107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0906 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0906  hypothetical protein  100 
 
 
165 aa  325  2.0000000000000001e-88  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0942345  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0907  putative heat shock protein  50.59 
 
 
175 aa  150  8e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.606312  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0231  heat shock protein Hsp20  40.15 
 
 
176 aa  92.8  2e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1810  heat shock protein Hsp20  36.13 
 
 
176 aa  90.9  7e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2444  putative heat shock protein  34.5 
 
 
175 aa  90.1  1e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1657  heat shock protein Hsp20  36.36 
 
 
174 aa  88.2  5e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.760781 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0537  heat shock protein Hsp20  37.18 
 
 
173 aa  86.7  1e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0220395 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0640  heat shock protein Hsp20  39.17 
 
 
170 aa  86.7  1e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.402449  normal  0.271447 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1492  heat shock protein Hsp20  35.97 
 
 
182 aa  85.1  4e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1620  heat shock protein Hsp20  35.67 
 
 
175 aa  84.7  5e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.192454  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0805  heat shock protein Hsp20  40.71 
 
 
195 aa  82.4  0.000000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0010  heat shock protein HSP20  30.72 
 
 
163 aa  78.2  0.00000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1856  heat shock protein Hsp20  32.33 
 
 
176 aa  77.4  0.00000000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0447  heat shock protein Hsp20  36.28 
 
 
171 aa  77.4  0.00000000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2833  heat shock protein Hsp20  32.26 
 
 
183 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0658  heat shock protein Hsp20  39.39 
 
 
130 aa  71.6  0.000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0695  hypothetical protein  32.31 
 
 
183 aa  68.9  0.00000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.756333  normal  0.812325 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1246  heat shock protein, HSP20 family protein  36.13 
 
 
177 aa  66.2  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.143675  normal  0.0444206 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2547  putative heat shock protein  35.37 
 
 
132 aa  62.4  0.000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.837495  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1812  hypothetical protein  30.4 
 
 
170 aa  60.1  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3021  heat shock protein HSP20  28.93 
 
 
176 aa  59.7  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1562  small heat shock protein (HSP20-1)  30.61 
 
 
150 aa  58.9  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0336  hypothetical protein  32.82 
 
 
229 aa  57.8  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.705551 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2140  heat shock protein Hsp20  34.48 
 
 
133 aa  57.4  0.00000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0285  heat shock protein Hsp20  32.18 
 
 
133 aa  57  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2370  HSP20 type chaperone  32.14 
 
 
125 aa  57  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.40451 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2643  heat shock protein Hsp20  27.48 
 
 
151 aa  55.1  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.840862  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1840  heat shock protein Hsp20  43.42 
 
 
127 aa  55.1  0.0000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.388818 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1494  hypothetical protein  31.96 
 
 
184 aa  53.9  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.911601  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1986  heat shock protein Hsp20  32 
 
 
156 aa  52.8  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0406  heat shock protein Hsp20  30 
 
 
137 aa  52  0.000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0194442  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0472  heat shock protein Hsp20  40.85 
 
 
115 aa  51.6  0.000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00129647  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0037  heat shock protein Hsp20  33.61 
 
 
142 aa  52  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0982  HSP20 family protein  29.17 
 
 
176 aa  50.1  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1594  heat shock protein Hsp20  36.62 
 
 
113 aa  48.9  0.00003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.386135 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0445  heat shock protein Hsp20  34.83 
 
 
150 aa  48.9  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0580  heat shock protein Hsp20  31 
 
 
145 aa  48.1  0.00005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000199173  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0735  heat shock protein Hsp20  32.38 
 
 
145 aa  47.8  0.00007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000037192  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3323  heat shock protein Hsp20  34.69 
 
 
228 aa  47  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4766  heat shock protein Hsp20  25.96 
 
 
163 aa  46.2  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000408851  hitchhiker  0.00874264 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1651  heat shock protein Hsp20  30.34 
 
 
155 aa  46.2  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000431905  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2410  HSP20 family protein  25.47 
 
 
149 aa  45.4  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.731962  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1573  heat shock protein Hsp20  26.61 
 
 
173 aa  45.4  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00130938  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0047  heat shock protein Hsp20  34.78 
 
 
148 aa  45.4  0.0003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.333015  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1648  heat shock protein Hsp20  28.21 
 
 
115 aa  45.4  0.0003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0182  heat shock protein Hsp20  24.53 
 
 
149 aa  45.8  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0138231  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2279  HSP20 family protein  34.09 
 
 
153 aa  45.4  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000417657  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2094  HSP20 family protein  34.09 
 
 
153 aa  45.4  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.016336  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2034  heat shock protein  34.09 
 
 
153 aa  45.4  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000604095  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2032  heat shock protein  34.09 
 
 
153 aa  45.4  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000873203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2250  HSP20 family protein  34.09 
 
 
153 aa  45.4  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000163363  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3092  heat shock protein, Hsp20 family  34.09 
 
 
153 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000535786  decreased coverage  5.9903300000000006e-24 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2275  heat shock protein, Hsp20 family  34.09 
 
 
153 aa  45.4  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.79952e-50 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1742  heat shock protein Hsp20  25.96 
 
 
152 aa  44.7  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.314982  hitchhiker  0.000988198 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2360  heat shock protein, Hsp20 family  33.71 
 
 
154 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000177338  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2232  heat shock protein, Hsp20 family  33.71 
 
 
154 aa  45.1  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00154952  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1324  heat shock protein Hsp20  28.97 
 
 
195 aa  44.7  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.317374  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1508  heat shock protein Hsp20  27.45 
 
 
154 aa  44.7  0.0006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0438643  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0690  heat shock protein Hsp20  31.52 
 
 
147 aa  44.3  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000202005  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1294  heat shock protein Hsp20  29.77 
 
 
159 aa  43.9  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.770288 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3665  heat shock protein Hsp20  23.81 
 
 
148 aa  43.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0142367  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  31.86 
 
 
150 aa  43.9  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3076  heat shock protein Hsp20  27.27 
 
 
173 aa  42.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0053  hypothetical protein  30.77 
 
 
204 aa  43.1  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0647937  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  28.71 
 
 
146 aa  42.7  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  28.71 
 
 
146 aa  42.7  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3113  heat shock protein Hsp20  29.7 
 
 
142 aa  42.7  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.800815  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1076  heat shock protein Hsp20  27.88 
 
 
148 aa  43.1  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.713568  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0203  heat shock protein Hsp20  28.43 
 
 
154 aa  43.1  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3773  heat shock protein Hsp20  24.04 
 
 
148 aa  43.1  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2635  heat shock protein Hsp20  31.07 
 
 
195 aa  42.4  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000662159  normal  0.965311 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2401  heat shock protein Hsp20  24.63 
 
 
163 aa  42.4  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000662378  hitchhiker  0.00157329 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0383  heat shock protein Hsp20  30.11 
 
 
166 aa  42.4  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.170778  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3063  heat shock protein Hsp20  26.92 
 
 
158 aa  42.4  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.89361 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3078  heat shock protein Hsp20  29.7 
 
 
145 aa  42  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000700712  normal  0.0754711 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1725  heat shock protein Hsp20  26.26 
 
 
142 aa  42  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1292  heat shock protein Hsp20  29.2 
 
 
170 aa  42.4  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0518729  normal  0.504399 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3725  heat shock protein Hsp20  32.04 
 
 
143 aa  42.4  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.843054  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2459  heat shock protein Hsp20  28.71 
 
 
142 aa  42.4  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.134169  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3460  heat shock protein Hsp20  33.98 
 
 
137 aa  42.4  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.895888  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1732  HSP20 family protein  30 
 
 
167 aa  42  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.371108  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0369  HSP20 family protein  34.09 
 
 
153 aa  42  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.93231e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2505  heat shock protein Hsp20  24.3 
 
 
138 aa  42  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.239492  normal  0.0462479 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1429  heat shock protein Hsp20  25 
 
 
169 aa  42  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2384  heat shock protein Hsp20  30.68 
 
 
164 aa  42  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0454  heat shock protein Hsp20  26.47 
 
 
144 aa  42  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2525  putative small heat shock protein  25.44 
 
 
130 aa  41.6  0.005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.586363  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1818  heat shock protein Hsp20  23.58 
 
 
128 aa  41.6  0.005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.507911 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  25.93 
 
 
147 aa  41.2  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3061  heat shock protein Hsp20  25.96 
 
 
158 aa  41.2  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.301699 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1494  heat shock protein Hsp20  27 
 
 
148 aa  41.2  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000082748  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0892  heat shock protein Hsp20  28.43 
 
 
154 aa  41.6  0.006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1083  hypothetical protein  27.89 
 
 
183 aa  41.2  0.006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0603  heat shock protein Hsp20  28.57 
 
 
147 aa  41.2  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00208688  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14610  heat shock protein Hsp20  29.59 
 
 
143 aa  41.2  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000610495  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3461  heat shock protein Hsp20  28.16 
 
 
122 aa  41.6  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.798121  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2073  heat shock protein Hsp20  31.11 
 
 
155 aa  41.2  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00430311  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3788  heat shock protein Hsp20  29.17 
 
 
144 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0617  heat shock protein Hsp20  28.57 
 
 
147 aa  41.2  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.23773e-35 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1920  heat shock protein Hsp20  30.34 
 
 
162 aa  40.8  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.143113  normal  0.422548 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>