More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1573 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_1573  heat shock protein Hsp20  100 
 
 
173 aa  350  7e-96  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00130938  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1429  heat shock protein Hsp20  44.89 
 
 
169 aa  145  4.0000000000000006e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0982  HSP20 family protein  48.34 
 
 
176 aa  141  4e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2635  heat shock protein Hsp20  38.6 
 
 
195 aa  103  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000662159  normal  0.965311 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1648  heat shock protein, Hsp20 family  38.51 
 
 
148 aa  99.4  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.715277  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1347  heat shock protein Hsp20  38.51 
 
 
148 aa  99.4  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.452932  normal  0.819182 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2250  heat shock protein Hsp20  38.93 
 
 
178 aa  97.4  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0369  HSP20 family protein  38.35 
 
 
153 aa  96.7  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.93231e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1967  heat shock protein Hsp20  37.58 
 
 
178 aa  94.4  7e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0037  heat shock protein Hsp20  38.78 
 
 
142 aa  93.6  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  38.57 
 
 
147 aa  92.8  2e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  37.06 
 
 
150 aa  92.4  3e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0383  heat shock protein Hsp20  36.55 
 
 
158 aa  91.7  5e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2678  HSP20 family protein  36.31 
 
 
151 aa  90.9  9e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0580  heat shock protein Hsp20  37.5 
 
 
145 aa  90.9  9e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000199173  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1076  heat shock protein Hsp20  36.17 
 
 
148 aa  90.1  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.713568  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  37.86 
 
 
147 aa  89.7  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4819  heat shock protein Hsp20  35.25 
 
 
218 aa  88.6  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2276  heat shock protein Hsp20  31.36 
 
 
175 aa  88.6  4e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1159  heat shock protein Hsp20  38.19 
 
 
148 aa  88.2  5e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000413054  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1320  Hsp20/alpha crystallin family protein  35.17 
 
 
151 aa  87.4  9e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1262  small heat shock protein  35.17 
 
 
151 aa  87.4  9e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.753574  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0463  heat shock protein Hsp20  36.43 
 
 
166 aa  85.5  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  40.38 
 
 
147 aa  84.7  7e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2366  heat shock protein Hsp20  38.1 
 
 
151 aa  84  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.550987  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0445  heat shock protein Hsp20  41.67 
 
 
150 aa  83.2  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1559  heat shock protein Hsp20  44.09 
 
 
133 aa  82.8  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0277974  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4128  heat shock protein Hsp20  38.1 
 
 
154 aa  82.8  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.226976  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4461  heat shock protein Hsp20  34.78 
 
 
163 aa  82  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  30.66 
 
 
146 aa  82.4  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1018  heat shock protein Hsp20  33.14 
 
 
177 aa  82  0.000000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.683731  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3612  hypothetical protein  37.27 
 
 
177 aa  82  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  30.66 
 
 
146 aa  82.4  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2657  heat shock protein Hsp20  35 
 
 
155 aa  82.4  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.498697  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_825  HSP20/alpha crystallin  31.47 
 
 
162 aa  82  0.000000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2505  heat shock protein Hsp20  35.34 
 
 
138 aa  81.6  0.000000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.239492  normal  0.0462479 
 
 
-
 
NC_002936  DET0954  Hsp20/alpha crystallin family protein  32.17 
 
 
162 aa  81.3  0.000000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.154946  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0838  heat shock protein Hsp20  31.47 
 
 
162 aa  80.9  0.000000000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3080  heat shock protein Hsp20  33.75 
 
 
230 aa  80.9  0.000000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3078  heat shock protein Hsp20  34.81 
 
 
145 aa  80.9  0.000000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000700712  normal  0.0754711 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6439  heat shock protein Hsp20  38.46 
 
 
153 aa  80.5  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.024706  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  37.38 
 
 
147 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2086  heat shock protein, Hsp20 family  38.89 
 
 
145 aa  80.5  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0182  heat shock protein Hsp20  34.93 
 
 
149 aa  80.5  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0138231  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2643  heat shock protein Hsp20  37.14 
 
 
151 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.840862  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1743  heat shock protein Hsp20  38.89 
 
 
145 aa  80.5  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.49982  normal  0.0110244 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0735  heat shock protein Hsp20  36.73 
 
 
145 aa  80.1  0.00000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000037192  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25770  heat shock Hsp20 protein  30.36 
 
 
198 aa  79.7  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3905  heat shock protein Hsp20  37.38 
 
 
147 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000984381  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  39.25 
 
 
149 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1010  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
153 aa  79.7  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00224234  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2863  heat shock protein Hsp20  36.13 
 
 
167 aa  79  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.203152  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1869  putative small heat shock protein  34.93 
 
 
142 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.309197  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1631  heat shock protein Hsp20  39.6 
 
 
145 aa  78.6  0.00000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1127  heat shock protein Hsp20  31.25 
 
 
142 aa  78.2  0.00000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1110  heat shock protein Hsp20  34.93 
 
 
145 aa  77.8  0.00000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.339847  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2860  heat shock protein Hsp20  33.59 
 
 
184 aa  77.8  0.00000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793853  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3788  heat shock protein Hsp20  31.25 
 
 
144 aa  77.4  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  30.22 
 
 
148 aa  77.4  0.00000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4766  heat shock protein Hsp20  42.31 
 
 
163 aa  77.4  0.00000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000408851  hitchhiker  0.00874264 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4528  heat shock protein Hsp20  35.97 
 
 
181 aa  76.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.550609  normal  0.0462291 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4395  heat shock protein Hsp20  35.97 
 
 
181 aa  76.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.481666  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2320  heat shock protein Hsp20  33.59 
 
 
149 aa  76.6  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3527  putative HspC2 heat shock protein  36.69 
 
 
173 aa  75.9  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0868338  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2559  hypothetical protein  32.79 
 
 
164 aa  75.5  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2414  hypothetical protein  32.79 
 
 
164 aa  75.5  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2730  heat shock protein Hsp20  35.24 
 
 
148 aa  75.9  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2022  heat shock protein Hsp20  36.09 
 
 
141 aa  75.9  0.0000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2460  heat shock protein Hsp20  32.88 
 
 
186 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0031555  normal  0.623789 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3582  heat shock protein Hsp20  30 
 
 
166 aa  75.9  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3061  heat shock protein Hsp20  39.81 
 
 
158 aa  75.9  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.301699 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3460  heat shock protein Hsp20  32.82 
 
 
137 aa  75.5  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.895888  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1543  heat shock protein Hsp20  32.19 
 
 
146 aa  75.5  0.0000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000494204  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0200  heat shock protein Hsp20  32.68 
 
 
176 aa  75.1  0.0000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.377048  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2410  HSP20 family protein  33.33 
 
 
149 aa  75.5  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.731962  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2035  stress response protein  33.33 
 
 
144 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2212  heat shock protein Hsp20  36.3 
 
 
171 aa  75.1  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2325  stress response protein  33.33 
 
 
141 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.908249  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0296  heat shock protein Hsp20  34.38 
 
 
156 aa  75.1  0.0000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1059  stress response protein  33.33 
 
 
144 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1345  stress response protein  33.33 
 
 
144 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.260788  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1929  heat shock protein Hsp20  31.08 
 
 
149 aa  74.7  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.638493  normal  0.0128011 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3903  heat shock protein Hsp20  32.47 
 
 
194 aa  74.7  0.0000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.534424 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2578  putative heat shock protein  36.54 
 
 
185 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3241  heat shock protein Hsp20  31.72 
 
 
166 aa  75.1  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.406826  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0539  heat shock protein Hsp20  36.61 
 
 
161 aa  74.7  0.0000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3234  HSP20 family protein  32.88 
 
 
231 aa  74.7  0.0000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2522  heat shock protein Hsp20  33.01 
 
 
150 aa  74.7  0.0000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0391  heat shock protein Hsp20  41.3 
 
 
143 aa  74.7  0.0000000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000478859  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14610  heat shock protein Hsp20  34.95 
 
 
143 aa  74.7  0.0000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000610495  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0188  heat shock protein Hsp20  35.25 
 
 
150 aa  74.7  0.0000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0672  heat shock protein Hsp20  31.62 
 
 
159 aa  74.3  0.0000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000109595  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1292  heat shock protein Hsp20  32.86 
 
 
170 aa  74.3  0.0000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0518729  normal  0.504399 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3219  heat shock protein  32.56 
 
 
144 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2122  heat shock protein Hsp20  34.62 
 
 
180 aa  73.6  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.451471 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4819  heat shock protein Hsp20  34.62 
 
 
146 aa  73.6  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.414421 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1432  HSP20/alpha crystallin family protein  32.56 
 
 
144 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.614633  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4859  heat shock protein Hsp20  30.43 
 
 
204 aa  73.9  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2401  heat shock protein Hsp20  32.43 
 
 
163 aa  73.9  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000662378  hitchhiker  0.00157329 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0719  heat shock protein Hsp20  32.41 
 
 
137 aa  73.6  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00433386  normal  0.504335 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>