More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2326 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_2326  heat shock protein Hsp20  100 
 
 
144 aa  289  1e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0663504 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2899  heat shock protein Hsp20  45.14 
 
 
145 aa  136  1e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0174584 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3917  heat shock protein Hsp20  45 
 
 
142 aa  108  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6319  heat shock protein Hsp20  44.68 
 
 
149 aa  108  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3751  response regulator receiver protein  41.84 
 
 
150 aa  105  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.544355  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0836  heat shock protein Hsp20  40.43 
 
 
149 aa  105  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.414458 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5151  heat shock protein Hsp20  41.22 
 
 
148 aa  104  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0184623  normal  0.32984 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6221  heat shock protein Hsp20  38.71 
 
 
151 aa  99.4  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06090  small heat shock protein  45.45 
 
 
148 aa  97.4  6e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.473161  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4413  heat shock protein Hsp20  39.13 
 
 
150 aa  94.4  5e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0370  heat shock protein Hsp20  40.27 
 
 
140 aa  88.6  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.733353  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0233  small heat shock protein  38.24 
 
 
145 aa  86.7  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.818598  normal  0.0970629 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  34.48 
 
 
148 aa  85.5  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1697  hypothetical protein  45.87 
 
 
145 aa  82.8  0.000000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2022  heat shock protein Hsp20  34.31 
 
 
141 aa  81.6  0.000000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0762  heat shock protein Hsp20  42.72 
 
 
134 aa  81.3  0.000000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2559  hypothetical protein  33.86 
 
 
164 aa  80.1  0.000000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1977  heat shock protein Hsp20  34.59 
 
 
139 aa  79.7  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.334288  normal  0.643075 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0200  heat shock protein Hsp20  31.72 
 
 
176 aa  79.3  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.377048  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0622  HSP20 family protein  41.35 
 
 
132 aa  78.6  0.00000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0788  heat shock protein Hsp20  34.29 
 
 
143 aa  78.6  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.351008  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2210  heat shock protein Hsp20  36.51 
 
 
139 aa  78.6  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0417447  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2938  heat shock protein Hsp20  37.9 
 
 
145 aa  77.8  0.00000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000491843  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2414  hypothetical protein  33.07 
 
 
164 aa  77  0.00000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4132  heat shock protein Hsp20  36.7 
 
 
144 aa  77  0.00000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4766  heat shock protein Hsp20  38.68 
 
 
163 aa  76.6  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000408851  hitchhiker  0.00874264 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1892  HSP20 family protein  38.1 
 
 
132 aa  75.5  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.684879  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3788  heat shock protein Hsp20  30.2 
 
 
144 aa  75.5  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1543  heat shock protein Hsp20  36.89 
 
 
146 aa  75.5  0.0000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000494204  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0774  heat shock protein Hsp20  33.86 
 
 
139 aa  75.1  0.0000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0865  heat shock protein Hsp20  37.86 
 
 
134 aa  74.7  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.303654  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3078  heat shock protein Hsp20  29.66 
 
 
145 aa  74.7  0.0000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000700712  normal  0.0754711 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0836  heat shock protein Hsp20  31.43 
 
 
143 aa  74.3  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.534587  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  32.81 
 
 
146 aa  73.9  0.0000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  32.81 
 
 
146 aa  73.9  0.0000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20170  heat shock protein Hsp20  31.78 
 
 
177 aa  73.6  0.0000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.638214  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0391  heat shock protein Hsp20  38.1 
 
 
143 aa  73.6  0.0000000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000478859  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4061  heat shock protein Hsp20  31.01 
 
 
147 aa  72.8  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4023  heat shock protein Hsp20  31.01 
 
 
147 aa  72.8  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2287  heat shock protein Hsp20  38.54 
 
 
189 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3080  heat shock protein Hsp20  33.64 
 
 
230 aa  72.8  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2860  heat shock protein Hsp20  35.85 
 
 
184 aa  73.2  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793853  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2522  heat shock protein Hsp20  33.58 
 
 
150 aa  72.8  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2957  HSP20 family protein  33.33 
 
 
143 aa  72.8  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1127  heat shock protein Hsp20  38.68 
 
 
142 aa  72.4  0.000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4951  heat shock protein Hsp20  38.89 
 
 
134 aa  72  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.260746  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1695  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
151 aa  72  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1029  Hsp20/alpha crystallin family protein  30 
 
 
146 aa  71.2  0.000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00339514  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3394  heat shock protein Hsp20  38.24 
 
 
189 aa  71.2  0.000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219016  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2049  heat shock protein Hsp20  29.31 
 
 
164 aa  71.2  0.000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0000140473  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4528  heat shock protein Hsp20  29.08 
 
 
181 aa  70.5  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.550609  normal  0.0462291 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4395  heat shock protein Hsp20  29.08 
 
 
181 aa  70.5  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.481666  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  30.88 
 
 
147 aa  70.1  0.000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4352  heat shock protein Hsp20  29.73 
 
 
145 aa  70.1  0.000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.735936  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4819  heat shock protein Hsp20  30.77 
 
 
146 aa  70.1  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.414421 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3234  HSP20 family protein  30.15 
 
 
231 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0197  heat shock protein Hsp20  35.42 
 
 
147 aa  69.3  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0542117 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4507  heat shock protein Hsp20  28.83 
 
 
145 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4488  heat shock protein Hsp20  28.83 
 
 
145 aa  69.7  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2460  heat shock protein Hsp20  30.15 
 
 
186 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0031555  normal  0.623789 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1434  low molecular weight heat shock protein  30.77 
 
 
160 aa  68.9  0.00000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2316  heat shock protein Hsp20  32.54 
 
 
139 aa  69.3  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0611291  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4342  heat shock protein Hsp20  35.42 
 
 
147 aa  68.9  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.204531 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1365  heat shock protein Hsp20  30.77 
 
 
160 aa  68.9  0.00000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.117276  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0289  heat shock protein Hsp20  34.35 
 
 
148 aa  69.3  0.00000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0247001  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0183  heat shock protein Hsp20  39.36 
 
 
132 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0939501  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2836  heat shock protein Hsp20  30.53 
 
 
197 aa  68.2  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00556978  normal  0.209218 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  30.95 
 
 
147 aa  68.6  0.00000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  28.77 
 
 
147 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2188  heat shock protein Hsp20  27.83 
 
 
156 aa  67.8  0.00000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.345525  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0580  heat shock protein Hsp20  38.1 
 
 
145 aa  67.8  0.00000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000199173  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2635  heat shock protein Hsp20  31.93 
 
 
148 aa  67.8  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02640  low molecular weight heat shock protein  30.77 
 
 
158 aa  67.4  0.00000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4128  heat shock protein Hsp20  28.93 
 
 
154 aa  67.4  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.226976  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4812  heat shock protein Hsp20  30.17 
 
 
155 aa  67.4  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00238667  normal  0.807841 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1171  heat shock protein Hsp20  36.46 
 
 
189 aa  67  0.00000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.726376  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0629  heat shock protein Hsp20  36.46 
 
 
189 aa  67  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.185609 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0125  heat shock protein Hsp20  37.23 
 
 
139 aa  67  0.00000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.369397  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3612  hypothetical protein  29.25 
 
 
177 aa  67  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2320  heat shock protein Hsp20  32.14 
 
 
149 aa  67  0.00000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3680  heat shock protein Hsp20  26.57 
 
 
185 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.626967 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3468  heat shock protein Hsp20  31.09 
 
 
148 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.282569  normal  0.556723 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0369  HSP20 family protein  33.33 
 
 
153 aa  66.2  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.93231e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  30.95 
 
 
147 aa  66.6  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3724  heat shock protein Hsp20  26.57 
 
 
185 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1917  heat shock protein Hsp20  32.31 
 
 
156 aa  66.6  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86534  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2159  heat shock protein Hsp20  37.04 
 
 
139 aa  66.6  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0146906  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2027  heat shock protein Hsp20  36.36 
 
 
155 aa  65.9  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3412  small HspC2 heat shock protein  35.71 
 
 
189 aa  65.9  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.260583  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2409  HSP20 family protein  36.79 
 
 
132 aa  65.5  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.996502  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4499  heat shock protein Hsp20  27.13 
 
 
145 aa  65.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.100268 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2178  putative small heat shock protein  32.11 
 
 
130 aa  65.1  0.0000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0513  heat shock protein Hsp20  31.2 
 
 
147 aa  65.5  0.0000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0936  heat shock protein Hsp20  30.83 
 
 
155 aa  65.1  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.172536  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0383  heat shock protein Hsp20  30.53 
 
 
166 aa  65.5  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.170778  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0320  heat shock protein Hsp20  36.19 
 
 
150 aa  65.5  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2678  HSP20 family protein  30.19 
 
 
151 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1366  heat shock protein Hsp20  29.17 
 
 
176 aa  64.7  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.74874  normal  0.190619 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1762  heat shock protein Hsp20  35.35 
 
 
144 aa  64.7  0.0000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1010  heat shock protein Hsp20  29.41 
 
 
153 aa  64.7  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00224234  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>