More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2648 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2648  heat shock protein Hsp20  100 
 
 		 137 aa  273  8e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2303  heat shock protein Hsp20  71.53 
 
 		 137 aa  202  1e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.270736 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3092  HSP20 family protein  62.32 
 
 		 138 aa  177  4.999999999999999e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0719  heat shock protein Hsp20  46.32 
 
 		 137 aa  138  1.9999999999999998e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00433386  normal  0.504335 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2958  heat shock protein Hsp20  42.34 
 
 		 142 aa  127  6e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.206888 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3460  heat shock protein Hsp20  41.61 
 
 		 137 aa  124  4.0000000000000003e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.895888  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1343  HSP20 family protein  44.78 
 
 		 135 aa  124  5e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0793  heat shock protein Hsp20  40.74 
 
 		 136 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.515708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1076  heat shock protein Hsp20  38.24 
 
 		 148 aa  88.6  3e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.713568  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  31.29 
 
 		 147 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1429  heat shock protein Hsp20  34.81 
 
 		 169 aa  77.8  0.00000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3905  heat shock protein Hsp20  34.06 
 
 		 147 aa  77  0.00000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000984381  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1742  heat shock protein Hsp20  32.06 
 
 		 152 aa  75.1  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.314982  hitchhiker  0.000988198 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0357  Hsp20-like molecular chaperone  37.39 
 
 		 148 aa  74.3  0.0000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3665  heat shock protein Hsp20  37.1 
 
 		 148 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0142367  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  33.96 
 
 		 147 aa  73.9  0.0000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2366  heat shock protein Hsp20  33.58 
 
 		 151 aa  73.2  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.550987  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3773  heat shock protein Hsp20  35.85 
 
 		 148 aa  70.5  0.000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1929  heat shock protein Hsp20  38.24 
 
 		 149 aa  70.1  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.638493  normal  0.0128011 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3314  HSP20 family protein  34.58 
 
 		 151 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.284188 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4119  heat shock protein Hsp20  37.25 
 
 		 149 aa  69.3  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00303961 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1573  heat shock protein Hsp20  31.9 
 
 		 173 aa  68.2  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00130938  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2410  HSP20 family protein  35.51 
 
 		 149 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.731962  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0182  heat shock protein Hsp20  34.29 
 
 		 149 aa  67.8  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0138231  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0610  heat shock protein Hsp20  33.62 
 
 		 136 aa  67.8  0.00000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.335952  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5262  heat shock protein Hsp20  31.39 
 
 		 146 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.100267 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4766  heat shock protein Hsp20  31.65 
 
 		 163 aa  67.4  0.00000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000408851  hitchhiker  0.00874264 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  32.08 
 
 		 149 aa  67  0.00000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2580  putative small heat shock protein, Hsp20-related  30.88 
 
 		 145 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1631  heat shock protein Hsp20  37.76 
 
 		 145 aa  66.6  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0197  heat shock protein Hsp20  36.7 
 
 		 147 aa  66.2  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0542117 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1730  HSP20 family protein  30.66 
 
 		 149 aa  65.5  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.34799  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4342  heat shock protein Hsp20  36.89 
 
 		 147 aa  65.9  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.204531 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3076  heat shock protein Hsp20  33.96 
 
 		 148 aa  66.2  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3078  heat shock protein Hsp20  33.91 
 
 		 145 aa  65.5  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000700712  normal  0.0754711 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1892  HSP20 family protein  30.95 
 
 		 132 aa  65.1  0.0000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.684879  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4118  heat shock protein Hsp20  31.85 
 
 		 172 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.513744 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1010  heat shock protein Hsp20  31.76 
 
 		 153 aa  64.3  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00224234  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6091  heat shock protein Hsp20  29.2 
 
 		 146 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2055  heat shock protein Hsp20  35.29 
 
 		 146 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2635  heat shock protein Hsp20  31.43 
 
 		 195 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000662159  normal  0.965311 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2522  heat shock protein Hsp20  29.69 
 
 		 150 aa  63.9  0.0000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2365  heat shock protein Hsp20  37.27 
 
 		 135 aa  63.9  0.0000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.181504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6388  heat shock protein Hsp20  29.2 
 
 		 146 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0687951 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0982  HSP20 family protein  35.16 
 
 		 176 aa  63.2  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3430  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 		 147 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.240603  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3084  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 		 147 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2643  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 		 151 aa  62.8  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.840862  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2731  heat shock protein Hsp20  38.54 
 
 		 166 aa  63.2  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0315  heat shock protein Hsp20  32.71 
 
 		 149 aa  63.2  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2809  HSP20 family protein  32.85 
 
 		 146 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0002171  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1725  heat shock protein Hsp20  31.62 
 
 		 142 aa  62.8  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2612  Hsp20 family heat-shock protein  35.51 
 
 		 146 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000112353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4541  Hsp20 family heat-shock protein  35.51 
 
 		 146 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000390119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  30.22 
 
 		 147 aa  63.2  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  32.08 
 
 		 150 aa  62.8  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1235  heat shock protein Hsp20  34.56 
 
 		 146 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.346981  normal  0.252455 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  29.5 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5733  heat shock protein Hsp20  29.41 
 
 		 146 aa  62  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.384471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1323  heat shock protein Hsp20  36.36 
 
 		 148 aa  62.4  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0601396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4650  heat shock protein Hsp20  37.14 
 
 		 145 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.73287  normal  0.761162 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1115  heat shock protein Hsp20  32.28 
 
 		 162 aa  62  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0741755  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0369  HSP20 family protein  33.33 
 
 		 153 aa  62.4  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.93231e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4406  heat shock protein Hsp20  32.12 
 
 		 146 aa  62  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3765  heat shock protein Hsp20  32.43 
 
 		 143 aa  62.4  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0782  heat shock protein Hsp20  34.56 
 
 		 146 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6419  heat shock protein Hsp20  37.04 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6654  heat shock protein Hsp20  37.04 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.344847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1263  heat shock protein Hsp20  34.56 
 
 		 146 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.095432  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4635  heat shock protein Hsp20  34.29 
 
 		 169 aa  61.6  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0362  heat shock protein Hsp20  28.97 
 
 		 144 aa  61.6  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.025472  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1704  heat shock protein Hsp20  35.48 
 
 		 140 aa  61.6  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2063  heat shock protein Hsp20  28.99 
 
 		 155 aa  61.6  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.21571  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4128  heat shock protein Hsp20  31.67 
 
 		 154 aa  61.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.226976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0580  heat shock protein Hsp20  30.17 
 
 		 145 aa  61.2  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000199173  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0463  heat shock protein Hsp20  33.01 
 
 		 166 aa  61.6  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6252  heat shock protein Hsp20  36.11 
 
 		 147 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0400474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0672  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 		 159 aa  61.2  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000109595  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0865  heat shock protein Hsp20  34.62 
 
 		 134 aa  61.2  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.303654  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1732  HSP20 family protein  35.92 
 
 		 167 aa  60.8  0.000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.371108  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2730  heat shock protein Hsp20  35.24 
 
 		 148 aa  60.8  0.000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1170  heat shock protein Hsp20  35.77 
 
 		 170 aa  61.2  0.000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1142  heat shock protein Hsp20  31.65 
 
 		 146 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2957  HSP20 family protein  30.66 
 
 		 143 aa  60.8  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4463  heat shock protein Hsp20  33.03 
 
 		 141 aa  60.8  0.000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0936  heat shock protein Hsp20  33.01 
 
 		 155 aa  60.8  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.172536  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1127  heat shock protein Hsp20  30.15 
 
 		 142 aa  60.5  0.000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0762  heat shock protein Hsp20  31.85 
 
 		 134 aa  60.5  0.000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2320  heat shock protein Hsp20  30.53 
 
 		 149 aa  60.5  0.000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0343  heat shock protein Hsp20  28.28 
 
 		 144 aa  60.5  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.90555e-28 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3256  heat shock protein Hsp20  32.14 
 
 		 153 aa  60.5  0.000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3063  heat shock protein Hsp20  30.67 
 
 		 158 aa  60.5  0.000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.89361 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0454  heat shock protein Hsp20  33.98 
 
 		 144 aa  60.1  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3903  heat shock protein Hsp20  34.29 
 
 		 194 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.534424 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0125  heat shock protein Hsp20  30.77 
 
 		 139 aa  59.7  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.369397  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0838  heat shock protein Hsp20  29.09 
 
 		 162 aa  60.1  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4499  heat shock protein Hsp20  29.41 
 
 		 145 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.100268 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1154  heat shock protein Hsp20  32.12 
 
 		 146 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.408789 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2074  heat shock protein Hsp20  34.34 
 
 		 173 aa  59.7  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.145284  normal  0.308358 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2860  heat shock protein Hsp20  32.62 
 
 		 184 aa  59.7  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793853  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>