More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0383 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_0383  heat shock protein Hsp20  100 
 
 
166 aa  337  4e-92  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.170778  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4118  heat shock protein Hsp20  53.94 
 
 
172 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.513744 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3146  heat shock protein Hsp20  53.85 
 
 
167 aa  175  2e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.754957 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3680  heat shock protein Hsp20  50.3 
 
 
185 aa  175  3e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.626967 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3724  heat shock protein Hsp20  50.3 
 
 
185 aa  175  3e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2212  heat shock protein Hsp20  53.57 
 
 
171 aa  175  3e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2118  heat shock protein Hsp20  53.57 
 
 
166 aa  171  5.999999999999999e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2074  heat shock protein Hsp20  52.05 
 
 
173 aa  169  1e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.145284  normal  0.308358 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2462  heat shock protein Hsp20  50.59 
 
 
168 aa  168  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0466294  normal  0.178308 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4635  heat shock protein Hsp20  51.74 
 
 
169 aa  167  5e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5194  heat shock protein Hsp20  49.41 
 
 
169 aa  166  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0987038  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4310  heat shock protein Hsp20  51.81 
 
 
166 aa  166  2e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4550  heat shock protein Hsp20  51.81 
 
 
166 aa  166  2e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2355  heat shock protein Hsp20  50.91 
 
 
165 aa  164  5e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20966  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2940  heat shock protein Hsp20  47.02 
 
 
168 aa  159  1e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1115  heat shock protein Hsp20  48.48 
 
 
162 aa  155  2e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0741755  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2802  heat shock protein Hsp20  48.52 
 
 
167 aa  153  1e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.20157 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2384  heat shock protein Hsp20  49.1 
 
 
164 aa  152  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3241  heat shock protein Hsp20  46.06 
 
 
166 aa  150  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.406826  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2132  heat shock protein Hsp20  47.27 
 
 
164 aa  148  3e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.585874 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1171  heat shock protein Hsp20  45.58 
 
 
189 aa  135  2e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.726376  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0629  heat shock protein Hsp20  44.9 
 
 
189 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.185609 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3412  small HspC2 heat shock protein  46.26 
 
 
189 aa  135  4e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.260583  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3394  heat shock protein Hsp20  45.58 
 
 
189 aa  133  9.999999999999999e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219016  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2287  heat shock protein Hsp20  44.9 
 
 
189 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3903  heat shock protein Hsp20  47.86 
 
 
194 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.534424 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4859  heat shock protein Hsp20  47.18 
 
 
204 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2860  heat shock protein Hsp20  37.36 
 
 
184 aa  126  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793853  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0200  heat shock protein Hsp20  44.67 
 
 
176 aa  124  5e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.377048  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4461  heat shock protein Hsp20  39.88 
 
 
163 aa  122  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2276  heat shock protein Hsp20  44.08 
 
 
175 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3234  HSP20 family protein  44.44 
 
 
231 aa  111  5e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2460  heat shock protein Hsp20  43.79 
 
 
186 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0031555  normal  0.623789 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20170  heat shock protein Hsp20  39.61 
 
 
177 aa  109  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.638214  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1917  heat shock protein Hsp20  39.76 
 
 
156 aa  108  4.0000000000000004e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86534  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4395  heat shock protein Hsp20  42 
 
 
181 aa  106  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.481666  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4528  heat shock protein Hsp20  42 
 
 
181 aa  106  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.550609  normal  0.0462291 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0924  heat shock protein  41.56 
 
 
180 aa  106  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3527  putative HspC2 heat shock protein  40.67 
 
 
173 aa  106  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0868338  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0389  heat shock protein Hsp20  36.09 
 
 
166 aa  105  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.706384 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  46.09 
 
 
150 aa  104  7e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1366  heat shock protein Hsp20  34.76 
 
 
176 aa  103  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.74874  normal  0.190619 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  38.51 
 
 
147 aa  99  3e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0296  heat shock protein Hsp20  35.66 
 
 
156 aa  98.6  3e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  39.71 
 
 
147 aa  97.1  1e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3468  heat shock protein Hsp20  39.44 
 
 
148 aa  95.9  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.282569  normal  0.556723 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2635  heat shock protein Hsp20  39.44 
 
 
148 aa  95.9  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2857  heat shock protein Hsp20  38.3 
 
 
158 aa  94.4  6e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.274432  normal  0.0879388 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1127  heat shock protein Hsp20  35.46 
 
 
142 aa  94  8e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25770  heat shock Hsp20 protein  38.06 
 
 
198 aa  94  8e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2414  hypothetical protein  34.51 
 
 
164 aa  93.6  1e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4812  heat shock protein Hsp20  42.25 
 
 
155 aa  93.2  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00238667  normal  0.807841 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1738  small HspC2 heat shock protein  34.05 
 
 
189 aa  93.2  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.267785  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2798  small HspC2 heat shock protein  34.05 
 
 
189 aa  93.2  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.159343  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2122  heat shock protein Hsp20  35.46 
 
 
180 aa  93.2  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.451471 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1018  heat shock protein Hsp20  36.99 
 
 
177 aa  93.2  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.683731  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2559  hypothetical protein  34.51 
 
 
164 aa  92.8  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  37.4 
 
 
148 aa  92.8  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0762  heat shock protein Hsp20  37.8 
 
 
134 aa  92.4  3e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2578  putative heat shock protein  48.96 
 
 
185 aa  91.3  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1892  HSP20 family protein  33.81 
 
 
132 aa  90.9  7e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.684879  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4819  heat shock protein Hsp20  36.17 
 
 
146 aa  90.9  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.414421 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6892  heat shock protein Hsp20  40.57 
 
 
157 aa  90.5  9e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.862152  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4061  heat shock protein Hsp20  35 
 
 
147 aa  90.1  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  39.23 
 
 
146 aa  90.1  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0580  heat shock protein Hsp20  37.5 
 
 
145 aa  90.1  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000199173  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4128  heat shock protein Hsp20  32.87 
 
 
154 aa  90.1  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.226976  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4023  heat shock protein Hsp20  35 
 
 
147 aa  90.1  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1429  heat shock protein Hsp20  38.24 
 
 
169 aa  89.7  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  39.23 
 
 
146 aa  90.1  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0622  HSP20 family protein  35.25 
 
 
132 aa  88.2  5e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0686  heat shock protein HSP20  37.59 
 
 
153 aa  87.8  6e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1170  heat shock protein Hsp20  44.34 
 
 
170 aa  87  9e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1742  heat shock protein Hsp20  34.69 
 
 
152 aa  87.4  9e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.314982  hitchhiker  0.000988198 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2522  heat shock protein Hsp20  37.6 
 
 
150 aa  86.7  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3580  molecular chaperone (small heat shock protein)  35.04 
 
 
141 aa  86.7  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4342  heat shock protein Hsp20  33.09 
 
 
147 aa  86.7  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.204531 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2600  putative heat shock protein Hsp20  43.81 
 
 
187 aa  87  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.207676  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6093  heat shock protein Hsp20  42.86 
 
 
187 aa  87  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0445  heat shock protein Hsp20  34.27 
 
 
150 aa  86.7  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5491  heat shock protein Hsp20  38.68 
 
 
211 aa  86.3  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.710483  normal  0.352797 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6104  heat shock protein Hsp20  38.26 
 
 
158 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0249434 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0838  heat shock protein Hsp20  39.42 
 
 
162 aa  85.9  2e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0197  heat shock protein Hsp20  33.09 
 
 
147 aa  86.3  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0542117 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4488  heat shock protein Hsp20  39.2 
 
 
145 aa  85.5  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2730  heat shock protein Hsp20  35.34 
 
 
148 aa  85.5  3e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2049  heat shock protein Hsp20  34.84 
 
 
164 aa  85.5  3e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0000140473  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2836  heat shock protein Hsp20  32.03 
 
 
197 aa  85.9  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00556978  normal  0.209218 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3582  heat shock protein Hsp20  37.96 
 
 
166 aa  85.9  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6390  heat shock protein Hsp20  41.9 
 
 
187 aa  85.9  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.065602 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  33.09 
 
 
147 aa  85.1  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4352  heat shock protein Hsp20  38.4 
 
 
145 aa  85.1  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.735936  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3788  heat shock protein Hsp20  34.06 
 
 
144 aa  85.1  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4507  heat shock protein Hsp20  39.2 
 
 
145 aa  85.1  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1543  heat shock protein Hsp20  41.67 
 
 
146 aa  84.7  5e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000494204  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3882  heat shock protein Hsp20  36.76 
 
 
158 aa  84.3  7e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.545217  normal  0.180827 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  36.22 
 
 
147 aa  84  8e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02640  low molecular weight heat shock protein  35.77 
 
 
158 aa  84  8e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0833  heat shock protein Hsp20  38.52 
 
 
169 aa  84  8e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3765  heat shock protein Hsp20  41.94 
 
 
143 aa  84  8e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>