295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4951 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_4951  heat shock protein Hsp20  100 
 
 
134 aa  280  6.000000000000001e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.260746  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5151  heat shock protein Hsp20  44.21 
 
 
148 aa  75.9  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0184623  normal  0.32984 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6221  heat shock protein Hsp20  40 
 
 
151 aa  75.9  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3917  heat shock protein Hsp20  42.39 
 
 
142 aa  75.9  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3751  response regulator receiver protein  38.76 
 
 
150 aa  74.3  0.0000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.544355  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2027  heat shock protein Hsp20  36.04 
 
 
155 aa  74.3  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0370  heat shock protein Hsp20  35.77 
 
 
140 aa  72.4  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.733353  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4413  heat shock protein Hsp20  39.39 
 
 
150 aa  72.4  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06090  small heat shock protein  39.56 
 
 
148 aa  70.9  0.000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.473161  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0836  heat shock protein Hsp20  36.09 
 
 
149 aa  68.6  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.414458 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6319  heat shock protein Hsp20  43.81 
 
 
149 aa  68.6  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2326  heat shock protein Hsp20  37.04 
 
 
144 aa  64.7  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0663504 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2899  heat shock protein Hsp20  35.19 
 
 
145 aa  63.2  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0174584 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  34.29 
 
 
148 aa  60.1  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1543  heat shock protein Hsp20  31.97 
 
 
146 aa  59.3  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000494204  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  29.91 
 
 
146 aa  58.2  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  29.91 
 
 
146 aa  58.2  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4132  heat shock protein Hsp20  30.21 
 
 
144 aa  57  0.00000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2312  heat shock protein Hsp20  29.36 
 
 
149 aa  57  0.00000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3125  heat shock protein Hsp20  35.16 
 
 
149 aa  55.8  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1292  heat shock protein Hsp20  29.63 
 
 
170 aa  55.5  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0518729  normal  0.504399 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3580  molecular chaperone (small heat shock protein)  31.82 
 
 
141 aa  55.5  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0513  heat shock protein Hsp20  30.28 
 
 
147 aa  54.7  0.0000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4943  heat shock protein Hsp20  28.83 
 
 
149 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0508199 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0720  heat shock protein Hsp20  28.85 
 
 
120 aa  54.3  0.0000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00436062  normal  0.512737 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0610  heat shock protein Hsp20  32 
 
 
136 aa  53.9  0.0000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.335952  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5150  heat shock protein Hsp20  30.77 
 
 
146 aa  53.9  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16210  heat shock protein Hsp20  29.35 
 
 
163 aa  53.9  0.0000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.221164  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1533  heat shock protein Hsp20  28.23 
 
 
140 aa  53.5  0.0000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.207706  normal  0.208575 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2602  Hsp20 family heat-shock protein  30.53 
 
 
118 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0249408  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2409  HSP20 family protein  30.53 
 
 
132 aa  52.8  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.996502  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1697  hypothetical protein  31.48 
 
 
145 aa  52.8  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1806  heat shock protein Hsp20  29.59 
 
 
139 aa  53.1  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.332989  normal  0.066583 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2938  heat shock protein Hsp20  32.97 
 
 
145 aa  53.1  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000491843  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0233  small heat shock protein  35.16 
 
 
145 aa  53.1  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.818598  normal  0.0970629 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3078  heat shock protein Hsp20  32.65 
 
 
145 aa  53.1  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000700712  normal  0.0754711 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1059  stress response protein  27.84 
 
 
144 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3093  heat shock protein  27.84 
 
 
144 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2035  stress response protein  27.84 
 
 
144 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3219  heat shock protein  27.84 
 
 
144 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0197  heat shock protein Hsp20  28.3 
 
 
147 aa  52.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0542117 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1432  HSP20/alpha crystallin family protein  27.84 
 
 
144 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.614633  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0622  HSP20 family protein  31.07 
 
 
132 aa  52.4  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1345  stress response protein  27.84 
 
 
144 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.260788  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4157  heat shock protein Hsp20  28.44 
 
 
150 aa  52.8  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2325  stress response protein  27.84 
 
 
141 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.908249  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0774  heat shock protein Hsp20  26.92 
 
 
139 aa  52  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3113  heat shock protein Hsp20  28.7 
 
 
142 aa  52  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.800815  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  29.75 
 
 
147 aa  52  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4669  heat shock protein Hsp20  27.47 
 
 
147 aa  51.6  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1869  putative small heat shock protein  26.92 
 
 
142 aa  52  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.309197  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0102  heat shock protein Hsp20  29.66 
 
 
142 aa  51.6  0.000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0391  heat shock protein Hsp20  33.67 
 
 
143 aa  51.2  0.000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000478859  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1892  HSP20 family protein  29.81 
 
 
132 aa  51.6  0.000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.684879  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2809  HSP20 family protein  31.52 
 
 
146 aa  51.6  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0002171  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1805  heat shock protein Hsp20  27.27 
 
 
149 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.642811  normal  0.803886 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4352  heat shock protein Hsp20  30.7 
 
 
145 aa  51.6  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.735936  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0463  heat shock protein Hsp20  28.28 
 
 
166 aa  51.6  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6388  heat shock protein Hsp20  31.87 
 
 
146 aa  51.6  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0687951 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6091  heat shock protein Hsp20  31.87 
 
 
146 aa  51.2  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  30.58 
 
 
147 aa  50.8  0.000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4488  heat shock protein Hsp20  30.7 
 
 
145 aa  51.2  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2063  heat shock protein Hsp20  24.27 
 
 
155 aa  50.8  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.21571  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4395  heat shock protein Hsp20  29.81 
 
 
181 aa  51.2  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.481666  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4467  heat shock protein Hsp20  28.57 
 
 
149 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.156372 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4528  heat shock protein Hsp20  29.81 
 
 
181 aa  51.2  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.550609  normal  0.0462291 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4380  heat shock protein Hsp20  28.57 
 
 
149 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.642417  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1142  heat shock protein Hsp20  31.46 
 
 
146 aa  51.2  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4761  heat shock protein Hsp20  28.57 
 
 
149 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.735655  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1154  heat shock protein Hsp20  31.46 
 
 
146 aa  50.8  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.408789 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4507  heat shock protein Hsp20  30.7 
 
 
145 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3424  HSP20 family protein  32.22 
 
 
146 aa  50.4  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3430  heat shock protein Hsp20  30.91 
 
 
147 aa  50.4  0.000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.240603  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3389  HSP20 family protein  32.22 
 
 
146 aa  50.4  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.134829  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3428  HSP20 family protein  32.22 
 
 
146 aa  50.4  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000574786  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2321  stress response protein  27.18 
 
 
513 aa  50.8  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1204  HSP20 family protein  32.22 
 
 
146 aa  50.4  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2580  putative small heat shock protein, Hsp20-related  31.46 
 
 
145 aa  50.8  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0343  HSP20 family protein  32.22 
 
 
146 aa  50.4  0.000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.439722  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3084  heat shock protein Hsp20  30.91 
 
 
147 aa  50.4  0.000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2615  HSP20 family protein  32.22 
 
 
146 aa  50.4  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.696707  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2316  heat shock protein Hsp20  31.46 
 
 
139 aa  50.4  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0611291  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0179  heat shock protein Hsp20  26 
 
 
149 aa  50.4  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4514  heat shock protein Hsp20  28.89 
 
 
140 aa  50.4  0.000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.165488  normal  0.480818 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0762  heat shock protein Hsp20  29.13 
 
 
134 aa  50.4  0.000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4342  heat shock protein Hsp20  28.3 
 
 
147 aa  50.4  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.204531 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2058  heat shock protein Hsp20  28.26 
 
 
141 aa  50.4  0.000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4382  heat shock protein Hsp20  28.89 
 
 
140 aa  50.4  0.000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1174  heat shock protein Hsp20  28 
 
 
139 aa  50.4  0.000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1725  heat shock protein Hsp20  31.37 
 
 
142 aa  50.1  0.000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2366  heat shock protein Hsp20  30.68 
 
 
151 aa  50.4  0.000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.550987  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0609  heat shock protein Hsp20  27 
 
 
156 aa  50.4  0.000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.346897  normal  0.0142886 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25770  heat shock Hsp20 protein  26.92 
 
 
198 aa  49.7  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0183  heat shock protein Hsp20  28.42 
 
 
132 aa  50.1  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0939501  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2022  heat shock protein Hsp20  32.04 
 
 
141 aa  50.1  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0454  heat shock protein Hsp20  28.43 
 
 
144 aa  50.1  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0320  heat shock protein Hsp20  26.56 
 
 
150 aa  50.1  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  30.84 
 
 
150 aa  49.7  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3047  HSP20 family protein  31.11 
 
 
145 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3905  heat shock protein Hsp20  31.18 
 
 
147 aa  49.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000984381  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>