82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1494 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_1494  hypothetical protein  100 
 
 
184 aa  361  3e-99  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.911601  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2833  heat shock protein Hsp20  40 
 
 
183 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1246  heat shock protein, HSP20 family protein  38.75 
 
 
177 aa  99.4  3e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.143675  normal  0.0444206 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1856  heat shock protein Hsp20  39.71 
 
 
176 aa  95.9  3e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1812  hypothetical protein  34.84 
 
 
170 aa  88.2  6e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3021  heat shock protein HSP20  33.52 
 
 
176 aa  82.4  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1810  heat shock protein Hsp20  36.89 
 
 
176 aa  82  0.000000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1657  heat shock protein Hsp20  38.33 
 
 
174 aa  81.6  0.000000000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.760781 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0695  hypothetical protein  37.61 
 
 
183 aa  80.5  0.00000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.756333  normal  0.812325 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0640  heat shock protein Hsp20  36.11 
 
 
170 aa  80.1  0.00000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.402449  normal  0.271447 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0231  heat shock protein Hsp20  38.4 
 
 
176 aa  79  0.00000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1620  heat shock protein Hsp20  38.6 
 
 
175 aa  79  0.00000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.192454  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0537  heat shock protein Hsp20  36.84 
 
 
173 aa  77.8  0.00000000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0220395 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1492  heat shock protein Hsp20  30.95 
 
 
182 aa  66.2  0.0000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0447  heat shock protein Hsp20  27.86 
 
 
171 aa  63.9  0.000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0907  putative heat shock protein  26.42 
 
 
175 aa  62.8  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.606312  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0658  heat shock protein Hsp20  36.49 
 
 
130 aa  60.1  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0285  heat shock protein Hsp20  41.43 
 
 
133 aa  59.3  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2547  putative heat shock protein  36.36 
 
 
132 aa  58.9  0.00000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.837495  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0906  hypothetical protein  29.41 
 
 
165 aa  58.5  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0942345  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3080  heat shock protein Hsp20  27.73 
 
 
230 aa  55.5  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2140  heat shock protein Hsp20  37.14 
 
 
133 aa  54.3  0.0000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1742  heat shock protein Hsp20  30.77 
 
 
152 aa  52.4  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.314982  hitchhiker  0.000988198 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1983  heat shock protein Hsp20  28.87 
 
 
153 aa  52  0.000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00684856  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2370  HSP20 type chaperone  35.71 
 
 
125 aa  52  0.000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.40451 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1488  hypothetical protein  32 
 
 
340 aa  51.6  0.000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.560243  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0805  heat shock protein Hsp20  29.09 
 
 
195 aa  51.6  0.000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1324  heat shock protein Hsp20  27.43 
 
 
195 aa  51.6  0.000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.317374  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  31.25 
 
 
147 aa  49.7  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0982  HSP20 family protein  23.33 
 
 
176 aa  49.7  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0336  hypothetical protein  26.25 
 
 
229 aa  49.3  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.705551 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0859  heat shock protein Hsp20  28.46 
 
 
153 aa  48.9  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0188  heat shock protein Hsp20  33.68 
 
 
150 aa  48.1  0.00007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0445  heat shock protein Hsp20  31.91 
 
 
150 aa  48.1  0.00007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1840  heat shock protein Hsp20  34.57 
 
 
127 aa  47  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.388818 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1122  heat shock protein Hsp20  31.37 
 
 
170 aa  47  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.421321  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0838  heat shock protein Hsp20  26.61 
 
 
162 aa  47.8  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2043  putative heat shock protein  27.78 
 
 
127 aa  46.2  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.778686  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1806  small heat shock protein  30.53 
 
 
152 aa  46.2  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3323  heat shock protein Hsp20  30.1 
 
 
228 aa  46.6  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2678  HSP20 family protein  27.05 
 
 
151 aa  46.2  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0369  HSP20 family protein  28.72 
 
 
153 aa  46.2  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.93231e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0580  heat shock protein Hsp20  31.91 
 
 
145 aa  46.2  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000199173  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0010  heat shock protein HSP20  27.97 
 
 
163 aa  46.2  0.0003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1333  heat shock protein Hsp20  36.17 
 
 
142 aa  45.1  0.0005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0053  hypothetical protein  26.19 
 
 
204 aa  45.1  0.0005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0647937  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14610  heat shock protein Hsp20  31.87 
 
 
143 aa  45.4  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000610495  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0593  heat shock protein Hsp20  23.91 
 
 
191 aa  45.1  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.95349  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2074  heat shock protein Hsp20  28.87 
 
 
173 aa  44.7  0.0007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.145284  normal  0.308358 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3173  heat shock protein Hsp20  30.95 
 
 
227 aa  44.7  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.327314  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3905  heat shock protein Hsp20  26.04 
 
 
147 aa  44.3  0.0009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000984381  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1528  heat shock protein Hsp20  29.47 
 
 
153 aa  44.3  0.0009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00309172  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1366  heat shock protein Hsp20  28.57 
 
 
176 aa  43.9  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.74874  normal  0.190619 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2898  heat shock protein Hsp20  32.29 
 
 
149 aa  43.9  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.828136  normal  0.116226 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2505  heat shock protein Hsp20  27.84 
 
 
138 aa  44.3  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.239492  normal  0.0462479 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2635  heat shock protein Hsp20  27.37 
 
 
195 aa  43.9  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000662159  normal  0.965311 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0472  heat shock protein Hsp20  32.1 
 
 
115 aa  43.9  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00129647  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1758  heat shock protein Hsp20  35.56 
 
 
223 aa  43.5  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0160  heat shock protein Hsp20  26.36 
 
 
147 aa  43.5  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.248861  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0037  heat shock protein Hsp20  28.46 
 
 
142 aa  43.1  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1732  HSP20 family protein  21.93 
 
 
167 aa  43.5  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.371108  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02640  low molecular weight heat shock protein  27.52 
 
 
158 aa  43.1  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  25 
 
 
147 aa  43.1  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1214  molecular chaperone (small heat shock protein)  25.84 
 
 
260 aa  42.7  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.318766  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_825  HSP20/alpha crystallin  25.83 
 
 
162 aa  42.7  0.003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5491  heat shock protein Hsp20  27.52 
 
 
211 aa  42.4  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.710483  normal  0.352797 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3312  heat shock protein, putative  28.41 
 
 
129 aa  42.7  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.267805  normal  0.275059 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1076  heat shock protein Hsp20  32.61 
 
 
148 aa  42.7  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.713568  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2564  heat shock protein Hsp20  30 
 
 
123 aa  42.4  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4766  heat shock protein Hsp20  25.49 
 
 
163 aa  42  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000408851  hitchhiker  0.00874264 
 
 
-
 
NC_002936  DET0954  Hsp20/alpha crystallin family protein  26.37 
 
 
162 aa  42  0.005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.154946  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1973  heat shock protein Hsp20  26.88 
 
 
139 aa  42  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.287455  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  26.04 
 
 
149 aa  42  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0926  heat shock protein Hsp20  28.09 
 
 
152 aa  42  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011771  BCAH820_C0008  Hsp  29.29 
 
 
146 aa  41.6  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3882  heat shock protein Hsp20  28 
 
 
158 aa  41.6  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.545217  normal  0.180827 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6892  heat shock protein Hsp20  26.61 
 
 
157 aa  42  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.862152  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2022  heat shock protein Hsp20  31.07 
 
 
144 aa  41.6  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.12456  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1543  heat shock protein Hsp20  24.55 
 
 
146 aa  41.6  0.007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000494204  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3255  heat shock protein Hsp20  26.67 
 
 
132 aa  41.2  0.008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2008  HSP20 family protein  28.44 
 
 
122 aa  41.2  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.291255  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2532  HSP20 family protein  28.57 
 
 
144 aa  40.8  0.01  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>