94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1812 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_1812  hypothetical protein  100 
 
 
170 aa  333  7e-91  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0695  hypothetical protein  64.86 
 
 
183 aa  180  8.000000000000001e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.756333  normal  0.812325 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2833  heat shock protein Hsp20  46.95 
 
 
183 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3021  heat shock protein HSP20  37.79 
 
 
176 aa  107  9.000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1246  heat shock protein, HSP20 family protein  37.04 
 
 
177 aa  107  1e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.143675  normal  0.0444206 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0640  heat shock protein Hsp20  42.86 
 
 
170 aa  97.1  1e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.402449  normal  0.271447 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0231  heat shock protein Hsp20  41.23 
 
 
176 aa  89.7  2e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1856  heat shock protein Hsp20  43.9 
 
 
176 aa  88.2  5e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1494  hypothetical protein  34.12 
 
 
184 aa  84.7  5e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.911601  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1620  heat shock protein Hsp20  33.09 
 
 
175 aa  76.6  0.0000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.192454  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0447  heat shock protein Hsp20  38.53 
 
 
171 aa  76.3  0.0000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1488  hypothetical protein  32.45 
 
 
340 aa  75.5  0.0000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.560243  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1657  heat shock protein Hsp20  33.91 
 
 
174 aa  74.7  0.0000000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.760781 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0907  putative heat shock protein  36.13 
 
 
175 aa  73.9  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.606312  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0537  heat shock protein Hsp20  33.04 
 
 
173 aa  73.6  0.000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0220395 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1810  heat shock protein Hsp20  33.91 
 
 
176 aa  72.8  0.000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0010  heat shock protein HSP20  33.83 
 
 
163 aa  65.1  0.0000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0805  heat shock protein Hsp20  33.58 
 
 
195 aa  64.3  0.0000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0906  hypothetical protein  30.4 
 
 
165 aa  64.3  0.0000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0942345  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1492  heat shock protein Hsp20  32.17 
 
 
182 aa  58.2  0.00000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0053  hypothetical protein  32.22 
 
 
204 aa  55.1  0.0000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0647937  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2564  heat shock protein Hsp20  29.87 
 
 
123 aa  54.3  0.0000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0336  hypothetical protein  39.47 
 
 
229 aa  52.4  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.705551 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0982  HSP20 family protein  32.98 
 
 
176 aa  49.7  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0285  heat shock protein Hsp20  30.43 
 
 
133 aa  48.9  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3577  heat shock protein Hsp20  27.91 
 
 
157 aa  48.9  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.202692  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2547  putative heat shock protein  30.43 
 
 
132 aa  47.8  0.00007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.837495  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0369  HSP20 family protein  32.61 
 
 
153 aa  47.8  0.00008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.93231e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0675  heat shock protein Hsp20  26.55 
 
 
163 aa  47.8  0.00008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000000558694  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0406  heat shock protein Hsp20  30.11 
 
 
137 aa  47.4  0.00008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0194442  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3173  heat shock protein Hsp20  31.17 
 
 
227 aa  47.4  0.00009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.327314  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2957  HSP20 family protein  30.43 
 
 
143 aa  47  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2140  heat shock protein Hsp20  28.99 
 
 
133 aa  47  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  34.78 
 
 
147 aa  47.4  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3063  heat shock protein Hsp20  25.55 
 
 
158 aa  46.2  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.89361 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2279  HSP20 family protein  29.35 
 
 
153 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000417657  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0658  heat shock protein Hsp20  26.03 
 
 
130 aa  46.2  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2250  heat shock protein Hsp20  31.46 
 
 
178 aa  46.2  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1967  heat shock protein Hsp20  31.46 
 
 
178 aa  45.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6892  heat shock protein Hsp20  25.2 
 
 
157 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.862152  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  34.78 
 
 
147 aa  46.6  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2320  heat shock protein Hsp20  26.85 
 
 
149 aa  46.2  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2094  HSP20 family protein  29.35 
 
 
153 aa  45.8  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.016336  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2073  heat shock protein Hsp20  29.79 
 
 
155 aa  45.4  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00430311  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2250  HSP20 family protein  29.35 
 
 
153 aa  45.8  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000163363  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1986  heat shock protein Hsp20  26.83 
 
 
156 aa  45.4  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2360  heat shock protein, Hsp20 family  29.03 
 
 
154 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000177338  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2232  heat shock protein, Hsp20 family  29.03 
 
 
154 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00154952  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3092  heat shock protein, Hsp20 family  29.35 
 
 
153 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000535786  decreased coverage  5.9903300000000006e-24 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1651  heat shock protein Hsp20  29.35 
 
 
155 aa  45.8  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000431905  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2275  heat shock protein, Hsp20 family  29.35 
 
 
153 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.79952e-50 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2032  heat shock protein  29.35 
 
 
153 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000873203  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2034  heat shock protein  29.35 
 
 
153 aa  45.8  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000604095  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0838  heat shock protein Hsp20  36.96 
 
 
162 aa  45.8  0.0003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3080  heat shock protein Hsp20  24.44 
 
 
230 aa  45.1  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6104  heat shock protein Hsp20  26.47 
 
 
158 aa  45.4  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0249434 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3061  heat shock protein Hsp20  24.82 
 
 
158 aa  44.7  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.301699 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5491  heat shock protein Hsp20  26.02 
 
 
211 aa  44.7  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.710483  normal  0.352797 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1010  heat shock protein Hsp20  27.47 
 
 
153 aa  44.7  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00224234  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2678  HSP20 family protein  31.52 
 
 
151 aa  44.7  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2532  HSP20 family protein  29.47 
 
 
144 aa  44.7  0.0007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0200  heat shock protein Hsp20  27.17 
 
 
176 aa  44.3  0.0007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.377048  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0954  Hsp20/alpha crystallin family protein  34.04 
 
 
162 aa  43.5  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.154946  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_825  HSP20/alpha crystallin  34.04 
 
 
162 aa  43.5  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2287  heat shock protein Hsp20  28.26 
 
 
189 aa  43.5  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3074  heat shock protein Hsp20  23.64 
 
 
144 aa  43.5  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4463  heat shock protein Hsp20  28.26 
 
 
141 aa  43.5  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4859  heat shock protein Hsp20  28.57 
 
 
204 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2477  heat shock protein Hsp20  26.09 
 
 
143 aa  43.1  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0629  heat shock protein Hsp20  28.26 
 
 
189 aa  43.1  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.185609 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2522  heat shock protein Hsp20  27.35 
 
 
150 aa  42.7  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0735  heat shock protein Hsp20  29.35 
 
 
145 aa  43.1  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000037192  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1543  heat shock protein Hsp20  29.21 
 
 
146 aa  43.1  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000494204  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1122  heat shock protein Hsp20  32.22 
 
 
170 aa  42.7  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.421321  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0445  heat shock protein Hsp20  24.46 
 
 
150 aa  42.4  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1429  heat shock protein Hsp20  30.43 
 
 
169 aa  42.7  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1983  heat shock protein Hsp20  25.53 
 
 
153 aa  42.4  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00684856  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2863  heat shock protein Hsp20  25.84 
 
 
167 aa  42.4  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.203152  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2022  heat shock protein Hsp20  27.78 
 
 
144 aa  42  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.12456  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2798  small HspC2 heat shock protein  27.17 
 
 
189 aa  42  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.159343  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1171  heat shock protein Hsp20  27.17 
 
 
189 aa  42  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.726376  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3582  heat shock protein Hsp20  23.4 
 
 
166 aa  42  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1806  small heat shock protein  26.8 
 
 
152 aa  42  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1320  Hsp20/alpha crystallin family protein  28.87 
 
 
151 aa  42  0.004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1738  small HspC2 heat shock protein  27.17 
 
 
189 aa  42  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.267785  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1262  small heat shock protein  28.87 
 
 
151 aa  42  0.004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.753574  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3394  heat shock protein Hsp20  28.26 
 
 
189 aa  42  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219016  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2642  heat shock protein Hsp20  23.3 
 
 
134 aa  41.6  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0391  heat shock protein Hsp20  28.24 
 
 
141 aa  41.6  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.854862  normal  0.714918 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0859  heat shock protein Hsp20  29.35 
 
 
153 aa  41.6  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2370  HSP20 type chaperone  23.29 
 
 
125 aa  41.2  0.007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.40451 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0580  heat shock protein Hsp20  30.43 
 
 
145 aa  41.2  0.008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000199173  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3064  heat shock protein Hsp20  23.91 
 
 
166 aa  40.8  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.898255 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  24.73 
 
 
147 aa  40.8  0.009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>