More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_22940 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_22940  molecular chaperone (small heat shock protein)  100 
 
 
131 aa  265  2e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.558061  normal  0.436135 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12068  heat shock protein hspX  51.22 
 
 
144 aa  130  6e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2335  heat shock protein Hsp20  47.69 
 
 
142 aa  124  3e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.517765  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1374  heat shock protein Hsp20  47.46 
 
 
143 aa  122  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.2364  normal  0.511095 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1109  heat shock protein Hsp20  45.3 
 
 
143 aa  119  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.223131  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2809  heat shock protein Hsp20  44.2 
 
 
149 aa  117  4.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00105088  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1098  heat shock protein Hsp20  45.22 
 
 
143 aa  116  7.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.358342 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3941  heat shock protein Hsp20  48.08 
 
 
186 aa  106  9.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4816  Molecular chaperone (small heat shock protein)- like protein  42.28 
 
 
143 aa  105  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.59096  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2120  heat shock protein Hsp20  42.75 
 
 
139 aa  101  3e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0258725  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1698  heat shock protein Hsp20  40.91 
 
 
155 aa  94.4  5e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.010449 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3661  heat shock protein Hsp20  46.24 
 
 
157 aa  94  7e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1796  heat shock protein Hsp20  46 
 
 
157 aa  89  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0576694  normal  0.0264597 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0052  heat shock protein Hsp20  36.72 
 
 
151 aa  77  0.00000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3435  heat shock protein Hsp20  37.3 
 
 
131 aa  77  0.00000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0247  heat shock protein Hsp20  45.24 
 
 
148 aa  76.3  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0257  heat shock protein Hsp20  45.24 
 
 
148 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.739506  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0267  heat shock protein Hsp20  45.24 
 
 
148 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.216974 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3788  heat shock protein Hsp20  46 
 
 
144 aa  75.1  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3080  heat shock protein Hsp20  41.24 
 
 
230 aa  73.2  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2320  heat shock protein Hsp20  41.35 
 
 
149 aa  73.2  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4342  heat shock protein Hsp20  38.74 
 
 
147 aa  73.2  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.204531 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0296  heat shock protein Hsp20  39.33 
 
 
143 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3739  heat shock protein Hsp20  34.35 
 
 
182 aa  72.4  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0809036 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0179  heat shock protein Hsp20  40 
 
 
149 aa  72  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0609  heat shock protein Hsp20  41.24 
 
 
156 aa  72.4  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.346897  normal  0.0142886 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1010  heat shock protein Hsp20  42.42 
 
 
153 aa  72  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00224234  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2635  heat shock protein Hsp20  35.16 
 
 
195 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000662159  normal  0.965311 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0936  heat shock protein Hsp20  44.55 
 
 
155 aa  71.2  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.172536  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6439  heat shock protein Hsp20  32.03 
 
 
153 aa  70.9  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.024706  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2899  heat shock protein Hsp20  35.04 
 
 
145 aa  70.9  0.000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0174584 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0197  heat shock protein Hsp20  36.84 
 
 
147 aa  70.5  0.000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0542117 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10254  heat shock protein hsp (heat-stress-induced ribosome-binding protein A)  32.85 
 
 
159 aa  70.1  0.000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.024543 
 
 
-
 
NC_002936  DET0954  Hsp20/alpha crystallin family protein  36.8 
 
 
162 aa  69.7  0.00000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.154946  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2678  HSP20 family protein  38.28 
 
 
151 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2796  heat shock protein  38.38 
 
 
152 aa  69.7  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.300285  normal  0.746249 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_825  HSP20/alpha crystallin  36.8 
 
 
162 aa  70.1  0.00000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2210  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
139 aa  70.1  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0417447  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0160  heat shock protein Hsp20  37.37 
 
 
147 aa  70.1  0.00000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.248861  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4128  heat shock protein Hsp20  33.86 
 
 
154 aa  68.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.226976  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0306  heat shock protein Hsp20  36.36 
 
 
138 aa  69.3  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0420324 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4819  heat shock protein Hsp20  42.71 
 
 
146 aa  68.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.414421 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  40.21 
 
 
148 aa  68.9  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3765  heat shock protein Hsp20  35.16 
 
 
143 aa  68.2  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1543  heat shock protein Hsp20  34.38 
 
 
146 aa  68.6  0.00000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000494204  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  39.13 
 
 
149 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4761  heat shock protein Hsp20  38.38 
 
 
149 aa  67.8  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.735655  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4380  heat shock protein Hsp20  38.38 
 
 
149 aa  67.8  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.642417  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4467  heat shock protein Hsp20  38.38 
 
 
149 aa  67.8  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.156372 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2122  heat shock protein Hsp20  43.3 
 
 
180 aa  67.8  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.451471 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0369  HSP20 family protein  32.23 
 
 
153 aa  66.6  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.93231e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3412  small HspC2 heat shock protein  37.07 
 
 
189 aa  66.6  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.260583  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4131  heat shock protein Hsp20  31.63 
 
 
161 aa  66.2  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1977  heat shock protein Hsp20  30.23 
 
 
139 aa  65.5  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.334288  normal  0.643075 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2522  heat shock protein Hsp20  35.16 
 
 
150 aa  65.9  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0370  heat shock protein Hsp20  33.83 
 
 
140 aa  65.5  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.733353  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4943  heat shock protein Hsp20  36.73 
 
 
149 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0508199 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2078  heat shock protein Hsp20  33.06 
 
 
147 aa  65.9  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4463  heat shock protein Hsp20  38.3 
 
 
141 aa  65.9  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2250  heat shock protein Hsp20  35.35 
 
 
178 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1967  heat shock protein Hsp20  35.35 
 
 
178 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0388  heat shock protein Hsp20  38.04 
 
 
150 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.865112  normal  0.488414 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2132  heat shock protein Hsp20  32.03 
 
 
164 aa  65.1  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.585874 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2860  heat shock protein Hsp20  35.64 
 
 
184 aa  65.1  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793853  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5291  heat shock protein Hsp20  37 
 
 
199 aa  64.7  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.060881  normal  0.828695 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16210  heat shock protein Hsp20  32.06 
 
 
163 aa  64.3  0.0000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.221164  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0838  heat shock protein Hsp20  33.86 
 
 
162 aa  64.3  0.0000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0672  heat shock protein Hsp20  37.38 
 
 
159 aa  63.9  0.0000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000109595  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0540  heat shock protein Hsp20  32.52 
 
 
147 aa  63.5  0.0000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0629  heat shock protein Hsp20  36.21 
 
 
189 aa  63.9  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.185609 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2355  heat shock protein Hsp20  37.36 
 
 
165 aa  63.5  0.0000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20966  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2408  HSP20 family protein  37.01 
 
 
160 aa  63.2  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2559  hypothetical protein  32.59 
 
 
164 aa  63.2  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1370  small heat shock protein  34.15 
 
 
144 aa  62.8  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0982961  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  41.49 
 
 
147 aa  62.8  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0098  heat shock protein Hsp20  36.63 
 
 
168 aa  63.2  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3394  heat shock protein Hsp20  35.25 
 
 
189 aa  63.2  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219016  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1171  heat shock protein Hsp20  35.34 
 
 
189 aa  63.5  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.726376  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0383  heat shock protein Hsp20  31.82 
 
 
166 aa  63.2  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.170778  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2532  HSP20 family protein  39.58 
 
 
144 aa  62.4  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2212  heat shock protein Hsp20  32.31 
 
 
171 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0143  heat shock protein Hsp20  39 
 
 
156 aa  62.4  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2287  heat shock protein Hsp20  35.34 
 
 
189 aa  62  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1706  heat shock protein Hsp20  35.35 
 
 
132 aa  62  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00808314  hitchhiker  0.000432661 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  31.54 
 
 
147 aa  62.4  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1762  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
144 aa  62.4  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0391  heat shock protein Hsp20  34.59 
 
 
141 aa  62.4  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.854862  normal  0.714918 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2276  heat shock protein Hsp20  35.34 
 
 
175 aa  62.4  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  31.54 
 
 
147 aa  62  0.000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3680  heat shock protein Hsp20  30.85 
 
 
185 aa  62  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.626967 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3724  heat shock protein Hsp20  30.85 
 
 
185 aa  62  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3076  heat shock protein Hsp20  32.81 
 
 
173 aa  62  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0184  heat shock protein Hsp20  32.8 
 
 
160 aa  61.6  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.29101  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2578  putative heat shock protein  31.67 
 
 
185 aa  62  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3074  heat shock protein Hsp20  38.26 
 
 
144 aa  62  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3076  heat shock protein Hsp20  34.78 
 
 
148 aa  61.6  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  33.56 
 
 
147 aa  61.6  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1660  heat shock protein Hsp20  29.03 
 
 
145 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.870911  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1704  heat shock protein Hsp20  39.78 
 
 
140 aa  61.6  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3064  heat shock protein Hsp20  37.07 
 
 
166 aa  61.6  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.898255 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>