114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2370 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_2370  HSP20 type chaperone  100 
 
 
125 aa  249  1e-65  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.40451 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2140  heat shock protein Hsp20  58.65 
 
 
133 aa  151  2e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0285  heat shock protein Hsp20  59.4 
 
 
133 aa  151  2.9999999999999998e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2547  putative heat shock protein  50.86 
 
 
132 aa  112  2.0000000000000002e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.837495  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0658  heat shock protein Hsp20  51.75 
 
 
130 aa  111  3e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0640  heat shock protein Hsp20  40.48 
 
 
170 aa  73.2  0.000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.402449  normal  0.271447 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0907  putative heat shock protein  39.53 
 
 
175 aa  65.1  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.606312  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0231  heat shock protein Hsp20  35 
 
 
176 aa  60.8  0.000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2444  putative heat shock protein  41.89 
 
 
175 aa  59.7  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0537  heat shock protein Hsp20  40.85 
 
 
173 aa  59.7  0.00000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0220395 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1810  heat shock protein Hsp20  36.84 
 
 
176 aa  58.9  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1620  heat shock protein Hsp20  38.03 
 
 
175 aa  57.8  0.00000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.192454  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1856  heat shock protein Hsp20  32.94 
 
 
176 aa  57.4  0.00000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0906  hypothetical protein  32.14 
 
 
165 aa  57  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0942345  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1657  heat shock protein Hsp20  35 
 
 
174 aa  56.6  0.0000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.760781 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1370  small heat shock protein  27.74 
 
 
144 aa  55.1  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0982961  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1492  heat shock protein Hsp20  40.79 
 
 
182 aa  52.4  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2063  heat shock protein Hsp20  29.13 
 
 
155 aa  52.8  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.21571  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1076  heat shock protein Hsp20  31.4 
 
 
148 aa  52.8  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.713568  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1494  hypothetical protein  35.71 
 
 
184 aa  52  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.911601  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0010  heat shock protein HSP20  30.21 
 
 
163 aa  51.2  0.000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0447  heat shock protein Hsp20  31.18 
 
 
171 aa  50.4  0.000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0154  heat shock protein Hsp20  30.2 
 
 
156 aa  49.7  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.184978  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0454  heat shock protein Hsp20  27.86 
 
 
144 aa  50.1  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4118  heat shock protein Hsp20  30.4 
 
 
172 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.513744 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1758  heat shock protein Hsp20  32.56 
 
 
223 aa  48.9  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2074  heat shock protein Hsp20  29.84 
 
 
173 aa  48.1  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.145284  normal  0.308358 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6388  heat shock protein Hsp20  30.08 
 
 
146 aa  48.1  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0687951 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1651  heat shock protein Hsp20  27.73 
 
 
155 aa  48.1  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000431905  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6091  heat shock protein Hsp20  30.08 
 
 
146 aa  48.1  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3021  heat shock protein HSP20  28.4 
 
 
176 aa  47.8  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2833  heat shock protein Hsp20  28.57 
 
 
183 aa  47.4  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0203  heat shock protein Hsp20  24.18 
 
 
154 aa  47.8  0.00006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0102  heat shock protein Hsp20  31.71 
 
 
142 aa  47.4  0.00007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1366  heat shock protein Hsp20  28.79 
 
 
176 aa  47.4  0.00007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.74874  normal  0.190619 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5150  heat shock protein Hsp20  29.32 
 
 
146 aa  46.2  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0472  heat shock protein Hsp20  34.92 
 
 
115 aa  46.2  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00129647  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1708  heat shock protein HSP20  24.18 
 
 
154 aa  46.2  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.563674  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4859  heat shock protein Hsp20  26.52 
 
 
204 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0805  heat shock protein Hsp20  29.79 
 
 
195 aa  45.8  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0460  heat shock protein Hsp20  26.61 
 
 
155 aa  45.8  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0892  heat shock protein Hsp20  24.18 
 
 
154 aa  45.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1508  heat shock protein Hsp20  22.93 
 
 
154 aa  45.4  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0438643  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0836  heat shock protein Hsp20  27.13 
 
 
143 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.534587  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  26.15 
 
 
150 aa  45.8  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2207  heat shock protein Hsp20  26.36 
 
 
129 aa  45.4  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.540832  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2279  HSP20 family protein  24.58 
 
 
153 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000417657  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2094  HSP20 family protein  24.58 
 
 
153 aa  45.1  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.016336  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2034  heat shock protein  24.58 
 
 
153 aa  45.1  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000604095  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2032  heat shock protein  24.58 
 
 
153 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000873203  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1149  heat shock protein Hsp20  27.91 
 
 
140 aa  45.1  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1219  heat shock protein Hsp20  27.91 
 
 
140 aa  45.1  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2250  HSP20 family protein  24.58 
 
 
153 aa  45.1  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000163363  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3074  heat shock protein Hsp20  29.66 
 
 
144 aa  44.7  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5262  heat shock protein Hsp20  28.46 
 
 
146 aa  44.7  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.100267 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3092  heat shock protein, Hsp20 family  24.58 
 
 
153 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000535786  decreased coverage  5.9903300000000006e-24 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2275  heat shock protein, Hsp20 family  24.58 
 
 
153 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.79952e-50 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3725  heat shock protein Hsp20  27.94 
 
 
143 aa  44.7  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.843054  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1725  heat shock protein Hsp20  24.41 
 
 
142 aa  44.7  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0788  heat shock protein Hsp20  25.95 
 
 
143 aa  44.3  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.351008  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2360  heat shock protein, Hsp20 family  24.37 
 
 
154 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000177338  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2232  heat shock protein, Hsp20 family  24.37 
 
 
154 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00154952  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1543  heat shock protein Hsp20  29.79 
 
 
146 aa  43.9  0.0007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000494204  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3903  heat shock protein Hsp20  25 
 
 
194 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.534424 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3667  heat shock protein Hsp20  28.78 
 
 
139 aa  43.9  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1806  small heat shock protein  30.61 
 
 
152 aa  43.5  0.0009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0982  HSP20 family protein  26.12 
 
 
176 aa  43.1  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4635  heat shock protein Hsp20  25.18 
 
 
169 aa  43.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2073  heat shock protein Hsp20  24.17 
 
 
155 aa  43.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00430311  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4382  heat shock protein Hsp20  27.66 
 
 
140 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3430  heat shock protein Hsp20  26.4 
 
 
147 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.240603  normal 
 
 
-
 
NC_011771  BCAH820_C0008  Hsp  30.3 
 
 
146 aa  42.7  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3084  heat shock protein Hsp20  26.4 
 
 
147 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4514  heat shock protein Hsp20  27.66 
 
 
140 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.165488  normal  0.480818 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0521  heat shock protein Hsp20  24.64 
 
 
154 aa  43.5  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2940  heat shock protein Hsp20  24.29 
 
 
168 aa  42.7  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0675  heat shock protein Hsp20  28.35 
 
 
163 aa  42.7  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000000558694  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1562  small heat shock protein (HSP20-1)  36.99 
 
 
150 aa  42.7  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0406  heat shock protein Hsp20  26.56 
 
 
137 aa  42.4  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0194442  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0047  heat shock protein Hsp20  28.87 
 
 
148 aa  42.4  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.333015  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3680  heat shock protein Hsp20  27.01 
 
 
185 aa  42.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.626967 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3724  heat shock protein Hsp20  27.01 
 
 
185 aa  42.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0735  heat shock protein Hsp20  26.52 
 
 
145 aa  42.7  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000037192  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1347  heat shock protein Hsp20  24.81 
 
 
148 aa  42  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.452932  normal  0.819182 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1648  heat shock protein, Hsp20 family  24.81 
 
 
148 aa  42  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.715277  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2022  heat shock protein Hsp20  24.81 
 
 
141 aa  41.6  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0505  heat shock protein Hsp20  24.44 
 
 
158 aa  42  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1704  heat shock protein Hsp20  27.14 
 
 
140 aa  41.6  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0037  heat shock protein Hsp20  27.59 
 
 
142 aa  42  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3518  heat shock protein Hsp20  32.31 
 
 
123 aa  41.6  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0593  heat shock protein Hsp20  31.03 
 
 
191 aa  41.2  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.95349  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0695  hypothetical protein  21.92 
 
 
183 aa  41.6  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.756333  normal  0.812325 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2321  stress response protein  23.26 
 
 
513 aa  41.6  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0383  heat shock protein Hsp20  26.72 
 
 
166 aa  41.6  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.170778  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3336  heat shock protein Hsp20  32.29 
 
 
191 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5733  heat shock protein Hsp20  26.92 
 
 
146 aa  41.6  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.384471  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2132  heat shock protein Hsp20  27.34 
 
 
164 aa  41.6  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.585874 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2532  HSP20 family protein  27.34 
 
 
144 aa  41.2  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2320  heat shock protein Hsp20  29.46 
 
 
149 aa  41.2  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2366  heat shock protein Hsp20  25 
 
 
151 aa  41.2  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.550987  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>