30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1488 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_1488  hypothetical protein  100 
 
 
340 aa  691    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.560243  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0336  hypothetical protein  30.43 
 
 
229 aa  79.3  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.705551 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2833  heat shock protein Hsp20  28.66 
 
 
183 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0053  hypothetical protein  31.25 
 
 
204 aa  73.2  0.000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0647937  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0695  hypothetical protein  32.59 
 
 
183 aa  68.9  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.756333  normal  0.812325 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1812  hypothetical protein  32.45 
 
 
170 aa  65.9  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3021  heat shock protein HSP20  41.25 
 
 
176 aa  60.5  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1620  heat shock protein Hsp20  23.97 
 
 
175 aa  56.2  0.0000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.192454  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0537  heat shock protein Hsp20  23.81 
 
 
173 aa  56.2  0.0000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0220395 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0640  heat shock protein Hsp20  24.07 
 
 
170 aa  55.8  0.0000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.402449  normal  0.271447 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0231  heat shock protein Hsp20  28.89 
 
 
176 aa  53.5  0.000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0447  heat shock protein Hsp20  38.16 
 
 
171 aa  52.4  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1246  heat shock protein, HSP20 family protein  31.25 
 
 
177 aa  52  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.143675  normal  0.0444206 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1657  heat shock protein Hsp20  23.49 
 
 
174 aa  52.4  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.760781 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1494  hypothetical protein  32 
 
 
184 aa  52  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.911601  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1810  heat shock protein Hsp20  29.11 
 
 
176 aa  52  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1856  heat shock protein Hsp20  29.11 
 
 
176 aa  49.7  0.00006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2547  putative heat shock protein  33.33 
 
 
132 aa  49.7  0.00007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.837495  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0160  heat shock protein Hsp20  30.21 
 
 
147 aa  49.3  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.248861  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0805  heat shock protein Hsp20  34.18 
 
 
195 aa  48.9  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0800  small heat shock protein (HSP20-1)  28.91 
 
 
147 aa  48.5  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.581704  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0446  heat shock protein Hsp20  27.17 
 
 
151 aa  48.1  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.281567  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1294  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
123 aa  47  0.0005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1529  hypothetical protein  29.33 
 
 
92 aa  45.1  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.000112944  normal  0.727714 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0859  heat shock protein Hsp20  28.97 
 
 
134 aa  45.1  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.340245 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0285  heat shock protein Hsp20  25.61 
 
 
133 aa  44.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1429  heat shock protein Hsp20  28.89 
 
 
169 aa  44.3  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2704  heat shock protein Hsp20  35.71 
 
 
145 aa  43.9  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.923873  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0658  heat shock protein Hsp20  23.86 
 
 
130 aa  43.5  0.006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0907  putative heat shock protein  27.63 
 
 
175 aa  42.7  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.606312  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>