More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0836 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_0836  heat shock protein Hsp20  100 
 
 
149 aa  311  2.9999999999999996e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.414458 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6319  heat shock protein Hsp20  69.8 
 
 
149 aa  222  1e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3751  response regulator receiver protein  67.32 
 
 
150 aa  212  1.9999999999999998e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.544355  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4413  heat shock protein Hsp20  64 
 
 
150 aa  200  5e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0233  small heat shock protein  52 
 
 
145 aa  157  4e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.818598  normal  0.0970629 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3917  heat shock protein Hsp20  47.41 
 
 
142 aa  134  5e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5151  heat shock protein Hsp20  49.64 
 
 
148 aa  131  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0184623  normal  0.32984 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06090  small heat shock protein  43.05 
 
 
148 aa  125  2.0000000000000002e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.473161  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1697  hypothetical protein  42.54 
 
 
145 aa  108  2.0000000000000002e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2899  heat shock protein Hsp20  41.45 
 
 
145 aa  107  5e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0174584 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0370  heat shock protein Hsp20  37.5 
 
 
140 aa  102  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.733353  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2326  heat shock protein Hsp20  40.43 
 
 
144 aa  99.4  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0663504 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  40.6 
 
 
148 aa  92.8  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6221  heat shock protein Hsp20  35.71 
 
 
151 aa  91.3  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0296  heat shock protein Hsp20  35.66 
 
 
156 aa  87.4  5e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  43.81 
 
 
146 aa  87  7e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  43.81 
 
 
146 aa  87  7e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1366  heat shock protein Hsp20  32.12 
 
 
176 aa  86.3  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.74874  normal  0.190619 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0513  heat shock protein Hsp20  39.85 
 
 
147 aa  85.1  3e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0686  heat shock protein HSP20  32.56 
 
 
153 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4132  heat shock protein Hsp20  30.71 
 
 
144 aa  81.6  0.000000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2477  heat shock protein Hsp20  36.13 
 
 
143 aa  82  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2730  heat shock protein Hsp20  39.62 
 
 
148 aa  81.6  0.000000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1543  heat shock protein Hsp20  39.17 
 
 
146 aa  81.3  0.000000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000494204  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4061  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
147 aa  81.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4023  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
147 aa  81.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0460  heat shock protein Hsp20  42.06 
 
 
155 aa  81.3  0.000000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  35.34 
 
 
147 aa  80.5  0.000000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  34.59 
 
 
147 aa  78.6  0.00000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0610  heat shock protein Hsp20  35.71 
 
 
136 aa  78.2  0.00000000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.335952  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2287  heat shock protein Hsp20  37.38 
 
 
189 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2938  heat shock protein Hsp20  38.06 
 
 
145 aa  77.4  0.00000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000491843  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  32.41 
 
 
149 aa  77  0.00000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2022  heat shock protein Hsp20  37.07 
 
 
141 aa  77  0.00000000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1762  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
144 aa  76.3  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0774  heat shock protein Hsp20  33.09 
 
 
139 aa  76.3  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1171  heat shock protein Hsp20  36.45 
 
 
189 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.726376  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3765  heat shock protein Hsp20  37.96 
 
 
143 aa  76.3  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2049  heat shock protein Hsp20  32.74 
 
 
164 aa  76.3  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0000140473  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0391  heat shock protein Hsp20  35.77 
 
 
143 aa  75.9  0.0000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000478859  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2957  HSP20 family protein  36.84 
 
 
143 aa  75.9  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2559  hypothetical protein  37 
 
 
164 aa  75.1  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2414  hypothetical protein  37 
 
 
164 aa  75.1  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0762  heat shock protein Hsp20  33.06 
 
 
134 aa  75.1  0.0000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3412  small HspC2 heat shock protein  35.51 
 
 
189 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.260583  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0052  heat shock protein Hsp20  37.3 
 
 
151 aa  75.1  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0369  HSP20 family protein  36.28 
 
 
153 aa  74.7  0.0000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.93231e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2316  heat shock protein Hsp20  37.96 
 
 
139 aa  74.7  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0611291  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1695  heat shock protein Hsp20  34.25 
 
 
151 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3394  heat shock protein Hsp20  32.61 
 
 
189 aa  74.7  0.0000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219016  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3078  heat shock protein Hsp20  35.83 
 
 
145 aa  74.7  0.0000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000700712  normal  0.0754711 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4342  heat shock protein Hsp20  38.89 
 
 
147 aa  74.3  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.204531 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0629  heat shock protein Hsp20  34.58 
 
 
189 aa  74.3  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.185609 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1977  heat shock protein Hsp20  30.77 
 
 
139 aa  74.3  0.0000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.334288  normal  0.643075 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1127  heat shock protein Hsp20  34.59 
 
 
142 aa  74.3  0.0000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2532  HSP20 family protein  31.21 
 
 
144 aa  73.9  0.0000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3788  heat shock protein Hsp20  27.33 
 
 
144 aa  73.6  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1029  Hsp20/alpha crystallin family protein  35.71 
 
 
146 aa  73.2  0.000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00339514  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3612  hypothetical protein  35.78 
 
 
177 aa  73.2  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0197  heat shock protein Hsp20  37.17 
 
 
147 aa  73.2  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0542117 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6093  heat shock protein Hsp20  32.82 
 
 
187 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2635  heat shock protein Hsp20  28.85 
 
 
148 aa  72  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2210  heat shock protein Hsp20  32.33 
 
 
139 aa  72.4  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0417447  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4819  heat shock protein Hsp20  28.57 
 
 
146 aa  72.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.414421 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6390  heat shock protein Hsp20  32.82 
 
 
187 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.065602 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3468  heat shock protein Hsp20  28.85 
 
 
148 aa  72  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.282569  normal  0.556723 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2188  heat shock protein Hsp20  34.82 
 
 
156 aa  71.6  0.000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.345525  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4812  heat shock protein Hsp20  30.48 
 
 
155 aa  71.6  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00238667  normal  0.807841 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0838  heat shock protein Hsp20  34.86 
 
 
162 aa  71.6  0.000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0102  heat shock protein Hsp20  34.21 
 
 
142 aa  71.6  0.000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3312  heat shock protein, putative  36.63 
 
 
129 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.267805  normal  0.275059 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2212  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
171 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0865  heat shock protein Hsp20  31.25 
 
 
134 aa  71.6  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.303654  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2600  putative heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
187 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.207676  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3125  heat shock protein Hsp20  40.86 
 
 
149 aa  70.9  0.000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2122  heat shock protein Hsp20  30.91 
 
 
180 aa  71.2  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.451471 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1292  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
170 aa  71.2  0.000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0518729  normal  0.504399 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6892  heat shock protein Hsp20  33.08 
 
 
157 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.862152  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0539  heat shock protein Hsp20  38.68 
 
 
161 aa  70.9  0.000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6439  heat shock protein Hsp20  34.59 
 
 
153 aa  70.9  0.000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.024706  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2578  putative heat shock protein  31.06 
 
 
185 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2860  heat shock protein Hsp20  31.72 
 
 
184 aa  70.9  0.000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793853  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0954  Hsp20/alpha crystallin family protein  34.65 
 
 
162 aa  70.5  0.000000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.154946  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2132  heat shock protein Hsp20  34.68 
 
 
164 aa  70.5  0.000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.585874 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5491  heat shock protein Hsp20  34.62 
 
 
211 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.710483  normal  0.352797 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0836  heat shock protein Hsp20  34.58 
 
 
143 aa  70.1  0.000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.534587  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20170  heat shock protein Hsp20  35.29 
 
 
177 aa  70.1  0.000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.638214  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1983  heat shock protein Hsp20  37.74 
 
 
153 aa  70.1  0.000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00684856  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  36 
 
 
147 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4352  heat shock protein Hsp20  33.64 
 
 
145 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.735936  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1320  Hsp20/alpha crystallin family protein  33.33 
 
 
151 aa  70.1  0.00000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1434  low molecular weight heat shock protein  33.33 
 
 
160 aa  69.7  0.00000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1262  small heat shock protein  33.33 
 
 
151 aa  70.1  0.00000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.753574  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1365  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
160 aa  69.7  0.00000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.117276  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0530  HSP20 family protein  36.7 
 
 
145 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3047  HSP20 family protein  36.7 
 
 
145 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1572  HSP20 family protein  36.7 
 
 
215 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.537516  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0788  heat shock protein Hsp20  33.64 
 
 
143 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.351008  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0833  heat shock protein Hsp20  37.5 
 
 
169 aa  68.9  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3903  heat shock protein Hsp20  37.04 
 
 
194 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.534424 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>