heat shock protein Hsp20  58.21 
 
 
136 aa  167  5e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.515708  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2958  heat shock protein Hsp20  57.46 
 
 
142 aa  164  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.206888 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0719  heat shock protein Hsp20  54.48 
 
 
137 aa  149  8.999999999999999e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00433386  normal  0.504335 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3092  HSP20 family protein  47.41 
 
 
138 aa  126  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2648  heat shock protein Hsp20  44.78 
 
 
137 aa  124  5e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3460  heat shock protein Hsp20  44.78 
 
 
137 aa  122  1e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.895888  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2303  heat shock protein Hsp20  46.04 
 
 
137 aa  118  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.270736 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4342  heat shock protein Hsp20  35.51 
 
 
147 aa  93.2  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.204531 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0197  heat shock protein Hsp20  34.78 
 
 
147 aa  91.3  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0542117 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2366  heat shock protein Hsp20  35.34 
 
 
151 aa  90.1  9e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.550987  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0357  Hsp20-like molecular chaperone  41.58 
 
 
148 aa  87  7e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1076  heat shock protein Hsp20  34.56 
 
 
148 aa  84.7  3e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.713568  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0936  heat shock protein Hsp20  38.28 
 
 
155 aa  84.3  6e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.172536  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1742  heat shock protein Hsp20  30.83 
 
 
152 aa  81.6  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.314982  hitchhiker  0.000988198 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2857  heat shock protein Hsp20  33.09 
 
 
158 aa  80.1  0.000000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.274432  normal  0.0879388 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
147 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  32.85 
 
 
147 aa  79  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1929  heat shock protein Hsp20  36.43 
 
 
149 aa  78.6  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.638493  normal  0.0128011 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1171  heat shock protein Hsp20  32.17 
 
 
189 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.726376  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1323  heat shock protein Hsp20  36.17 
 
 
148 aa  78.2  0.00000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0601396  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0182  heat shock protein Hsp20  37.62 
 
 
149 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0138231  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0315  heat shock protein Hsp20  41.58 
 
 
149 aa  77.8  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  34.92 
 
 
150 aa  77.4  0.00000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4119  heat shock protein Hsp20  33.09 
 
 
149 aa  77.8  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00303961 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2287  heat shock protein Hsp20  32.17 
 
 
189 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3412  small HspC2 heat shock protein  32.17 
 
 
189 aa  77  0.00000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.260583  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2410  HSP20 family protein  38.61 
 
 
149 aa  77  0.00000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.731962  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0629  heat shock protein Hsp20  31.47 
 
 
189 aa  77  0.00000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.185609 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3905  heat shock protein Hsp20  31.39 
 
 
147 aa  76.6  0.00000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000984381  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0454  heat shock protein Hsp20  34.33 
 
 
144 aa  76.6  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2643  heat shock protein Hsp20  36.52 
 
 
151 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.840862  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4859  heat shock protein Hsp20  35.42 
 
 
204 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3394  heat shock protein Hsp20  32.39 
 
 
189 aa  75.9  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219016  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0463  heat shock protein Hsp20  34.53 
 
 
166 aa  75.9  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2957  HSP20 family protein  32.84 
 
 
143 aa  75.5  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0200  putative small HEAT shock protein  36.07 
 
 
140 aa  75.5  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.32202 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  33.79 
 
 
149 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4382  heat shock protein Hsp20  35.25 
 
 
140 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3665  heat shock protein Hsp20  39 
 
 
148 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0142367  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4514  heat shock protein Hsp20  35.25 
 
 
140 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.165488  normal  0.480818 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2532  HSP20 family protein  33.33 
 
 
144 aa  73.9  0.0000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0865  heat shock protein Hsp20  34.45 
 
 
134 aa  74.3  0.0000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.303654  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4230  heat shock protein Hsp20  35.29 
 
 
105 aa  73.9  0.0000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3765  heat shock protein Hsp20  33.08 
 
 
143 aa  73.9  0.0000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1762  heat shock protein Hsp20  32.37 
 
 
144 aa  74.3  0.0000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1528  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
153 aa  73.9  0.0000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00309172  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1262  small heat shock protein  30.22 
 
 
151 aa  73.9  0.0000000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.753574  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1320  Hsp20/alpha crystallin family protein  30.22 
 
 
151 aa  73.9  0.0000000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2320  heat shock protein Hsp20  32.31 
 
 
149 aa  73.6  0.0000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3773  heat shock protein Hsp20  39 
 
 
148 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1214  molecular chaperone (small heat shock protein)  40.4 
 
 
260 aa  72.4  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.318766  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1824  heat shock protein Hsp20  31.65 
 
 
146 aa  72.4  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0843989  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3386  heat shock protein Hsp20  30.08 
 
 
147 aa  72  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0762  heat shock protein Hsp20  33.61 
 
 
134 aa  72.4  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4943  heat shock protein Hsp20  35.64 
 
 
149 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0508199 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  31.03 
 
 
148 aa  71.6  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0125  heat shock protein Hsp20  32.26 
 
 
139 aa  71.6  0.000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.369397  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4380  heat shock protein Hsp20  33.66 
 
 
149 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.642417  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4467  heat shock protein Hsp20  33.66 
 
 
149 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.156372 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4761  heat shock protein Hsp20  33.66 
 
 
149 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.735655  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0610  heat shock protein Hsp20  36.63 
 
 
136 aa  71.6  0.000000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.335952  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0838  heat shock protein Hsp20  33.64 
 
 
162 aa  71.2  0.000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16210  heat shock protein Hsp20  29.23 
 
 
163 aa  70.9  0.000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.221164  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2522  heat shock protein Hsp20  36.51 
 
 
150 aa  71.2  0.000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2063  heat shock protein Hsp20  32.81 
 
 
155 aa  70.9  0.000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.21571  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1429  heat shock protein Hsp20  28.99 
 
 
169 aa  70.9  0.000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3314  HSP20 family protein  34.07 
 
 
151 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.284188 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1805  heat shock protein Hsp20  32.67 
 
 
149 aa  70.5  0.000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.642811  normal  0.803886 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2188  heat shock protein Hsp20  30.56 
 
 
156 aa  69.7  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.345525  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6221  heat shock protein Hsp20  40.59 
 
 
151 aa  69.7  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2860  heat shock protein Hsp20  32.14 
 
 
184 aa  69.7  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793853  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0160  heat shock protein Hsp20  38 
 
 
147 aa  69.7  0.00000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.248861  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1706  heat shock protein Hsp20  35.07 
 
 
132 aa  69.3  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00808314  hitchhiker  0.000432661 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1149  heat shock protein Hsp20  35.29 
 
 
140 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1219  heat shock protein Hsp20  35.29 
 
 
140 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1230  heat shock protein Hsp20  26.67 
 
 
164 aa  68.9  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0622  HSP20 family protein  34.33 
 
 
132 aa  69.3  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1892  HSP20 family protein  34.11 
 
 
132 aa  68.9  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.684879  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4352  heat shock protein Hsp20  31.34 
 
 
145 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.735936  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4507  heat shock protein Hsp20  32.35 
 
 
145 aa  68.2  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1917  heat shock protein Hsp20  27.48 
 
 
156 aa  68.2  0.00000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86534  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4488  heat shock protein Hsp20  31.62 
 
 
145 aa  67.8  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3659  heat shock protein Hsp20  32.77 
 
 
158 aa  67.4  0.00000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.701015  normal  0.191586 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2635  heat shock protein Hsp20  28.36 
 
 
195 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000662159  normal  0.965311 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1366  heat shock protein Hsp20  31.75 
 
 
176 aa  67.4  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.74874  normal  0.190619 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3076  heat shock protein Hsp20  33.98 
 
 
148 aa  67.4  0.00000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1010  heat shock protein Hsp20  29.25 
 
 
153 aa  67.4  0.00000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00224234  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0593  heat shock protein Hsp20  37.25 
 
 
191 aa  67  0.00000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.95349  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2657  heat shock protein Hsp20  32.82 
 
 
155 aa  67.4  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.498697  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0383  heat shock protein Hsp20  28.47 
 
 
158 aa  67  0.00000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14610  heat shock protein Hsp20  33.06 
 
 
143 aa  67  0.00000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000610495  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3234  HSP20 family protein  35.24 
 
 
231 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1732  HSP20 family protein  37.5 
 
 
167 aa  66.6  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.371108  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4499  heat shock protein Hsp20  30.37 
 
 
145 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.100268 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2460  heat shock protein Hsp20  35.24 
 
 
186 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0031555  normal  0.623789 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3903  heat shock protein Hsp20  35.85 
 
 
194 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.534424 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0143  heat shock protein Hsp20  34.62 
 
 
156 aa  65.9  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3724  heat shock protein Hsp20  32.06 
 
 
185 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3680  heat shock protein Hsp20  32.06 
 
 
185 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.626967 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>