More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1294 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_1294  heat shock protein Hsp20  100 
 
 
159 aa  322  1e-87  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.770288 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0298  heat shock protein Hsp20  37.8 
 
 
166 aa  101  3e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.295208 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1986  heat shock protein Hsp20  36.36 
 
 
156 aa  92  3e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0154  heat shock protein Hsp20  32.67 
 
 
156 aa  92  3e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.184978  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1758  heat shock protein Hsp20  33.56 
 
 
223 aa  87  8e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1429  heat shock protein Hsp20  38.35 
 
 
169 aa  77  0.00000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0580  heat shock protein Hsp20  39.32 
 
 
145 aa  75.9  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000199173  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  40.52 
 
 
150 aa  73.9  0.0000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1494  heat shock protein Hsp20  29.41 
 
 
148 aa  72.8  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000082748  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1631  heat shock protein Hsp20  44.79 
 
 
145 aa  72.8  0.000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011771  BCAH820_C0008  Hsp  33.64 
 
 
146 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0540  heat shock protein Hsp20  31.08 
 
 
147 aa  70.9  0.000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0445  heat shock protein Hsp20  38 
 
 
150 aa  70.1  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2279  HSP20 family protein  34.38 
 
 
153 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000417657  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1417  heat shock protein Hsp20  31.13 
 
 
152 aa  69.3  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2022  heat shock protein Hsp20  33.64 
 
 
144 aa  69.3  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.12456  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1543  heat shock protein Hsp20  36.79 
 
 
146 aa  68.2  0.00000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000494204  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2078  heat shock protein Hsp20  35.85 
 
 
147 aa  68.2  0.00000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1732  HSP20 family protein  30.67 
 
 
167 aa  67.4  0.00000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.371108  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2094  HSP20 family protein  33.33 
 
 
153 aa  67.4  0.00000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.016336  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2034  heat shock protein  33.33 
 
 
153 aa  67.4  0.00000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000604095  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2032  heat shock protein  33.33 
 
 
153 aa  67.4  0.00000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000873203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2250  HSP20 family protein  33.33 
 
 
153 aa  67.4  0.00000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000163363  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2275  heat shock protein, Hsp20 family  33.33 
 
 
153 aa  67.4  0.00000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.79952e-50 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3092  heat shock protein, Hsp20 family  33.33 
 
 
153 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000535786  decreased coverage  5.9903300000000006e-24 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4859  heat shock protein Hsp20  38.54 
 
 
204 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4528  heat shock protein Hsp20  42.42 
 
 
181 aa  66.2  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.550609  normal  0.0462291 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4395  heat shock protein Hsp20  42.42 
 
 
181 aa  66.2  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.481666  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1921  heat shock protein Hsp20  28.12 
 
 
167 aa  65.9  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.985705  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4461  heat shock protein Hsp20  34.35 
 
 
163 aa  65.5  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0629  heat shock protein Hsp20  32.62 
 
 
189 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.185609 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1122  heat shock protein Hsp20  38.32 
 
 
170 aa  64.7  0.0000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.421321  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1170  heat shock protein Hsp20  35.11 
 
 
170 aa  64.7  0.0000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1651  heat shock protein Hsp20  35.05 
 
 
155 aa  64.7  0.0000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000431905  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3460  heat shock protein Hsp20  31.76 
 
 
137 aa  64.3  0.0000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.895888  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2276  heat shock protein Hsp20  33.57 
 
 
175 aa  64.3  0.0000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2188  heat shock protein Hsp20  29.11 
 
 
156 aa  63.9  0.0000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.345525  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1660  heat shock protein Hsp20  31.54 
 
 
145 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.870911  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4819  heat shock protein Hsp20  30.28 
 
 
218 aa  63.9  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3312  heat shock protein, putative  32.54 
 
 
129 aa  63.9  0.0000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.267805  normal  0.275059 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2232  heat shock protein, Hsp20 family  33.33 
 
 
154 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00154952  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  30.32 
 
 
147 aa  63.2  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1171  heat shock protein Hsp20  31.21 
 
 
189 aa  63.2  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.726376  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3612  hypothetical protein  33.68 
 
 
177 aa  62.8  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2073  heat shock protein Hsp20  34.02 
 
 
155 aa  62.8  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00430311  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0037  heat shock protein Hsp20  35.42 
 
 
142 aa  62.4  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2360  heat shock protein, Hsp20 family  33.33 
 
 
154 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000177338  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10507  heat shock protein Hsp20/Hsp26, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G10270)  30.6 
 
 
181 aa  62  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0988742 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3903  heat shock protein Hsp20  35.42 
 
 
194 aa  62  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.534424 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0593  heat shock protein Hsp20  38.38 
 
 
191 aa  61.6  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.95349  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3412  small HspC2 heat shock protein  33.94 
 
 
189 aa  61.6  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.260583  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1917  heat shock protein Hsp20  30.46 
 
 
156 aa  61.6  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86534  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0463  heat shock protein Hsp20  43.62 
 
 
166 aa  62  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4128  heat shock protein Hsp20  36.56 
 
 
154 aa  61.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.226976  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3394  heat shock protein Hsp20  31.82 
 
 
189 aa  61.2  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219016  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3582  heat shock protein Hsp20  33.03 
 
 
166 aa  61.2  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3725  heat shock protein Hsp20  34.26 
 
 
143 aa  61.2  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.843054  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0833  heat shock protein Hsp20  36.08 
 
 
169 aa  61.2  0.000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  29.68 
 
 
147 aa  60.8  0.000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1983  heat shock protein Hsp20  36.19 
 
 
153 aa  60.8  0.000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00684856  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0982  HSP20 family protein  33.33 
 
 
176 aa  60.8  0.000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2462  heat shock protein Hsp20  36.84 
 
 
168 aa  60.5  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0466294  normal  0.178308 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0200  heat shock protein Hsp20  29.71 
 
 
176 aa  60.1  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.377048  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1704  heat shock protein Hsp20  31.3 
 
 
140 aa  59.7  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1115  heat shock protein Hsp20  31.91 
 
 
162 aa  60.1  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0741755  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1573  heat shock protein Hsp20  30.48 
 
 
173 aa  59.7  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00130938  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2860  heat shock protein Hsp20  31.73 
 
 
184 aa  60.5  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793853  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3667  heat shock protein Hsp20  32.14 
 
 
139 aa  60.5  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1076  heat shock protein Hsp20  32.03 
 
 
148 aa  60.1  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.713568  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1159  heat shock protein Hsp20  32.08 
 
 
148 aa  60.1  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000413054  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3234  HSP20 family protein  35.48 
 
 
231 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1127  heat shock protein Hsp20  37.23 
 
 
142 aa  59.3  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2731  heat shock protein Hsp20  27.27 
 
 
166 aa  59.7  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2460  heat shock protein Hsp20  35.48 
 
 
186 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0031555  normal  0.623789 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4819  heat shock protein Hsp20  29.93 
 
 
146 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.414421 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2212  heat shock protein Hsp20  32.12 
 
 
171 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2287  heat shock protein Hsp20  32.11 
 
 
189 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2898  heat shock protein Hsp20  31.43 
 
 
149 aa  59.7  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.828136  normal  0.116226 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0588  heat shock protein, molecular chaperone  38.71 
 
 
141 aa  59.7  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.648467  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  28.57 
 
 
146 aa  58.9  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0369  HSP20 family protein  30.85 
 
 
153 aa  58.5  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.93231e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  28.57 
 
 
146 aa  58.9  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1742  heat shock protein Hsp20  35.48 
 
 
152 aa  58.5  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.314982  hitchhiker  0.000988198 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02640  low molecular weight heat shock protein  28.97 
 
 
158 aa  58.2  0.00000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1347  heat shock protein Hsp20  31.91 
 
 
148 aa  58.5  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.452932  normal  0.819182 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0924  heat shock protein  36.73 
 
 
180 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1648  heat shock protein, Hsp20 family  31.91 
 
 
148 aa  58.5  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.715277  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0735  heat shock protein Hsp20  38.3 
 
 
145 aa  58.2  0.00000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000037192  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2290  HSP20 family protein  28.36 
 
 
145 aa  58.2  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.581771  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2372  heat shock protein, Hsp20 family  28.36 
 
 
145 aa  58.2  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0601479  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3080  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
230 aa  57.8  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1474  heat shock protein Hsp20  31.07 
 
 
151 aa  57.4  0.00000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.242626  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2355  heat shock protein Hsp20  32.37 
 
 
165 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20966  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0383  heat shock protein Hsp20  30.77 
 
 
166 aa  57.4  0.00000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.170778  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2122  heat shock protein Hsp20  38.04 
 
 
180 aa  57.4  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.451471 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0454  heat shock protein Hsp20  32.17 
 
 
144 aa  57.4  0.00000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2132  heat shock protein Hsp20  30.43 
 
 
164 aa  57  0.00000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.585874 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  32.98 
 
 
147 aa  56.6  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0982  heat shock protein Hsp20  31.65 
 
 
133 aa  57  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.506219 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0383  heat shock protein Hsp20  32.35 
 
 
158 aa  56.6  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>