More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3882 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_3882  heat shock protein Hsp20  100 
 
 
158 aa  313  5e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.545217  normal  0.180827 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3805  heat shock protein Hsp20  77.85 
 
 
158 aa  246  6e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.564168 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3498  heat shock protein Hsp20  77.85 
 
 
158 aa  246  6e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.938667  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6104  heat shock protein Hsp20  55.77 
 
 
158 aa  167  5e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0249434 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1917  heat shock protein Hsp20  40.91 
 
 
156 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86534  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2578  putative heat shock protein  42.86 
 
 
185 aa  106  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2355  heat shock protein Hsp20  42.18 
 
 
165 aa  103  8e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20966  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4461  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
163 aa  100  9e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0200  heat shock protein Hsp20  40.12 
 
 
176 aa  100  1e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.377048  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6892  heat shock protein Hsp20  43.93 
 
 
157 aa  99.4  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.862152  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0369  HSP20 family protein  43.59 
 
 
153 aa  98.2  4e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.93231e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2276  heat shock protein Hsp20  46.22 
 
 
175 aa  97.1  8e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3680  heat shock protein Hsp20  37.06 
 
 
185 aa  96.7  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.626967 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3724  heat shock protein Hsp20  37.06 
 
 
185 aa  96.7  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5491  heat shock protein Hsp20  42.99 
 
 
211 aa  95.1  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.710483  normal  0.352797 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3394  heat shock protein Hsp20  38.03 
 
 
189 aa  94.4  5e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219016  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2287  heat shock protein Hsp20  38.73 
 
 
189 aa  94.4  6e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4118  heat shock protein Hsp20  38.78 
 
 
172 aa  94  7e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.513744 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  38.64 
 
 
147 aa  92.8  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1171  heat shock protein Hsp20  36.62 
 
 
189 aa  93.6  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.726376  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2860  heat shock protein Hsp20  39.44 
 
 
184 aa  93.6  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793853  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0629  heat shock protein Hsp20  36.62 
 
 
189 aa  92.8  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.185609 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  34.27 
 
 
147 aa  92.8  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1018  heat shock protein Hsp20  43.75 
 
 
177 aa  91.3  5e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.683731  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3412  small HspC2 heat shock protein  36.62 
 
 
189 aa  91.3  5e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.260583  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3582  heat shock protein Hsp20  40 
 
 
166 aa  90.9  6e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2074  heat shock protein Hsp20  41.18 
 
 
173 aa  90.9  7e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.145284  normal  0.308358 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3146  heat shock protein Hsp20  34.68 
 
 
167 aa  90.9  7e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.754957 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4859  heat shock protein Hsp20  38.06 
 
 
204 aa  89.4  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3241  heat shock protein Hsp20  34.13 
 
 
166 aa  89.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.406826  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0924  heat shock protein  46.43 
 
 
180 aa  89.4  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3080  heat shock protein Hsp20  33.12 
 
 
230 aa  87.8  5e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5194  heat shock protein Hsp20  35.82 
 
 
169 aa  87.8  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0987038  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3234  HSP20 family protein  42.98 
 
 
231 aa  87.4  7e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2118  heat shock protein Hsp20  36.24 
 
 
166 aa  87  9e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2857  heat shock protein Hsp20  36.97 
 
 
158 aa  87  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.274432  normal  0.0879388 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2212  heat shock protein Hsp20  38.97 
 
 
171 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6390  heat shock protein Hsp20  36 
 
 
187 aa  87  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.065602 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2460  heat shock protein Hsp20  42.11 
 
 
186 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0031555  normal  0.623789 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0445  heat shock protein Hsp20  38.93 
 
 
150 aa  86.3  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6093  heat shock protein Hsp20  35.2 
 
 
187 aa  85.5  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1732  HSP20 family protein  34.34 
 
 
167 aa  85.5  3e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.371108  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2505  heat shock protein Hsp20  43.48 
 
 
138 aa  84.7  4e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.239492  normal  0.0462479 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3612  hypothetical protein  36.84 
 
 
177 aa  85.1  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1115  heat shock protein Hsp20  37.31 
 
 
162 aa  84.7  5e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0741755  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2635  heat shock protein Hsp20  34.88 
 
 
195 aa  84.7  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000662159  normal  0.965311 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4310  heat shock protein Hsp20  38.69 
 
 
166 aa  84.3  5e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4550  heat shock protein Hsp20  38.69 
 
 
166 aa  84.3  5e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0383  heat shock protein Hsp20  36.76 
 
 
166 aa  84.3  6e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.170778  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4230  heat shock protein Hsp20  40.62 
 
 
105 aa  84  7e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2678  HSP20 family protein  41.67 
 
 
151 aa  84  8e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0838  heat shock protein Hsp20  30.95 
 
 
162 aa  83.2  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20170  heat shock protein Hsp20  41.07 
 
 
177 aa  83.2  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.638214  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4635  heat shock protein Hsp20  35.07 
 
 
169 aa  82.8  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2938  heat shock protein Hsp20  33.79 
 
 
145 aa  82.8  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000491843  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2940  heat shock protein Hsp20  32.16 
 
 
168 aa  82.8  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0037  heat shock protein Hsp20  33.07 
 
 
142 aa  82.4  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2316  heat shock protein Hsp20  32.58 
 
 
139 aa  82.4  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0611291  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3076  heat shock protein Hsp20  32.09 
 
 
148 aa  82.4  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  34.48 
 
 
149 aa  82  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0954  Hsp20/alpha crystallin family protein  29.32 
 
 
162 aa  81.3  0.000000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.154946  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2462  heat shock protein Hsp20  32.18 
 
 
168 aa  81.6  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0466294  normal  0.178308 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0505  heat shock protein Hsp20  34.53 
 
 
158 aa  81.3  0.000000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0296  heat shock protein Hsp20  37.96 
 
 
156 aa  81.3  0.000000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2836  heat shock protein Hsp20  29.53 
 
 
197 aa  81.3  0.000000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00556978  normal  0.209218 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2320  heat shock protein Hsp20  38.24 
 
 
149 aa  81.3  0.000000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2132  heat shock protein Hsp20  38.61 
 
 
164 aa  80.9  0.000000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.585874 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3905  heat shock protein Hsp20  34.59 
 
 
147 aa  80.9  0.000000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000984381  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0833  heat shock protein Hsp20  45.68 
 
 
169 aa  80.5  0.000000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_825  HSP20/alpha crystallin  29.32 
 
 
162 aa  80.5  0.000000000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1366  heat shock protein Hsp20  37.12 
 
 
176 aa  80.1  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.74874  normal  0.190619 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3903  heat shock protein Hsp20  32.65 
 
 
194 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.534424 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4528  heat shock protein Hsp20  42.99 
 
 
181 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.550609  normal  0.0462291 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4395  heat shock protein Hsp20  42.99 
 
 
181 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.481666  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2281  heat shock protein Hsp20  40 
 
 
173 aa  79.7  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.78764  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0580  heat shock protein Hsp20  34.26 
 
 
145 aa  79  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000199173  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3312  heat shock protein, putative  36.89 
 
 
129 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.267805  normal  0.275059 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3336  heat shock protein Hsp20  31.78 
 
 
191 aa  78.6  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25770  heat shock Hsp20 protein  39.62 
 
 
198 aa  78.6  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1983  heat shock protein Hsp20  34.92 
 
 
153 aa  78.2  0.00000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00684856  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  43.48 
 
 
147 aa  78.2  0.00000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10507  heat shock protein Hsp20/Hsp26, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G10270)  36.7 
 
 
181 aa  77.8  0.00000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0988742 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2802  heat shock protein Hsp20  29.94 
 
 
167 aa  77.8  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.20157 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2600  putative heat shock protein Hsp20  33.6 
 
 
187 aa  77.8  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.207676  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1010  heat shock protein Hsp20  39.81 
 
 
153 aa  77.8  0.00000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00224234  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2159  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
139 aa  77  0.00000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0146906  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  37.74 
 
 
147 aa  76.6  0.0000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0423  heat shock protein Hsp20  35.29 
 
 
152 aa  77  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.943695  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1543  heat shock protein Hsp20  32.56 
 
 
146 aa  77  0.0000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000494204  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14610  heat shock protein Hsp20  34.78 
 
 
143 aa  76.6  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000610495  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  36.19 
 
 
148 aa  77  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1127  heat shock protein Hsp20  37.07 
 
 
142 aa  77  0.0000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  33.61 
 
 
146 aa  76.3  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  33.61 
 
 
146 aa  76.3  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  33.07 
 
 
150 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1320  Hsp20/alpha crystallin family protein  31.47 
 
 
151 aa  74.7  0.0000000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2809  heat shock protein Hsp20  47.12 
 
 
149 aa  74.3  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00105088  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1262  small heat shock protein  31.47 
 
 
151 aa  74.7  0.0000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.753574  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0389  heat shock protein Hsp20  32.71 
 
 
166 aa  74.7  0.0000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.706384 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2798  small HspC2 heat shock protein  32.62 
 
 
189 aa  74.3  0.0000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.159343  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>