198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0892 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0892  heat shock protein Hsp20  100 
 
 
154 aa  302  1.0000000000000001e-81  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0203  heat shock protein Hsp20  98.7 
 
 
154 aa  299  9e-81  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1708  heat shock protein HSP20  96.1 
 
 
154 aa  293  4e-79  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.563674  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1508  heat shock protein Hsp20  79.22 
 
 
154 aa  252  1.0000000000000001e-66  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0438643  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0047  heat shock protein Hsp20  59.74 
 
 
148 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.333015  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0859  heat shock protein Hsp20  33.79 
 
 
153 aa  64.7  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2097  heat shock protein Hsp20  30.71 
 
 
155 aa  61.6  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0640  heat shock protein Hsp20  30.5 
 
 
170 aa  58.5  0.00000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.402449  normal  0.271447 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0463  heat shock protein Hsp20  28.39 
 
 
166 aa  57  0.00000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0231  heat shock protein Hsp20  35.92 
 
 
176 aa  56.2  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0406  heat shock protein Hsp20  31.21 
 
 
137 aa  55.8  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0194442  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2410  HSP20 family protein  27.69 
 
 
149 aa  54.7  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.731962  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3773  heat shock protein Hsp20  26.92 
 
 
148 aa  54.7  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3665  heat shock protein Hsp20  26.15 
 
 
148 aa  53.9  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0142367  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  30.2 
 
 
150 aa  53.5  0.0000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0926  heat shock protein Hsp20  27.07 
 
 
152 aa  53.5  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3113  heat shock protein Hsp20  30.87 
 
 
142 aa  53.1  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.800815  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0285  heat shock protein Hsp20  29.68 
 
 
133 aa  52.4  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2035  stress response protein  28.77 
 
 
144 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1122  heat shock protein Hsp20  33.99 
 
 
170 aa  52  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.421321  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5194  heat shock protein Hsp20  30.43 
 
 
169 aa  52.4  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0987038  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1059  stress response protein  28.77 
 
 
144 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1345  stress response protein  28.77 
 
 
144 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.260788  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2325  stress response protein  28.77 
 
 
141 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.908249  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1432  HSP20/alpha crystallin family protein  28.77 
 
 
144 aa  51.6  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.614633  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2459  heat shock protein Hsp20  30.87 
 
 
142 aa  51.6  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.134169  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3219  heat shock protein  28.77 
 
 
144 aa  51.6  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3093  heat shock protein  28.77 
 
 
144 aa  51.6  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1657  heat shock protein Hsp20  34.65 
 
 
174 aa  51.6  0.000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.760781 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1929  heat shock protein Hsp20  25.48 
 
 
149 aa  51.6  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.638493  normal  0.0128011 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4859  heat shock protein Hsp20  30.3 
 
 
204 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1708  heat shock protein Hsp20  32.38 
 
 
126 aa  50.8  0.000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.151748 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0907  putative heat shock protein  27.53 
 
 
175 aa  50.8  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.606312  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2321  stress response protein  31.43 
 
 
513 aa  50.8  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3751  response regulator receiver protein  23.08 
 
 
150 aa  50.4  0.000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.544355  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0580  heat shock protein Hsp20  33.87 
 
 
145 aa  50.1  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000199173  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2401  heat shock protein Hsp20  27.27 
 
 
163 aa  49.7  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000662378  hitchhiker  0.00157329 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1810  heat shock protein Hsp20  34.65 
 
 
176 aa  49.7  0.00001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4157  heat shock protein Hsp20  29.01 
 
 
150 aa  49.7  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2643  heat shock protein Hsp20  29.25 
 
 
151 aa  49.7  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.840862  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4812  heat shock protein Hsp20  30.36 
 
 
155 aa  48.9  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00238667  normal  0.807841 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0182  heat shock protein Hsp20  25.58 
 
 
149 aa  48.9  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0138231  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4118  heat shock protein Hsp20  31.3 
 
 
172 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.513744 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0537  heat shock protein Hsp20  33.66 
 
 
173 aa  48.9  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0220395 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  33.66 
 
 
148 aa  49.7  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2411  heat shock protein Hsp20  32.33 
 
 
145 aa  49.3  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2458  heat shock protein Hsp20  32.33 
 
 
145 aa  49.3  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0539  heat shock protein Hsp20  31.13 
 
 
161 aa  48.9  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0344  heat shock protein Hsp20  25.34 
 
 
141 aa  48.9  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.727239  normal  0.120456 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0383  heat shock protein Hsp20  30 
 
 
158 aa  48.1  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1869  putative small heat shock protein  26.49 
 
 
142 aa  48.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.309197  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3667  heat shock protein Hsp20  31.09 
 
 
139 aa  48.1  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  30.97 
 
 
146 aa  47.8  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  30.97 
 
 
146 aa  47.8  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1543  heat shock protein Hsp20  29.75 
 
 
146 aa  47.8  0.00005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000494204  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0445  heat shock protein Hsp20  28.07 
 
 
150 aa  47.8  0.00005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0504  heat shock protein Hsp20  26.8 
 
 
152 aa  47.8  0.00006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.5396  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4119  heat shock protein Hsp20  24.84 
 
 
149 aa  47.8  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00303961 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0982  HSP20 family protein  26.13 
 
 
176 aa  47.4  0.00007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4380  heat shock protein Hsp20  30.28 
 
 
149 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.642417  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4467  heat shock protein Hsp20  30.28 
 
 
149 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.156372 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1292  heat shock protein Hsp20  32.61 
 
 
170 aa  47.4  0.00007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0518729  normal  0.504399 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1856  heat shock protein Hsp20  28.87 
 
 
176 aa  47.4  0.00007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4761  heat shock protein Hsp20  30.28 
 
 
149 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.735655  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3241  heat shock protein Hsp20  32.43 
 
 
166 aa  47.4  0.00008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.406826  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6187  heat shock protein Hsp20  30.85 
 
 
144 aa  47  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.306682 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2212  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
171 aa  47  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3903  heat shock protein Hsp20  28.28 
 
 
194 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.534424 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2140  heat shock protein Hsp20  27.27 
 
 
133 aa  46.6  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1806  small heat shock protein  28.38 
 
 
152 aa  47  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3428  HSP20 family protein  24.79 
 
 
146 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000574786  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1573  heat shock protein Hsp20  25.85 
 
 
173 aa  46.6  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00130938  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1235  heat shock protein Hsp20  25.98 
 
 
146 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.346981  normal  0.252455 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1983  heat shock protein Hsp20  28.95 
 
 
153 aa  47  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00684856  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0782  heat shock protein Hsp20  25.98 
 
 
146 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1142  heat shock protein Hsp20  26.53 
 
 
146 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2063  heat shock protein Hsp20  28.3 
 
 
155 aa  47  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.21571  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1263  heat shock protein Hsp20  25.98 
 
 
146 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.095432  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0658  heat shock protein Hsp20  28.12 
 
 
130 aa  46.6  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0836  heat shock protein Hsp20  25.6 
 
 
149 aa  46.6  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.414458 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4943  heat shock protein Hsp20  32.11 
 
 
149 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0508199 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0343  HSP20 family protein  24.79 
 
 
146 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.439722  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1204  HSP20 family protein  24.79 
 
 
146 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3389  HSP20 family protein  24.79 
 
 
146 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.134829  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2055  heat shock protein Hsp20  26.53 
 
 
146 aa  46.6  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3424  HSP20 family protein  24.79 
 
 
146 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2615  HSP20 family protein  24.79 
 
 
146 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.696707  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4413  heat shock protein Hsp20  22.58 
 
 
150 aa  46.6  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7806  putative small heat-shock protein molecular chaperone  31.13 
 
 
146 aa  47  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00540773  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3336  heat shock protein Hsp20  31.43 
 
 
191 aa  45.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2122  heat shock protein Hsp20  27.27 
 
 
180 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.451471 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2370  HSP20 type chaperone  24.18 
 
 
125 aa  45.8  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.40451 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1429  heat shock protein Hsp20  24.77 
 
 
169 aa  45.8  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2074  heat shock protein Hsp20  26.24 
 
 
173 aa  45.4  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.145284  normal  0.308358 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2132  heat shock protein Hsp20  27.43 
 
 
164 aa  45.4  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.585874 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2355  heat shock protein Hsp20  27.89 
 
 
165 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20966  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1324  heat shock protein Hsp20  28.16 
 
 
195 aa  46.2  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.317374  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6654  heat shock protein Hsp20  25.93 
 
 
147 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.344847  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6093  heat shock protein Hsp20  25.66 
 
 
187 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3146  heat shock protein Hsp20  29.25 
 
 
167 aa  45.1  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.754957 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>