More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_2178 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_2178  putative small heat shock protein  100 
 
 
130 aa  263  5e-70  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2525  putative small heat shock protein  79.07 
 
 
130 aa  212  1.9999999999999998e-54  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.586363  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3076  heat shock protein Hsp20  32.88 
 
 
173 aa  76.6  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3788  heat shock protein Hsp20  30.71 
 
 
144 aa  70.1  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2678  HSP20 family protein  33.02 
 
 
151 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3612  hypothetical protein  34.29 
 
 
177 aa  65.9  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2522  heat shock protein Hsp20  32.99 
 
 
150 aa  65.9  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2122  heat shock protein Hsp20  33.65 
 
 
180 aa  64.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.451471 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4061  heat shock protein Hsp20  30.08 
 
 
147 aa  64.3  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4023  heat shock protein Hsp20  30.08 
 
 
147 aa  64.3  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4819  heat shock protein Hsp20  31.06 
 
 
146 aa  64.3  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.414421 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0143  heat shock protein Hsp20  29.37 
 
 
156 aa  63.2  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1347  heat shock protein Hsp20  29.59 
 
 
148 aa  62.8  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.452932  normal  0.819182 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1296  heat shock protein Hsp20  31.82 
 
 
143 aa  62  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1648  heat shock protein, Hsp20 family  29.59 
 
 
148 aa  62.8  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.715277  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0588  heat shock protein, molecular chaperone  37.63 
 
 
141 aa  62.4  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.648467  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2796  heat shock protein  32.26 
 
 
152 aa  62.8  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.300285  normal  0.746249 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2049  heat shock protein Hsp20  31.91 
 
 
164 aa  62.4  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0000140473  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4887  heat shock protein Hsp20  33.62 
 
 
142 aa  61.2  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3661  heat shock protein Hsp20  37.17 
 
 
157 aa  61.2  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2635  heat shock protein Hsp20  30.43 
 
 
195 aa  60.8  0.000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000662159  normal  0.965311 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_825  HSP20/alpha crystallin  29.57 
 
 
162 aa  60.8  0.000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4812  heat shock protein Hsp20  32.98 
 
 
155 aa  60.8  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00238667  normal  0.807841 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0982  HSP20 family protein  29.25 
 
 
176 aa  60.5  0.000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  28.43 
 
 
148 aa  60.5  0.000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3659  heat shock protein Hsp20  28.7 
 
 
158 aa  60.5  0.000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.701015  normal  0.191586 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2657  heat shock protein Hsp20  30.77 
 
 
155 aa  60.5  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.498697  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0954  Hsp20/alpha crystallin family protein  29.25 
 
 
162 aa  59.7  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.154946  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3582  heat shock protein Hsp20  29.52 
 
 
166 aa  60.1  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3739  heat shock protein Hsp20  35.71 
 
 
182 aa  59.3  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0809036 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1698  heat shock protein Hsp20  34.48 
 
 
155 aa  58.9  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.010449 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1010  heat shock protein Hsp20  26.4 
 
 
153 aa  58.9  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00224234  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1631  heat shock protein Hsp20  28.93 
 
 
128 aa  58.2  0.00000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0200  heat shock protein Hsp20  30.48 
 
 
176 aa  58.5  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.377048  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2643  heat shock protein Hsp20  34.95 
 
 
151 aa  58.5  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.840862  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2276  heat shock protein Hsp20  28.18 
 
 
175 aa  58.5  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2120  heat shock protein Hsp20  40 
 
 
139 aa  58.5  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0258725  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0838  heat shock protein Hsp20  29.57 
 
 
162 aa  58.2  0.00000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1806  heat shock protein Hsp20  32.26 
 
 
139 aa  58.2  0.00000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.332989  normal  0.066583 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2401  heat shock protein Hsp20  30.48 
 
 
163 aa  57.8  0.00000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000662378  hitchhiker  0.00157329 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3170  Molecular chaperone (small heat shock protein)- like protein  29.46 
 
 
155 aa  57.8  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.257744  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0267  heat shock protein Hsp20  36.17 
 
 
148 aa  57.8  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.216974 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0247  heat shock protein Hsp20  36.17 
 
 
148 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0257  heat shock protein Hsp20  36.17 
 
 
148 aa  57.8  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.739506  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6439  heat shock protein Hsp20  29.25 
 
 
153 aa  57.4  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.024706  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0599  heat shock protein Hsp20  27.68 
 
 
176 aa  57.4  0.00000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.187967  normal  0.122676 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3573  heat shock protein Hsp20  33.06 
 
 
144 aa  57  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2326  heat shock protein Hsp20  32.11 
 
 
144 aa  57  0.00000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0663504 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1706  heat shock protein Hsp20  28.57 
 
 
132 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00808314  hitchhiker  0.000432661 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1824  heat shock protein Hsp20  28.95 
 
 
146 aa  56.6  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0843989  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2809  heat shock protein Hsp20  36.04 
 
 
149 aa  56.2  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00105088  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4128  heat shock protein Hsp20  28.57 
 
 
154 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.226976  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2460  heat shock protein Hsp20  28.68 
 
 
186 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0031555  normal  0.623789 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4766  heat shock protein Hsp20  27.88 
 
 
163 aa  56.6  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000408851  hitchhiker  0.00874264 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1076  heat shock protein Hsp20  31.07 
 
 
148 aa  56.6  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.713568  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3774  heat shock protein Hsp20  36.56 
 
 
132 aa  55.5  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3234  HSP20 family protein  28.68 
 
 
231 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4488  heat shock protein Hsp20  28.85 
 
 
145 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0836  heat shock protein Hsp20  27.97 
 
 
143 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.534587  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2312  heat shock protein Hsp20  34.48 
 
 
149 aa  55.8  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1573  heat shock protein Hsp20  24.53 
 
 
173 aa  55.8  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00130938  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1892  HSP20 family protein  28.46 
 
 
132 aa  56.2  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.684879  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  30.77 
 
 
147 aa  55.5  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1262  small heat shock protein  30.28 
 
 
151 aa  55.8  0.0000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.753574  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0891  heat shock protein Hsp20  30.58 
 
 
127 aa  55.8  0.0000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.337031 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2320  heat shock protein Hsp20  25.98 
 
 
149 aa  56.2  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1320  Hsp20/alpha crystallin family protein  30.28 
 
 
151 aa  55.8  0.0000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3448  heat shock protein Hsp20  32.85 
 
 
142 aa  55.8  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3666  heat shock protein Hsp20  36.56 
 
 
132 aa  55.5  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0021013  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2188  heat shock protein Hsp20  29.52 
 
 
156 aa  55.8  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.345525  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7807  Hsp20 family heat-shock protein  27.62 
 
 
127 aa  55.1  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00129467  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0924  heat shock protein  26.92 
 
 
180 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3063  heat shock protein Hsp20  32.95 
 
 
158 aa  55.1  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.89361 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0289  heat shock protein Hsp20  33.64 
 
 
148 aa  55.1  0.0000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0247001  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12068  heat shock protein hspX  40.24 
 
 
144 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3074  heat shock protein Hsp20  28.04 
 
 
144 aa  54.7  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0370  heat shock protein Hsp20  26.17 
 
 
140 aa  54.7  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.733353  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  29.81 
 
 
147 aa  54.3  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0788  heat shock protein Hsp20  34.04 
 
 
143 aa  54.7  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.351008  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1127  heat shock protein Hsp20  30.77 
 
 
142 aa  54.3  0.0000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1437  heat shock protein Hsp20  26.72 
 
 
128 aa  54.3  0.0000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1818  heat shock protein Hsp20  29.75 
 
 
128 aa  53.9  0.0000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.507911 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  25 
 
 
147 aa  53.9  0.0000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4669  heat shock protein Hsp20  28.57 
 
 
147 aa  53.9  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3941  heat shock protein Hsp20  36.08 
 
 
186 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3461  heat shock protein Hsp20  27.88 
 
 
122 aa  53.9  0.0000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.798121  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1307  heat shock protein Hsp20  33.65 
 
 
143 aa  53.9  0.0000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3468  heat shock protein Hsp20  26.92 
 
 
148 aa  53.9  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.282569  normal  0.556723 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3061  heat shock protein Hsp20  31.82 
 
 
158 aa  53.9  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.301699 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1979  heat shock protein Hsp20  28.32 
 
 
129 aa  53.9  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00000641758  hitchhiker  0.000000531995 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  25 
 
 
147 aa  53.5  0.0000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2579  putative low molecular weight heat shock protein, Hsp20-related  32.58 
 
 
137 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2635  heat shock protein Hsp20  26.92 
 
 
148 aa  53.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2303  heat shock protein Hsp20  31.48 
 
 
137 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.270736 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3917  heat shock protein Hsp20  26.6 
 
 
142 aa  53.1  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0369  HSP20 family protein  32.95 
 
 
153 aa  53.1  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.93231e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4395  heat shock protein Hsp20  25.56 
 
 
181 aa  53.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.481666  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2022  heat shock protein Hsp20  28.85 
 
 
141 aa  53.1  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1429  heat shock protein Hsp20  25.71 
 
 
169 aa  53.1  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2365  heat shock protein Hsp20  29.79 
 
 
135 aa  53.1  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.181504  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>