More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6187 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010557  BamMC406_6187  heat shock protein Hsp20  100 
 
 		 144 aa  292  1e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.306682 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5914  heat shock protein Hsp20  93.75 
 
 		 144 aa  279  9e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0664313  normal  0.562292 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3219  heat shock protein  74.83 
 
 		 144 aa  218  3e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1432  HSP20/alpha crystallin family protein  74.83 
 
 		 144 aa  218  3e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.614633  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3093  heat shock protein  74.83 
 
 		 144 aa  218  3e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2035  stress response protein  74.13 
 
 		 144 aa  216  1e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1059  stress response protein  74.13 
 
 		 144 aa  216  1e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1345  stress response protein  74.13 
 
 		 144 aa  216  1e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.260788  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1110  heat shock protein Hsp20  72.41 
 
 		 145 aa  215  1e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.339847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2321  stress response protein  75 
 
 		 513 aa  212  1.9999999999999998e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2325  stress response protein  74.29 
 
 		 141 aa  211  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.908249  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1869  putative small heat shock protein  65.97 
 
 		 142 aa  197  3.9999999999999996e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.309197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4382  heat shock protein Hsp20  51.75 
 
 		 140 aa  157  6e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4514  heat shock protein Hsp20  51.75 
 
 		 140 aa  157  6e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.165488  normal  0.480818 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1149  heat shock protein Hsp20  51.75 
 
 		 140 aa  156  7e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1219  heat shock protein Hsp20  51.75 
 
 		 140 aa  156  7e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0200  putative small HEAT shock protein  51.05 
 
 		 140 aa  153  8e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.32202 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0630  heat shock protein Hsp20  51.03 
 
 		 138 aa  131  3e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.140987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3113  heat shock protein Hsp20  50.78 
 
 		 142 aa  124  3e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.800815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1165  heat shock protein Hsp20  48.65 
 
 		 145 aa  123  7e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.245253  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2301  heat shock protein Hsp20  50 
 
 		 142 aa  123  8.000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.46681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1292  heat shock protein Hsp20  46.97 
 
 		 170 aa  122  2e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0518729  normal  0.504399 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1537  heat shock protein Hsp20  44.44 
 
 		 142 aa  121  3e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2459  heat shock protein Hsp20  48.44 
 
 		 142 aa  120  7e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.134169  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2312  heat shock protein Hsp20  50 
 
 		 149 aa  119  9.999999999999999e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1199  heat shock protein Hsp20  47.41 
 
 		 143 aa  119  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.76992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2058  heat shock protein Hsp20  43.36 
 
 		 141 aa  106  9.000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1167  heat shock protein Hsp20  43.75 
 
 		 149 aa  105  2e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1370  small heat shock protein  42.57 
 
 		 144 aa  100  9e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0982961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1648  heat shock protein, Hsp20 family  37.96 
 
 		 148 aa  87.8  4e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.715277  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1347  heat shock protein Hsp20  37.96 
 
 		 148 aa  87.8  4e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.452932  normal  0.819182 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0383  heat shock protein Hsp20  40.95 
 
 		 158 aa  86.7  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3125  heat shock protein Hsp20  43.62 
 
 		 149 aa  82.4  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0445  heat shock protein Hsp20  33.58 
 
 		 150 aa  81.3  0.000000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2316  heat shock protein Hsp20  39.22 
 
 		 139 aa  80.9  0.000000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0611291  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1115  heat shock protein Hsp20  36.36 
 
 		 162 aa  81.3  0.000000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0741755  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1892  HSP20 family protein  36.04 
 
 		 132 aa  80.5  0.000000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.684879  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0588  heat shock protein, molecular chaperone  44.21 
 
 		 141 aa  80.1  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.648467  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1528  heat shock protein Hsp20  43.48 
 
 		 153 aa  79  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00309172  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0391  heat shock protein Hsp20  32.79 
 
 		 151 aa  78.2  0.00000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  34.33 
 
 		 150 aa  78.2  0.00000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0052  heat shock protein Hsp20  32.61 
 
 		 151 aa  78.2  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1695  heat shock protein Hsp20  36.13 
 
 		 151 aa  78.2  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0037  heat shock protein Hsp20  32.33 
 
 		 142 aa  78.2  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1396  molecular chaperone-like protein  38.46 
 
 		 152 aa  78.2  0.00000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.610569 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0289  heat shock protein Hsp20  33.61 
 
 		 148 aa  78.2  0.00000000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0247001  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1543  heat shock protein Hsp20  45.65 
 
 		 146 aa  77.8  0.00000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000494204  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0463  heat shock protein Hsp20  35.33 
 
 		 166 aa  77.4  0.00000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  38.46 
 
 		 147 aa  77.4  0.00000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3582  heat shock protein Hsp20  37.84 
 
 		 166 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0539  heat shock protein Hsp20  34.58 
 
 		 161 aa  75.1  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19940  molecular chaperone (small heat shock protein)  31.43 
 
 		 149 aa  75.1  0.0000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.618399  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2290  HSP20 family protein  32.37 
 
 		 145 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.581771  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2045  heat shock protein  33.09 
 
 		 145 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00409698  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2043  heat shock protein  33.09 
 
 		 145 aa  74.3  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467829  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2287  heat shock protein, Hsp20 family  33.09 
 
 		 145 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.58706e-24 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2505  heat shock protein Hsp20  31.58 
 
 		 138 aa  74.3  0.0000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.239492  normal  0.0462479 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2643  heat shock protein Hsp20  40.66 
 
 		 151 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.840862  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2372  heat shock protein, Hsp20 family  33.07 
 
 		 145 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0601479  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0762  heat shock protein Hsp20  38.46 
 
 		 134 aa  73.9  0.0000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0774  heat shock protein Hsp20  32.82 
 
 		 139 aa  73.6  0.0000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1660  heat shock protein Hsp20  30.43 
 
 		 145 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.870911  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2106  HSP20 family protein  33.09 
 
 		 145 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.291359  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1929  heat shock protein Hsp20  32.19 
 
 		 149 aa  72.8  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.638493  normal  0.0128011 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2262  HSP20 family protein  33.09 
 
 		 145 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.378643  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3076  heat shock protein Hsp20  34.38 
 
 		 148 aa  73.2  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1977  heat shock protein Hsp20  30.43 
 
 		 139 aa  72.4  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.334288  normal  0.643075 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1333  heat shock protein Hsp20  32.31 
 
 		 142 aa  72  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1573  heat shock protein Hsp20  36.89 
 
 		 173 aa  72  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00130938  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0369  HSP20 family protein  40.38 
 
 		 153 aa  72.8  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.93231e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2938  heat shock protein Hsp20  34.15 
 
 		 145 aa  72.4  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000491843  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0540  heat shock protein Hsp20  30.61 
 
 		 147 aa  72  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011771  BCAH820_C0008  Hsp  29.08 
 
 		 146 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3788  heat shock protein Hsp20  34.62 
 
 		 144 aa  72  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  34.78 
 
 		 146 aa  71.6  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0200  heat shock protein Hsp20  30.94 
 
 		 176 aa  71.6  0.000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.377048  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  34.78 
 
 		 146 aa  71.6  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3078  heat shock protein Hsp20  34.81 
 
 		 145 aa  71.6  0.000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000700712  normal  0.0754711 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2078  heat shock protein Hsp20  34.62 
 
 		 147 aa  71.2  0.000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2242  heat shock protein, Hsp20 family  33.07 
 
 		 145 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00889609  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4157  heat shock protein Hsp20  35.94 
 
 		 150 aa  71.6  0.000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1076  heat shock protein Hsp20  29.73 
 
 		 148 aa  70.9  0.000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.713568  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3386  heat shock protein Hsp20  32.64 
 
 		 147 aa  71.2  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2522  heat shock protein Hsp20  35.38 
 
 		 150 aa  71.2  0.000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1758  heat shock protein Hsp20  37.84 
 
 		 223 aa  70.9  0.000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1429  heat shock protein Hsp20  33.98 
 
 		 169 aa  70.5  0.000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2401  heat shock protein Hsp20  36.96 
 
 		 163 aa  70.1  0.000000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000662378  hitchhiker  0.00157329 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0622  HSP20 family protein  36.61 
 
 		 132 aa  69.7  0.00000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  30.88 
 
 		 147 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  30.53 
 
 		 149 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6439  heat shock protein Hsp20  32.64 
 
 		 153 aa  70.1  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.024706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3765  heat shock protein Hsp20  30.14 
 
 		 143 aa  69.7  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0610  heat shock protein Hsp20  30.2 
 
 		 136 aa  70.1  0.00000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.335952  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1806  heat shock protein Hsp20  35.81 
 
 		 139 aa  69.7  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.332989  normal  0.066583 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4943  heat shock protein Hsp20  31.21 
 
 		 149 aa  70.1  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0508199 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1509  heat shock protein Hsp20  35.29 
 
 		 148 aa  69.3  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000196437  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4819  heat shock protein Hsp20  33.58 
 
 		 146 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.414421 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0184  heat shock protein Hsp20  38.46 
 
 		 160 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.29101  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1706  heat shock protein Hsp20  35.92 
 
 		 132 aa  69.3  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00808314  hitchhiker  0.000432661 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2210  heat shock protein Hsp20  33.64 
 
 		 139 aa  68.9  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0417447  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>