More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1323 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_1323  heat shock protein Hsp20  100 
 
 
148 aa  300  4.0000000000000003e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0601396  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1730  HSP20 family protein  48.61 
 
 
149 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.34799  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1974  heat shock protein Hsp20  47.1 
 
 
145 aa  143  8.000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.285071  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4650  heat shock protein Hsp20  52.17 
 
 
145 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.73287  normal  0.761162 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3375  heat shock protein Hsp20  47.83 
 
 
146 aa  139  9.999999999999999e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3084  heat shock protein Hsp20  49.28 
 
 
147 aa  138  3e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3430  heat shock protein Hsp20  49.28 
 
 
147 aa  138  3e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.240603  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2612  Hsp20 family heat-shock protein  50 
 
 
146 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000112353  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4541  Hsp20 family heat-shock protein  50 
 
 
146 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000390119  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6091  heat shock protein Hsp20  48.55 
 
 
146 aa  135  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6388  heat shock protein Hsp20  47.83 
 
 
146 aa  134  5e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0687951 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3314  HSP20 family protein  45.52 
 
 
151 aa  131  3e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.284188 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5733  heat shock protein Hsp20  46.85 
 
 
146 aa  131  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.384471  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5262  heat shock protein Hsp20  48.2 
 
 
146 aa  130  6e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.100267 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2615  HSP20 family protein  48.55 
 
 
146 aa  129  9e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.696707  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3428  HSP20 family protein  48.55 
 
 
146 aa  129  9e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000574786  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1204  HSP20 family protein  48.55 
 
 
146 aa  129  9e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3389  HSP20 family protein  48.55 
 
 
146 aa  129  9e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.134829  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3424  HSP20 family protein  48.55 
 
 
146 aa  129  9e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0343  HSP20 family protein  48.55 
 
 
146 aa  129  9e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.439722  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5150  heat shock protein Hsp20  49.28 
 
 
146 aa  127  4.0000000000000003e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2580  putative small heat shock protein, Hsp20-related  46.9 
 
 
145 aa  127  6e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2398  putative heat shock protein  46.53 
 
 
147 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0850393  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2809  HSP20 family protein  45.45 
 
 
146 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0002171  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1441  HSP20 family protein  46.85 
 
 
145 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3047  HSP20 family protein  46.85 
 
 
145 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1572  HSP20 family protein  46.85 
 
 
215 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.537516  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0530  HSP20 family protein  46.85 
 
 
145 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0624  HSP20 family protein  46.85 
 
 
145 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1472  HSP20 family protein  46.85 
 
 
145 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.287102  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1247  HSP20 family protein  46.85 
 
 
145 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1235  heat shock protein Hsp20  46.26 
 
 
146 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.346981  normal  0.252455 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0782  heat shock protein Hsp20  46.26 
 
 
146 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1263  heat shock protein Hsp20  46.26 
 
 
146 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.095432  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6419  heat shock protein Hsp20  46.43 
 
 
147 aa  121  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6654  heat shock protein Hsp20  46.43 
 
 
147 aa  121  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.344847  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2055  heat shock protein Hsp20  43.54 
 
 
146 aa  120  8e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4406  heat shock protein Hsp20  44.9 
 
 
146 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1142  heat shock protein Hsp20  45.58 
 
 
146 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2042  HSP20 family protein  42.36 
 
 
157 aa  118  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6252  heat shock protein Hsp20  45.71 
 
 
147 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0400474  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1154  heat shock protein Hsp20  44.9 
 
 
146 aa  116  7.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.408789 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2602  Hsp20 family heat-shock protein  52.73 
 
 
118 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0249408  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2410  HSP20 family protein  32.64 
 
 
149 aa  89  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.731962  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1742  heat shock protein Hsp20  36.03 
 
 
152 aa  87.8  4e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.314982  hitchhiker  0.000988198 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3665  heat shock protein Hsp20  31.94 
 
 
148 aa  85.9  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0142367  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0182  heat shock protein Hsp20  31.03 
 
 
149 aa  85.5  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0138231  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3773  heat shock protein Hsp20  31.72 
 
 
148 aa  84.3  5e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3256  heat shock protein Hsp20  32.35 
 
 
153 aa  83.6  9e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4463  heat shock protein Hsp20  33.09 
 
 
141 aa  83.2  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
147 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2366  heat shock protein Hsp20  27.97 
 
 
151 aa  81.6  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.550987  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1365  heat shock protein Hsp20  32.33 
 
 
160 aa  81.3  0.000000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.117276  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1434  low molecular weight heat shock protein  32.33 
 
 
160 aa  81.3  0.000000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2958  heat shock protein Hsp20  34.56 
 
 
142 aa  80.9  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.206888 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0315  heat shock protein Hsp20  33.1 
 
 
149 aa  80.5  0.000000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2957  HSP20 family protein  32.12 
 
 
143 aa  80.1  0.000000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3394  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
189 aa  80.1  0.000000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219016  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02640  low molecular weight heat shock protein  31.58 
 
 
158 aa  79  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1343  HSP20 family protein  36.17 
 
 
135 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1127  heat shock protein Hsp20  30.99 
 
 
142 aa  77.8  0.00000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0125  heat shock protein Hsp20  35.85 
 
 
139 aa  77.8  0.00000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.369397  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0052  heat shock protein Hsp20  34.29 
 
 
151 aa  77.4  0.00000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2532  HSP20 family protein  32.85 
 
 
144 aa  76.6  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  33.96 
 
 
149 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3076  heat shock protein Hsp20  34.29 
 
 
148 aa  76.3  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  32.58 
 
 
150 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1171  heat shock protein Hsp20  32.62 
 
 
189 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.726376  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4943  heat shock protein Hsp20  35.97 
 
 
149 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0508199 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0793  heat shock protein Hsp20  32.86 
 
 
136 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.515708  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2643  heat shock protein Hsp20  33.58 
 
 
151 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.840862  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2287  heat shock protein Hsp20  31.91 
 
 
189 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2384  heat shock protein Hsp20  35.07 
 
 
164 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0629  heat shock protein Hsp20  31.21 
 
 
189 aa  74.7  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.185609 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1115  heat shock protein Hsp20  35.34 
 
 
162 aa  73.9  0.0000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0741755  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2860  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
184 aa  73.9  0.0000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793853  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2188  heat shock protein Hsp20  31.82 
 
 
156 aa  73.6  0.0000000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.345525  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3412  small HspC2 heat shock protein  31.21 
 
 
189 aa  73.2  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.260583  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3577  heat shock protein Hsp20  32.37 
 
 
157 aa  73.6  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.202692  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4342  heat shock protein Hsp20  32.65 
 
 
147 aa  72.8  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.204531 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  29.08 
 
 
147 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0197  heat shock protein Hsp20  33.56 
 
 
147 aa  72  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0542117 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0357  Hsp20-like molecular chaperone  32.38 
 
 
148 aa  72  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3905  heat shock protein Hsp20  26.95 
 
 
147 aa  72  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000984381  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2522  heat shock protein Hsp20  34.91 
 
 
150 aa  71.6  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1320  Hsp20/alpha crystallin family protein  30.07 
 
 
151 aa  72  0.000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0788  heat shock protein Hsp20  32.14 
 
 
143 aa  72  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.351008  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1262  small heat shock protein  30.07 
 
 
151 aa  72  0.000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.753574  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1010  heat shock protein Hsp20  32.17 
 
 
153 aa  71.6  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00224234  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4467  heat shock protein Hsp20  35 
 
 
149 aa  71.2  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.156372 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4380  heat shock protein Hsp20  35 
 
 
149 aa  71.2  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.642417  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4761  heat shock protein Hsp20  35 
 
 
149 aa  71.2  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.735655  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3460  heat shock protein Hsp20  32.12 
 
 
137 aa  70.9  0.000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.895888  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2074  heat shock protein Hsp20  35.21 
 
 
173 aa  71.2  0.000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.145284  normal  0.308358 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0838  heat shock protein Hsp20  28.57 
 
 
162 aa  70.5  0.000000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7806  putative small heat-shock protein molecular chaperone  31.21 
 
 
146 aa  69.3  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00540773  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2477  heat shock protein Hsp20  29.86 
 
 
143 aa  69.7  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  27.34 
 
 
147 aa  69.3  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  27.34 
 
 
147 aa  69.3  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1805  heat shock protein Hsp20  32.14 
 
 
149 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.642811  normal  0.803886 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>