More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_3460 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_3460  heat shock protein Hsp20  100 
 
 
137 aa  280  5.000000000000001e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.895888  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0719  heat shock protein Hsp20  52.59 
 
 
137 aa  160  5.0000000000000005e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00433386  normal  0.504335 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2958  heat shock protein Hsp20  47.45 
 
 
142 aa  138  3e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.206888 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0793  heat shock protein Hsp20  46.32 
 
 
136 aa  127  3e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.515708  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2648  heat shock protein Hsp20  41.61 
 
 
137 aa  124  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1343  HSP20 family protein  44.78 
 
 
135 aa  122  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2303  heat shock protein Hsp20  45.52 
 
 
137 aa  120  5e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.270736 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3092  HSP20 family protein  41.18 
 
 
138 aa  118  3e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1742  heat shock protein Hsp20  39.29 
 
 
152 aa  89.4  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.314982  hitchhiker  0.000988198 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  36.5 
 
 
147 aa  86.7  1e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  35.77 
 
 
147 aa  85.1  3e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1076  heat shock protein Hsp20  38.17 
 
 
148 aa  85.1  3e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.713568  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1429  heat shock protein Hsp20  32.14 
 
 
169 aa  85.1  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  42.45 
 
 
150 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1127  heat shock protein Hsp20  35.77 
 
 
142 aa  82  0.000000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2860  heat shock protein Hsp20  35.94 
 
 
184 aa  82.8  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793853  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1631  heat shock protein Hsp20  40.59 
 
 
145 aa  80.9  0.000000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2940  heat shock protein Hsp20  37.3 
 
 
168 aa  80.9  0.000000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  32.12 
 
 
147 aa  80.5  0.000000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0197  heat shock protein Hsp20  37.5 
 
 
147 aa  80.1  0.000000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0542117 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0454  heat shock protein Hsp20  32.35 
 
 
144 aa  80.1  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4342  heat shock protein Hsp20  37.04 
 
 
147 aa  79.7  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.204531 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2802  heat shock protein Hsp20  35.07 
 
 
167 aa  79.3  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.20157 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0383  heat shock protein Hsp20  35.71 
 
 
166 aa  79.7  0.00000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.170778  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2366  heat shock protein Hsp20  30.15 
 
 
151 aa  79.3  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.550987  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3241  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
166 aa  79  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.406826  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  30.22 
 
 
147 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3903  heat shock protein Hsp20  33.08 
 
 
194 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.534424 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4859  heat shock protein Hsp20  33.08 
 
 
204 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011771  BCAH820_C0008  Hsp  36.03 
 
 
146 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3146  heat shock protein Hsp20  33.08 
 
 
167 aa  77.4  0.00000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.754957 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0037  heat shock protein Hsp20  37.21 
 
 
142 aa  77  0.00000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4118  heat shock protein Hsp20  34.88 
 
 
172 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.513744 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2212  heat shock protein Hsp20  35.34 
 
 
171 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1573  heat shock protein Hsp20  32.82 
 
 
173 aa  75.5  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00130938  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1917  heat shock protein Hsp20  35.16 
 
 
156 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86534  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3905  heat shock protein Hsp20  35.78 
 
 
147 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000984381  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3234  HSP20 family protein  34.9 
 
 
231 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2460  heat shock protein Hsp20  40.87 
 
 
186 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0031555  normal  0.623789 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4635  heat shock protein Hsp20  31.85 
 
 
169 aa  74.3  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0982  HSP20 family protein  31.76 
 
 
176 aa  74.3  0.0000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4463  heat shock protein Hsp20  30.88 
 
 
141 aa  74.3  0.0000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1559  heat shock protein Hsp20  40 
 
 
133 aa  73.9  0.0000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0277974  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14610  heat shock protein Hsp20  36.36 
 
 
143 aa  74.3  0.0000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000610495  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2462  heat shock protein Hsp20  31.91 
 
 
168 aa  73.9  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0466294  normal  0.178308 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1159  heat shock protein Hsp20  32.03 
 
 
148 aa  72.8  0.000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000413054  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3394  heat shock protein Hsp20  32.61 
 
 
189 aa  73.2  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219016  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1115  heat shock protein Hsp20  34.92 
 
 
162 aa  73.6  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0741755  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0580  heat shock protein Hsp20  35.25 
 
 
145 aa  72.8  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000199173  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0629  heat shock protein Hsp20  31.88 
 
 
189 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.185609 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2355  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
165 aa  72  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20966  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0369  HSP20 family protein  37.93 
 
 
153 aa  72.4  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.93231e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1171  heat shock protein Hsp20  31.88 
 
 
189 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.726376  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1010  heat shock protein Hsp20  31.54 
 
 
153 aa  72.4  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00224234  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3076  heat shock protein Hsp20  33.59 
 
 
173 aa  71.6  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2287  heat shock protein Hsp20  36.73 
 
 
189 aa  72  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  37.61 
 
 
149 aa  72  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3582  heat shock protein Hsp20  33.83 
 
 
166 aa  71.6  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2857  heat shock protein Hsp20  34.07 
 
 
158 aa  71.6  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.274432  normal  0.0879388 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2580  putative small heat shock protein, Hsp20-related  33.09 
 
 
145 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0588  heat shock protein, molecular chaperone  36.52 
 
 
141 aa  71.6  0.000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.648467  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1323  heat shock protein Hsp20  32.12 
 
 
148 aa  70.9  0.000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0601396  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5194  heat shock protein Hsp20  32.82 
 
 
169 aa  71.2  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0987038  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2074  heat shock protein Hsp20  32.59 
 
 
173 aa  70.9  0.000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.145284  normal  0.308358 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0672  heat shock protein Hsp20  35.92 
 
 
159 aa  70.9  0.000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000109595  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3667  heat shock protein Hsp20  41.3 
 
 
139 aa  70.5  0.000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1175  heat shock protein Hsp20  34.91 
 
 
185 aa  70.5  0.000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2063  heat shock protein Hsp20  28.78 
 
 
155 aa  69.7  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.21571  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4819  heat shock protein Hsp20  37.5 
 
 
218 aa  69.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3412  small HspC2 heat shock protein  31.16 
 
 
189 aa  69.3  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.260583  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0188  heat shock protein Hsp20  37.8 
 
 
150 aa  69.7  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2384  heat shock protein Hsp20  30 
 
 
164 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3076  heat shock protein Hsp20  30.71 
 
 
148 aa  69.7  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1730  HSP20 family protein  29.41 
 
 
149 aa  68.9  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.34799  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3680  heat shock protein Hsp20  32.79 
 
 
185 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.626967 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2635  heat shock protein Hsp20  35.43 
 
 
195 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000662159  normal  0.965311 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3724  heat shock protein Hsp20  32.79 
 
 
185 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2522  heat shock protein Hsp20  29.03 
 
 
150 aa  68.6  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5274  heat shock protein Hsp20  33.59 
 
 
159 aa  68.2  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1929  heat shock protein Hsp20  35.92 
 
 
149 aa  68.2  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.638493  normal  0.0128011 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1509  heat shock protein Hsp20  33.59 
 
 
148 aa  67.8  0.00000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000196437  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3078  heat shock protein Hsp20  33.58 
 
 
145 aa  67.8  0.00000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000700712  normal  0.0754711 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2678  HSP20 family protein  39.58 
 
 
151 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1762  heat shock protein Hsp20  31.39 
 
 
144 aa  67.4  0.00000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2320  heat shock protein Hsp20  31.97 
 
 
149 aa  67  0.00000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0936  heat shock protein Hsp20  32.26 
 
 
155 aa  67  0.00000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.172536  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2505  heat shock protein Hsp20  35.24 
 
 
138 aa  67  0.00000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.239492  normal  0.0462479 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2643  heat shock protein Hsp20  29.52 
 
 
151 aa  67  0.00000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.840862  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1967  heat shock protein Hsp20  35.77 
 
 
178 aa  66.6  0.00000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4499  heat shock protein Hsp20  35.92 
 
 
145 aa  67  0.00000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.100268 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2657  heat shock protein Hsp20  32.56 
 
 
155 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.498697  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1354  heat shock protein Hsp20  32.61 
 
 
134 aa  66.6  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0222398  normal  0.226114 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0445  heat shock protein Hsp20  34.58 
 
 
150 aa  66.2  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4488  heat shock protein Hsp20  37.86 
 
 
145 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4128  heat shock protein Hsp20  27.07 
 
 
154 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.226976  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4119  heat shock protein Hsp20  36.63 
 
 
149 aa  66.6  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00303961 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0865  heat shock protein Hsp20  30.3 
 
 
134 aa  65.5  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.303654  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0463  heat shock protein Hsp20  34.09 
 
 
166 aa  65.9  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4507  heat shock protein Hsp20  37.86 
 
 
145 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2365  heat shock protein Hsp20  34.95 
 
 
135 aa  65.5  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.181504  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>