More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0640 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_0640  heat shock protein Hsp20  100 
 
 
170 aa  333  5e-91  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.402449  normal  0.271447 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0231  heat shock protein Hsp20  61.93 
 
 
176 aa  184  6e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1620  heat shock protein Hsp20  46.5 
 
 
175 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.192454  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1810  heat shock protein Hsp20  45.12 
 
 
176 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1856  heat shock protein Hsp20  50.78 
 
 
176 aa  128  5.0000000000000004e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1657  heat shock protein Hsp20  46.88 
 
 
174 aa  127  6e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.760781 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0537  heat shock protein Hsp20  47.02 
 
 
173 aa  127  8.000000000000001e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0220395 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0010  heat shock protein HSP20  44.91 
 
 
163 aa  122  2e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1492  heat shock protein Hsp20  50.68 
 
 
182 aa  120  7e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0447  heat shock protein Hsp20  43.42 
 
 
171 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2833  heat shock protein Hsp20  50.86 
 
 
183 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0805  heat shock protein Hsp20  40 
 
 
195 aa  108  5e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0907  putative heat shock protein  34.09 
 
 
175 aa  102  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.606312  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0695  hypothetical protein  38.17 
 
 
183 aa  92.4  3e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.756333  normal  0.812325 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0906  hypothetical protein  35.22 
 
 
165 aa  88.6  4e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0942345  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1812  hypothetical protein  42.86 
 
 
170 aa  87.8  7e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3021  heat shock protein HSP20  38.26 
 
 
176 aa  83.2  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0658  heat shock protein Hsp20  41.9 
 
 
130 aa  82.4  0.000000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0285  heat shock protein Hsp20  47.5 
 
 
133 aa  80.5  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2547  putative heat shock protein  43.37 
 
 
132 aa  78.6  0.00000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.837495  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2444  putative heat shock protein  31.71 
 
 
175 aa  78.6  0.00000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2140  heat shock protein Hsp20  46.25 
 
 
133 aa  78.2  0.00000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1246  heat shock protein, HSP20 family protein  34.75 
 
 
177 aa  73.6  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.143675  normal  0.0444206 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0982  HSP20 family protein  37.17 
 
 
176 aa  73.2  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2370  HSP20 type chaperone  40.48 
 
 
125 aa  73.2  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.40451 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1494  hypothetical protein  38.71 
 
 
184 aa  72  0.000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.911601  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1083  hypothetical protein  36.36 
 
 
183 aa  66.6  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1806  small heat shock protein  33.33 
 
 
152 aa  62.4  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1543  heat shock protein Hsp20  37.5 
 
 
146 aa  62  0.000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000494204  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1869  putative small heat shock protein  38.24 
 
 
142 aa  62  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.309197  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  32.69 
 
 
150 aa  61.2  0.000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6892  heat shock protein Hsp20  31.58 
 
 
157 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.862152  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0203  heat shock protein Hsp20  35.29 
 
 
154 aa  59.3  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0047  heat shock protein Hsp20  33.01 
 
 
148 aa  59.3  0.00000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.333015  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0580  heat shock protein Hsp20  34.62 
 
 
145 aa  58.9  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000199173  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1708  heat shock protein HSP20  35.29 
 
 
154 aa  58.5  0.00000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.563674  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0892  heat shock protein Hsp20  30.71 
 
 
154 aa  58.5  0.00000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2321  stress response protein  33.33 
 
 
513 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0369  HSP20 family protein  33.65 
 
 
153 aa  58.2  0.00000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.93231e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5491  heat shock protein Hsp20  31.03 
 
 
211 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.710483  normal  0.352797 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1508  heat shock protein Hsp20  31.37 
 
 
154 aa  57.8  0.00000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0438643  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1488  hypothetical protein  23.29 
 
 
340 aa  56.6  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.560243  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3882  heat shock protein Hsp20  27.88 
 
 
158 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.545217  normal  0.180827 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1986  heat shock protein Hsp20  29.28 
 
 
156 aa  56.6  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0154  heat shock protein Hsp20  33.98 
 
 
156 aa  56.2  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.184978  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0472  heat shock protein Hsp20  40.54 
 
 
115 aa  56.6  0.0000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00129647  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4118  heat shock protein Hsp20  30.36 
 
 
172 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.513744 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2035  stress response protein  34.31 
 
 
144 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1059  stress response protein  34.31 
 
 
144 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0629  heat shock protein Hsp20  25.47 
 
 
189 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.185609 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2325  stress response protein  34.31 
 
 
141 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.908249  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1432  HSP20/alpha crystallin family protein  34.31 
 
 
144 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.614633  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1573  heat shock protein Hsp20  34.62 
 
 
173 aa  55.8  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00130938  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1345  stress response protein  34.31 
 
 
144 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.260788  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1171  heat shock protein Hsp20  27.27 
 
 
189 aa  55.8  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.726376  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3219  heat shock protein  34.31 
 
 
144 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0389  heat shock protein Hsp20  29.66 
 
 
166 aa  55.5  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.706384 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3093  heat shock protein  34.31 
 
 
144 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3577  heat shock protein Hsp20  34.38 
 
 
157 aa  55.5  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.202692  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2250  heat shock protein Hsp20  30.06 
 
 
178 aa  55.1  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1537  heat shock protein Hsp20  35.58 
 
 
142 aa  55.5  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2212  heat shock protein Hsp20  35.11 
 
 
171 aa  55.5  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1562  small heat shock protein (HSP20-1)  29.22 
 
 
150 aa  55.1  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0383  heat shock protein Hsp20  33.68 
 
 
166 aa  55.1  0.0000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.170778  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2355  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
165 aa  55.1  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20966  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1076  heat shock protein Hsp20  33.96 
 
 
148 aa  55.5  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.713568  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0052  heat shock protein Hsp20  32.5 
 
 
151 aa  55.1  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1967  heat shock protein Hsp20  34.02 
 
 
178 aa  55.1  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  35.58 
 
 
147 aa  55.1  0.0000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0471  heat shock protein Hsp20  28.57 
 
 
155 aa  55.1  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3406  heat shock protein Hsp20  32.67 
 
 
150 aa  55.1  0.0000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.11522  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1758  heat shock protein Hsp20  35.92 
 
 
223 aa  54.7  0.0000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0344  heat shock protein Hsp20  31.9 
 
 
141 aa  54.7  0.0000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.727239  normal  0.120456 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  35.58 
 
 
147 aa  54.3  0.0000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1167  heat shock protein Hsp20  31.97 
 
 
149 aa  54.3  0.0000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1354  heat shock protein Hsp20  30.68 
 
 
134 aa  53.9  0.0000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0222398  normal  0.226114 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0336  hypothetical protein  39.47 
 
 
229 aa  53.5  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.705551 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3323  heat shock protein Hsp20  29.3 
 
 
228 aa  53.9  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1292  heat shock protein Hsp20  32.2 
 
 
170 aa  53.5  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0518729  normal  0.504399 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2730  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
148 aa  53.9  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2287  heat shock protein Hsp20  29.29 
 
 
189 aa  53.9  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1018  heat shock protein Hsp20  32.69 
 
 
177 aa  53.9  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.683731  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4310  heat shock protein Hsp20  33.02 
 
 
166 aa  53.5  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4550  heat shock protein Hsp20  33.02 
 
 
166 aa  53.5  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1429  heat shock protein Hsp20  31.52 
 
 
169 aa  53.5  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0445  heat shock protein Hsp20  32.69 
 
 
150 aa  53.5  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1921  heat shock protein Hsp20  30.69 
 
 
167 aa  52.8  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.985705  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3725  heat shock protein Hsp20  32.04 
 
 
143 aa  52.8  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.843054  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3666  heat shock protein Hsp20  30.56 
 
 
132 aa  53.1  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0021013  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0859  heat shock protein Hsp20  29.35 
 
 
153 aa  52.8  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3805  heat shock protein Hsp20  27.43 
 
 
158 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.564168 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4766  heat shock protein Hsp20  33.01 
 
 
163 aa  53.1  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000408851  hitchhiker  0.00874264 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3498  heat shock protein Hsp20  27.43 
 
 
158 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.938667  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2207  heat shock protein Hsp20  28.26 
 
 
129 aa  52.4  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.540832  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3774  heat shock protein Hsp20  29.63 
 
 
132 aa  52.4  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0183  heat shock protein Hsp20  30.69 
 
 
132 aa  52.4  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0939501  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3435  heat shock protein Hsp20  32.77 
 
 
131 aa  52.4  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3173  heat shock protein Hsp20  30 
 
 
227 aa  52  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.327314  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3412  small HspC2 heat shock protein  26.26 
 
 
189 aa  52  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.260583  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2564  heat shock protein Hsp20  32.26 
 
 
123 aa  52  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>