More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2802 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2802  heat shock protein Hsp20  100 
 
 		 167 aa  340  5e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.20157 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3241  heat shock protein Hsp20  76.22 
 
 		 166 aa  258  4e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.406826  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2462  heat shock protein Hsp20  70.91 
 
 		 168 aa  228  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0466294  normal  0.178308 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4635  heat shock protein Hsp20  61.31 
 
 		 169 aa  209  1e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2940  heat shock protein Hsp20  59.28 
 
 		 168 aa  204  4e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3146  heat shock protein Hsp20  63.1 
 
 		 167 aa  202  2e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.754957 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5194  heat shock protein Hsp20  59.52 
 
 		 169 aa  198  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0987038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2118  heat shock protein Hsp20  53.94 
 
 		 166 aa  180  8.000000000000001e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4118  heat shock protein Hsp20  51.5 
 
 		 172 aa  176  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.513744 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2355  heat shock protein Hsp20  53.01 
 
 		 165 aa  173  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20966  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3680  heat shock protein Hsp20  50 
 
 		 185 aa  164  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.626967 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3724  heat shock protein Hsp20  50 
 
 		 185 aa  164  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2212  heat shock protein Hsp20  52.1 
 
 		 171 aa  164  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4310  heat shock protein Hsp20  50.9 
 
 		 166 aa  162  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4550  heat shock protein Hsp20  50.9 
 
 		 166 aa  162  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1115  heat shock protein Hsp20  49.09 
 
 		 162 aa  157  7e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0741755  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2074  heat shock protein Hsp20  45.93 
 
 		 173 aa  156  1e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.145284  normal  0.308358 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0383  heat shock protein Hsp20  48.52 
 
 		 166 aa  153  1e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.170778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2384  heat shock protein Hsp20  44.31 
 
 		 164 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2132  heat shock protein Hsp20  42.41 
 
 		 164 aa  131  3.9999999999999996e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.585874 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4859  heat shock protein Hsp20  50.75 
 
 		 204 aa  124  6e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3903  heat shock protein Hsp20  49.24 
 
 		 194 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.534424 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0629  heat shock protein Hsp20  43.64 
 
 		 189 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.185609 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1171  heat shock protein Hsp20  43.03 
 
 		 189 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.726376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3412  small HspC2 heat shock protein  43.64 
 
 		 189 aa  114  6e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.260583  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3394  heat shock protein Hsp20  43.29 
 
 		 189 aa  111  4.0000000000000004e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219016  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1917  heat shock protein Hsp20  40.24 
 
 		 156 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86534  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2287  heat shock protein Hsp20  42.42 
 
 		 189 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4461  heat shock protein Hsp20  36.99 
 
 		 163 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20170  heat shock protein Hsp20  38.06 
 
 		 177 aa  98.2  5e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.638214  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1127  heat shock protein Hsp20  35.97 
 
 		 142 aa  94.4  6e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0200  heat shock protein Hsp20  40.67 
 
 		 176 aa  93.6  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.377048  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  38.41 
 
 		 150 aa  94  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4528  heat shock protein Hsp20  41.04 
 
 		 181 aa  93.2  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.550609  normal  0.0462291 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4395  heat shock protein Hsp20  41.04 
 
 		 181 aa  93.2  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.481666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2860  heat shock protein Hsp20  33.74 
 
 		 184 aa  93.2  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3527  putative HspC2 heat shock protein  39.6 
 
 		 173 aa  90.5  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0868338  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3234  HSP20 family protein  37.18 
 
 		 231 aa  89  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2559  hypothetical protein  35.81 
 
 		 164 aa  88.6  3e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2460  heat shock protein Hsp20  36.54 
 
 		 186 aa  87.4  9e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0031555  normal  0.623789 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2578  putative heat shock protein  36.84 
 
 		 185 aa  87  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  40.46 
 
 		 147 aa  87  1e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2414  hypothetical protein  35.14 
 
 		 164 aa  86.3  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4819  heat shock protein Hsp20  39.01 
 
 		 146 aa  85.9  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.414421 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4819  heat shock protein Hsp20  35.92 
 
 		 218 aa  85.5  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  37.06 
 
 		 147 aa  85.1  4e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2276  heat shock protein Hsp20  38.41 
 
 		 175 aa  84  9e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2857  heat shock protein Hsp20  37.59 
 
 		 158 aa  84  9e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.274432  normal  0.0879388 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0037  heat shock protein Hsp20  34.06 
 
 		 142 aa  83.6  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2122  heat shock protein Hsp20  37.78 
 
 		 180 aa  83.6  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.451471 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1366  heat shock protein Hsp20  33.89 
 
 		 176 aa  82.8  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.74874  normal  0.190619 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0924  heat shock protein  37.42 
 
 		 180 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3788  heat shock protein Hsp20  36.17 
 
 		 144 aa  82  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4061  heat shock protein Hsp20  36.69 
 
 		 147 aa  81.3  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4023  heat shock protein Hsp20  36.69 
 
 		 147 aa  81.3  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0580  heat shock protein Hsp20  37.74 
 
 		 145 aa  81.3  0.000000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000199173  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0296  heat shock protein Hsp20  32.87 
 
 		 156 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1429  heat shock protein Hsp20  37.9 
 
 		 169 aa  80.1  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2657  heat shock protein Hsp20  39.06 
 
 		 155 aa  80.1  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.498697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3460  heat shock protein Hsp20  35.07 
 
 		 137 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.895888  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0197  heat shock protein Hsp20  34.46 
 
 		 147 aa  79.3  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0542117 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1170  heat shock protein Hsp20  36.91 
 
 		 170 aa  79.7  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0445  heat shock protein Hsp20  37.68 
 
 		 150 aa  79  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2635  heat shock protein Hsp20  37.8 
 
 		 148 aa  79  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2049  heat shock protein Hsp20  38.97 
 
 		 164 aa  79  0.00000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0000140473  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3805  heat shock protein Hsp20  31.14 
 
 		 158 aa  79  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.564168 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3498  heat shock protein Hsp20  31.14 
 
 		 158 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.938667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3468  heat shock protein Hsp20  37.8 
 
 		 148 aa  79  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.282569  normal  0.556723 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4342  heat shock protein Hsp20  34.46 
 
 		 147 aa  78.6  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.204531 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0719  heat shock protein Hsp20  33.78 
 
 		 137 aa  78.6  0.00000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00433386  normal  0.504335 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0143  heat shock protein Hsp20  37.98 
 
 		 156 aa  78.6  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2836  heat shock protein Hsp20  30.38 
 
 		 197 aa  78.6  0.00000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00556978  normal  0.209218 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6093  heat shock protein Hsp20  36.5 
 
 		 187 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6390  heat shock protein Hsp20  36.5 
 
 		 187 aa  78.2  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.065602 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3765  heat shock protein Hsp20  34.81 
 
 		 143 aa  77.8  0.00000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0833  heat shock protein Hsp20  37.93 
 
 		 169 aa  77.8  0.00000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0762  heat shock protein Hsp20  35.21 
 
 		 134 aa  77.8  0.00000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3882  heat shock protein Hsp20  29.94 
 
 		 158 aa  77.8  0.00000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.545217  normal  0.180827 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2600  putative heat shock protein Hsp20  38.1 
 
 		 187 aa  77.4  0.00000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.207676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0463  heat shock protein Hsp20  37.58 
 
 		 166 aa  77  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2505  heat shock protein Hsp20  36.79 
 
 		 138 aa  77  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.239492  normal  0.0462479 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1921  heat shock protein Hsp20  43.69 
 
 		 167 aa  77  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.985705  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  31.82 
 
 		 146 aa  77  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  31.82 
 
 		 146 aa  77  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6104  heat shock protein Hsp20  32.68 
 
 		 158 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0249434 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1543  heat shock protein Hsp20  34.56 
 
 		 146 aa  76.3  0.0000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000494204  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25770  heat shock Hsp20 protein  34.62 
 
 		 198 aa  75.9  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  33.08 
 
 		 147 aa  75.9  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3076  heat shock protein Hsp20  35 
 
 		 173 aa  74.7  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1977  heat shock protein Hsp20  30.6 
 
 		 139 aa  74.7  0.0000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.334288  normal  0.643075 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4128  heat shock protein Hsp20  34.71 
 
 		 154 aa  74.7  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.226976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0052  heat shock protein Hsp20  42.11 
 
 		 151 aa  74.7  0.0000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0774  heat shock protein Hsp20  32.17 
 
 		 139 aa  74.3  0.0000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0926  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 		 152 aa  74.3  0.0000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4812  heat shock protein Hsp20  36.72 
 
 		 155 aa  73.9  0.0000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00238667  normal  0.807841 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  40.62 
 
 		 149 aa  73.9  0.0000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6892  heat shock protein Hsp20  35.85 
 
 		 157 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.862152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_825  HSP20/alpha crystallin  36.11 
 
 		 162 aa  73.6  0.000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0865  heat shock protein Hsp20  33.1 
 
 		 134 aa  73.6  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.303654  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1076  heat shock protein Hsp20  33.57 
 
 		 148 aa  73.6  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.713568  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>