More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0358 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0358  Hsp20-like molecular chaperone  100 
 
 		 134 aa  267  2.9999999999999997e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2409  HSP20 family protein  48.06 
 
 		 132 aa  131  3.9999999999999996e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.996502  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3666  heat shock protein Hsp20  47.29 
 
 		 132 aa  124  3e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0021013  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3774  heat shock protein Hsp20  47.29 
 
 		 132 aa  124  4.0000000000000003e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0314  heat shock protein Hsp20  46.55 
 
 		 132 aa  124  5e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0183  heat shock protein Hsp20  44.19 
 
 		 132 aa  122  1e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0939501  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2959  heat shock protein Hsp20  43.66 
 
 		 143 aa  102  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.167076 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1344  HSP20 family protein  41.74 
 
 		 121 aa  93.2  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.624294  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2642  heat shock protein Hsp20  38.81 
 
 		 134 aa  93.2  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1973  heat shock protein Hsp20  38.28 
 
 		 139 aa  87.4  6e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.287455  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0792  heat shock protein Hsp20  43.93 
 
 		 117 aa  86.3  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.198377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2365  heat shock protein Hsp20  35.07 
 
 		 135 aa  85.1  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.181504  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2532  HSP20 family protein  40.95 
 
 		 144 aa  84.3  4e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1743  heat shock protein Hsp20  37.31 
 
 		 132 aa  84.3  5e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.174126  hitchhiker  0.00103153 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3461  heat shock protein Hsp20  40 
 
 		 122 aa  84  6e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.798121  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  38.1 
 
 		 148 aa  84  7e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0720  heat shock protein Hsp20  35.83 
 
 		 120 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00436062  normal  0.512737 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4649  heat shock protein Hsp20  37.23 
 
 		 137 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.54341  normal  0.729236 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1824  heat shock protein Hsp20  41.75 
 
 		 146 aa  82  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0843989  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1731  HSP20 family protein  35.25 
 
 		 126 aa  81.6  0.000000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.13098  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0125  heat shock protein Hsp20  36.07 
 
 		 139 aa  81.6  0.000000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.369397  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2957  HSP20 family protein  40.78 
 
 		 143 aa  79.3  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1174  heat shock protein Hsp20  37.5 
 
 		 139 aa  79  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5151  heat shock protein Hsp20  35.71 
 
 		 148 aa  79.3  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0184623  normal  0.32984 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2043  putative heat shock protein  36.36 
 
 		 127 aa  78.6  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.778686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0390  heat shock protein Hsp20  37.74 
 
 		 130 aa  77.8  0.00000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.833766  normal  0.703561 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1324  heat shock protein Hsp20  38.33 
 
 		 195 aa  77.4  0.00000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.317374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1474  heat shock protein Hsp20  42.86 
 
 		 151 aa  76.3  0.0000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.242626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02640  low molecular weight heat shock protein  34.55 
 
 		 158 aa  76.6  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2730  heat shock protein Hsp20  37.5 
 
 		 148 aa  76.6  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5151  heat shock protein Hsp20  34.09 
 
 		 135 aa  75.5  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2601  Hsp20 family heat-shock protein  34.56 
 
 		 135 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0188281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3255  heat shock protein Hsp20  32.48 
 
 		 132 aa  75.9  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1434  low molecular weight heat shock protein  33.64 
 
 		 160 aa  75.1  0.0000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1365  heat shock protein Hsp20  33.64 
 
 		 160 aa  75.1  0.0000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.117276  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6253  heat shock protein Hsp20  36.17 
 
 		 141 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.101875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5261  heat shock protein Hsp20  39.05 
 
 		 135 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.071325 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0342  HSP20 family protein  39.81 
 
 		 162 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.187953  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3431  heat shock protein Hsp20  35.34 
 
 		 139 aa  74.7  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.349992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1203  HSP20 family protein  39.81 
 
 		 139 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2427  HSP20 family protein  39.81 
 
 		 139 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4462  heat shock protein Hsp20  36 
 
 		 132 aa  74.7  0.0000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3427  HSP20 family protein  39.81 
 
 		 139 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000520104  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2614  HSP20 family protein  39.81 
 
 		 139 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.484892  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3423  HSP20 family protein  39.81 
 
 		 139 aa  74.7  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3388  HSP20 family protein  39.81 
 
 		 139 aa  74.7  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0799527  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6420  heat shock protein Hsp20  39.05 
 
 		 146 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6655  heat shock protein Hsp20  39.05 
 
 		 146 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.381902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3376  heat shock protein Hsp20  38 
 
 		 130 aa  74.3  0.0000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0623  heat shock protein Hsp20  39.42 
 
 		 152 aa  73.9  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.844177  normal  0.400233 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0403  heat shock protein Hsp20  40 
 
 		 138 aa  73.9  0.0000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0982  HSP20 family protein  30.77 
 
 		 176 aa  73.9  0.0000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2477  heat shock protein Hsp20  37.86 
 
 		 143 aa  73.2  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3085  heat shock protein Hsp20  34.48 
 
 		 139 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  32.79 
 
 		 147 aa  73.6  0.000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2022  heat shock protein Hsp20  36.89 
 
 		 141 aa  73.2  0.000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4761  heat shock protein Hsp20  36.89 
 
 		 149 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.735655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  36.89 
 
 		 149 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4467  heat shock protein Hsp20  36.89 
 
 		 149 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.156372 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  31.97 
 
 		 147 aa  72.4  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4380  heat shock protein Hsp20  36.89 
 
 		 149 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.642417  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4235  heat shock protein Hsp20  37.04 
 
 		 143 aa  72.4  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.283869  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7806  putative small heat-shock protein molecular chaperone  37.84 
 
 		 146 aa  71.6  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00540773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0513  heat shock protein Hsp20  36.19 
 
 		 147 aa  71.6  0.000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  36.63 
 
 		 146 aa  71.6  0.000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  36.63 
 
 		 146 aa  71.6  0.000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3751  response regulator receiver protein  35.78 
 
 		 150 aa  70.9  0.000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.544355  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06090  small heat shock protein  34.23 
 
 		 148 aa  71.2  0.000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.473161  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6389  heat shock protein Hsp20  34.58 
 
 		 135 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0663133 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3313  heat shock protein, putative  32.08 
 
 		 123 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.257763  normal  0.279554 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2132  heat shock protein Hsp20  34.55 
 
 		 164 aa  70.9  0.000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.585874 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0052  heat shock protein Hsp20  34.95 
 
 		 151 aa  70.9  0.000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0320  heat shock protein Hsp20  38.68 
 
 		 150 aa  70.9  0.000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4766  heat shock protein Hsp20  37.38 
 
 		 163 aa  70.5  0.000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000408851  hitchhiker  0.00874264 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0926  heat shock protein Hsp20  39.39 
 
 		 152 aa  70.1  0.000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3905  heat shock protein Hsp20  35.92 
 
 		 147 aa  70.1  0.000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000984381  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3256  heat shock protein Hsp20  31.67 
 
 		 153 aa  70.1  0.000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0505  heat shock protein Hsp20  38.1 
 
 		 158 aa  70.1  0.000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1029  Hsp20/alpha crystallin family protein  35.19 
 
 		 146 aa  69.3  0.00000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00339514  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6092  heat shock protein Hsp20  32.79 
 
 		 135 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4499  heat shock protein Hsp20  36.79 
 
 		 145 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.100268 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2683  heat shock protein Hsp20  36.84 
 
 		 145 aa  68.9  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338339  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0369  HSP20 family protein  38.1 
 
 		 153 aa  69.3  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.93231e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1762  heat shock protein Hsp20  31.67 
 
 		 144 aa  69.3  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2810  HSP20 family protein  34.91 
 
 		 131 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0175635  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4119  heat shock protein Hsp20  36.89 
 
 		 149 aa  68.9  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00303961 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6221  heat shock protein Hsp20  38.54 
 
 		 151 aa  69.3  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3582  heat shock protein Hsp20  34.55 
 
 		 166 aa  69.3  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0529  HSP20 family protein  34.31 
 
 		 133 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  37.86 
 
 		 147 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4463  heat shock protein Hsp20  35.71 
 
 		 141 aa  68.6  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1246  HSP20 family protein  34.31 
 
 		 133 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0625  HSP20 family protein  34.31 
 
 		 133 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3386  heat shock protein Hsp20  36.89 
 
 		 147 aa  68.6  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1697  hypothetical protein  29.51 
 
 		 145 aa  68.6  0.00000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1929  heat shock protein Hsp20  34.95 
 
 		 149 aa  68.6  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.638493  normal  0.0128011 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1440  HSP20 family protein  34.31 
 
 		 133 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0891  heat shock protein Hsp20  39.22 
 
 		 137 aa  68.6  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.805469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6319  heat shock protein Hsp20  34.86 
 
 		 149 aa  68.2  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1289  Molecular chaperone (small heat shock protein)- like protein  36.28 
 
 		 148 aa  68.2  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.747018 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>