More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3724 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_3680  heat shock protein Hsp20  100 
 
 
185 aa  372  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.626967 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3724  heat shock protein Hsp20  100 
 
 
185 aa  372  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4118  heat shock protein Hsp20  68.6 
 
 
172 aa  231  5e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.513744 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2355  heat shock protein Hsp20  60.84 
 
 
165 aa  210  1e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20966  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2212  heat shock protein Hsp20  61.4 
 
 
171 aa  204  6e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4635  heat shock protein Hsp20  54.07 
 
 
169 aa  191  5e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3146  heat shock protein Hsp20  55.36 
 
 
167 aa  189  2.9999999999999997e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.754957 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5194  heat shock protein Hsp20  51.16 
 
 
169 aa  183  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0987038  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2940  heat shock protein Hsp20  53.25 
 
 
168 aa  181  7e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2074  heat shock protein Hsp20  54.65 
 
 
173 aa  178  4e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.145284  normal  0.308358 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2462  heat shock protein Hsp20  54.22 
 
 
168 aa  178  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0466294  normal  0.178308 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2118  heat shock protein Hsp20  55.03 
 
 
166 aa  175  4e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0383  heat shock protein Hsp20  50.3 
 
 
166 aa  175  4e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.170778  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4310  heat shock protein Hsp20  52.1 
 
 
166 aa  169  2e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4550  heat shock protein Hsp20  52.1 
 
 
166 aa  169  2e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3241  heat shock protein Hsp20  50.9 
 
 
166 aa  168  4e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.406826  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2802  heat shock protein Hsp20  50 
 
 
167 aa  164  8e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.20157 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2132  heat shock protein Hsp20  47.59 
 
 
164 aa  156  2e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.585874 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1115  heat shock protein Hsp20  48.8 
 
 
162 aa  152  2.9999999999999998e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0741755  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2384  heat shock protein Hsp20  43.45 
 
 
164 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4859  heat shock protein Hsp20  50 
 
 
204 aa  136  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1171  heat shock protein Hsp20  42.67 
 
 
189 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.726376  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0629  heat shock protein Hsp20  42.21 
 
 
189 aa  129  3e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.185609 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4461  heat shock protein Hsp20  39.05 
 
 
163 aa  128  4.0000000000000003e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3412  small HspC2 heat shock protein  42.86 
 
 
189 aa  127  7.000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.260583  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2287  heat shock protein Hsp20  42.21 
 
 
189 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3394  heat shock protein Hsp20  42.67 
 
 
189 aa  127  1.0000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219016  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3903  heat shock protein Hsp20  47.33 
 
 
194 aa  125  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.534424 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0200  heat shock protein Hsp20  44.97 
 
 
176 aa  116  1.9999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.377048  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2860  heat shock protein Hsp20  32.42 
 
 
184 aa  116  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793853  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1917  heat shock protein Hsp20  39.05 
 
 
156 aa  107  9.000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86534  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1366  heat shock protein Hsp20  38.29 
 
 
176 aa  107  1e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.74874  normal  0.190619 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2857  heat shock protein Hsp20  41.73 
 
 
158 aa  106  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.274432  normal  0.0879388 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3805  heat shock protein Hsp20  36.53 
 
 
158 aa  104  7e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.564168 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3582  heat shock protein Hsp20  47.22 
 
 
166 aa  104  7e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3498  heat shock protein Hsp20  36.53 
 
 
158 aa  104  9e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.938667  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0197  heat shock protein Hsp20  37.66 
 
 
147 aa  102  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0542117 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0389  heat shock protein Hsp20  32.76 
 
 
166 aa  102  3e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.706384 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  40 
 
 
147 aa  102  5e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20170  heat shock protein Hsp20  36.69 
 
 
177 aa  102  5e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.638214  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1127  heat shock protein Hsp20  35.71 
 
 
142 aa  101  5e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4342  heat shock protein Hsp20  37.75 
 
 
147 aa  100  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.204531 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  39.46 
 
 
150 aa  99.8  2e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  38.46 
 
 
147 aa  99  3e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2122  heat shock protein Hsp20  33.11 
 
 
180 aa  99.4  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.451471 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  39.85 
 
 
147 aa  98.6  4e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4499  heat shock protein Hsp20  39.73 
 
 
145 aa  97.8  7e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.100268 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3527  putative HspC2 heat shock protein  38.46 
 
 
173 aa  97.4  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0868338  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2276  heat shock protein Hsp20  38.56 
 
 
175 aa  97.1  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25770  heat shock Hsp20 protein  35.23 
 
 
198 aa  97.1  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  37.76 
 
 
147 aa  96.7  2e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  37.16 
 
 
148 aa  96.3  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2836  heat shock protein Hsp20  36.13 
 
 
197 aa  96.3  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00556978  normal  0.209218 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3882  heat shock protein Hsp20  37.06 
 
 
158 aa  96.7  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.545217  normal  0.180827 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3468  heat shock protein Hsp20  38.46 
 
 
148 aa  95.5  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.282569  normal  0.556723 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2635  heat shock protein Hsp20  38.46 
 
 
148 aa  95.1  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0762  heat shock protein Hsp20  40 
 
 
134 aa  94.7  7e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0924  heat shock protein  38.31 
 
 
180 aa  94.7  7e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0296  heat shock protein Hsp20  33.8 
 
 
156 aa  94.4  9e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  37.88 
 
 
149 aa  94  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4819  heat shock protein Hsp20  34.23 
 
 
146 aa  93.2  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.414421 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4395  heat shock protein Hsp20  38.22 
 
 
181 aa  93.2  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.481666  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4528  heat shock protein Hsp20  38.22 
 
 
181 aa  93.2  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.550609  normal  0.0462291 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4507  heat shock protein Hsp20  38.1 
 
 
145 aa  92.4  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4488  heat shock protein Hsp20  38.1 
 
 
145 aa  92.8  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2460  heat shock protein Hsp20  34.52 
 
 
186 aa  91.7  5e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0031555  normal  0.623789 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3234  HSP20 family protein  35.95 
 
 
231 aa  91.7  6e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4230  heat shock protein Hsp20  43.4 
 
 
105 aa  91.7  6e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4352  heat shock protein Hsp20  37.41 
 
 
145 aa  91.3  7e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.735936  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2578  putative heat shock protein  40.65 
 
 
185 aa  91.3  7e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2414  hypothetical protein  32.68 
 
 
164 aa  90.9  9e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3905  heat shock protein Hsp20  34.01 
 
 
147 aa  90.9  9e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000984381  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3076  heat shock protein Hsp20  34.51 
 
 
148 aa  90.5  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2559  hypothetical protein  32.68 
 
 
164 aa  90.5  1e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4061  heat shock protein Hsp20  32.89 
 
 
147 aa  90.9  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4023  heat shock protein Hsp20  32.89 
 
 
147 aa  90.9  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6892  heat shock protein Hsp20  44.34 
 
 
157 aa  90.9  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.862152  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2316  heat shock protein Hsp20  34.35 
 
 
139 aa  90.5  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0611291  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2522  heat shock protein Hsp20  38.06 
 
 
150 aa  89.7  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0143  heat shock protein Hsp20  33.77 
 
 
156 aa  89.4  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4128  heat shock protein Hsp20  32.92 
 
 
154 aa  89  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.226976  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  32.65 
 
 
146 aa  89  4e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  32.65 
 
 
146 aa  89  4e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1892  HSP20 family protein  33.81 
 
 
132 aa  88.2  5e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.684879  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6104  heat shock protein Hsp20  34.32 
 
 
158 aa  88.6  5e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0249434 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3788  heat shock protein Hsp20  32.21 
 
 
144 aa  88.6  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3612  hypothetical protein  33.99 
 
 
177 aa  88.2  6e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3076  heat shock protein Hsp20  32.65 
 
 
173 aa  88.2  7e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5491  heat shock protein Hsp20  40.57 
 
 
211 aa  87.8  7e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.710483  normal  0.352797 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0445  heat shock protein Hsp20  36.67 
 
 
150 aa  87.8  7e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2957  HSP20 family protein  36.49 
 
 
143 aa  87.8  8e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0369  HSP20 family protein  40.71 
 
 
153 aa  87.8  9e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.93231e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4766  heat shock protein Hsp20  40.41 
 
 
163 aa  87.4  9e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000408851  hitchhiker  0.00874264 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0865  heat shock protein Hsp20  35 
 
 
134 aa  87.4  9e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.303654  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3765  heat shock protein Hsp20  35.82 
 
 
143 aa  87  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2320  heat shock protein Hsp20  35.81 
 
 
149 aa  86.3  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2657  heat shock protein Hsp20  34.67 
 
 
155 aa  86.7  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.498697  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4812  heat shock protein Hsp20  33.78 
 
 
155 aa  85.9  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00238667  normal  0.807841 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0102  heat shock protein Hsp20  33.83 
 
 
142 aa  85.5  4e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0675  heat shock protein Hsp20  37.67 
 
 
163 aa  85.5  4e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000000558694  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>