77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1246 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_1246  heat shock protein, HSP20 family protein  100 
 
 		 177 aa  354  5e-97  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.143675  normal  0.0444206 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2833  heat shock protein Hsp20  40.12 
 
 		 183 aa  110  9e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0695  hypothetical protein  40.32 
 
 		 183 aa  97.4  1e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.756333  normal  0.812325 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1812  hypothetical protein  37.04 
 
 		 170 aa  93.6  1e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1494  hypothetical protein  37.5 
 
 		 184 aa  90.1  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.911601  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3021  heat shock protein HSP20  34.25 
 
 		 176 aa  82.8  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0907  putative heat shock protein  34.17 
 
 		 175 aa  77.8  0.00000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.606312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0640  heat shock protein Hsp20  34.75 
 
 		 170 aa  73.9  0.000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.402449  normal  0.271447 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1657  heat shock protein Hsp20  36.13 
 
 		 174 aa  73.2  0.000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.760781 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1810  heat shock protein Hsp20  35.29 
 
 		 176 aa  72.4  0.000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0537  heat shock protein Hsp20  35.29 
 
 		 173 aa  71.6  0.000000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0220395 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0231  heat shock protein Hsp20  35.83 
 
 		 176 aa  71.2  0.000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1620  heat shock protein Hsp20  34.45 
 
 		 175 aa  68.6  0.00000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.192454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0906  hypothetical protein  36.13 
 
 		 165 aa  66.2  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0942345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1492  heat shock protein Hsp20  33.62 
 
 		 182 aa  65.5  0.0000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1856  heat shock protein Hsp20  33.61 
 
 		 176 aa  64.3  0.0000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0010  heat shock protein HSP20  31.36 
 
 		 163 aa  59.3  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0369  HSP20 family protein  31.96 
 
 		 153 aa  58.2  0.00000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.93231e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3080  heat shock protein Hsp20  28.89 
 
 		 230 aa  52.4  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1488  hypothetical protein  31.25 
 
 		 340 aa  52  0.000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.560243  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1806  small heat shock protein  26.67 
 
 		 152 aa  51.6  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0859  heat shock protein Hsp20  27.42 
 
 		 153 aa  50.8  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1983  heat shock protein Hsp20  24.11 
 
 		 153 aa  50.1  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00684856  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0982  HSP20 family protein  25.95 
 
 		 176 aa  50.1  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0336  hypothetical protein  25.41 
 
 		 229 aa  48.9  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.705551 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0406  heat shock protein Hsp20  27.47 
 
 		 137 aa  48.5  0.00005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0194442  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2022  heat shock protein Hsp20  31.87 
 
 		 144 aa  48.1  0.00006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.12456  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2678  HSP20 family protein  30.43 
 
 		 151 aa  48.1  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0447  heat shock protein Hsp20  26.09 
 
 		 171 aa  47.8  0.00009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3882  heat shock protein Hsp20  29.03 
 
 		 158 aa  47  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.545217  normal  0.180827 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2635  heat shock protein Hsp20  28.89 
 
 		 195 aa  46.6  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000662159  normal  0.965311 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1986  heat shock protein Hsp20  30.36 
 
 		 156 aa  46.2  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3312  heat shock protein, putative  31.46 
 
 		 129 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.267805  normal  0.275059 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1732  HSP20 family protein  28.09 
 
 		 167 aa  45.8  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.371108  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3498  heat shock protein Hsp20  28.26 
 
 		 158 aa  45.1  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.938667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0053  hypothetical protein  25.35 
 
 		 204 aa  45.1  0.0005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0647937  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3805  heat shock protein Hsp20  28.26 
 
 		 158 aa  45.1  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.564168 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6104  heat shock protein Hsp20  27.17 
 
 		 158 aa  44.7  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0249434 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2547  putative heat shock protein  29.58 
 
 		 132 aa  43.9  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.837495  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  27.96 
 
 		 147 aa  44.3  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0735  heat shock protein Hsp20  25 
 
 		 145 aa  43.9  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000037192  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0311  heat shock protein Hsp20  25 
 
 		 142 aa  44.3  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.368561 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2642  heat shock protein Hsp20  25.53 
 
 		 134 aa  43.9  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1076  heat shock protein Hsp20  28.26 
 
 		 148 aa  43.9  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.713568  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3336  heat shock protein Hsp20  23.33 
 
 		 191 aa  43.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0593  heat shock protein Hsp20  26.88 
 
 		 191 aa  43.1  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.95349  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1127  heat shock protein Hsp20  24.37 
 
 		 142 aa  43.1  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  25.47 
 
 		 147 aa  43.1  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0200  heat shock protein Hsp20  26.09 
 
 		 176 aa  43.1  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.377048  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1115  heat shock protein Hsp20  32.84 
 
 		 162 aa  43.5  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0741755  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0285  heat shock protein Hsp20  30 
 
 		 133 aa  43.5  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5491  heat shock protein Hsp20  24.73 
 
 		 211 aa  43.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.710483  normal  0.352797 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1743  heat shock protein Hsp20  26.67 
 
 		 132 aa  43.1  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.174126  hitchhiker  0.00103153 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0445  heat shock protein Hsp20  26.88 
 
 		 150 aa  42.7  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0345  heat shock protein Hsp20  41.86 
 
 		 184 aa  42.4  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.123231 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  27.17 
 
 		 147 aa  42  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0658  heat shock protein Hsp20  24.74 
 
 		 130 aa  42.4  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14610  heat shock protein Hsp20  28.26 
 
 		 143 aa  42  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000610495  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  27.17 
 
 		 147 aa  42  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3773  heat shock protein Hsp20  29.82 
 
 		 148 aa  42  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2564  heat shock protein Hsp20  29.73 
 
 		 123 aa  41.6  0.005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  23.81 
 
 		 149 aa  41.6  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6892  heat shock protein Hsp20  23.66 
 
 		 157 aa  42  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.862152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3905  heat shock protein Hsp20  25.47 
 
 		 147 aa  42  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000984381  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1573  heat shock protein Hsp20  27.97 
 
 		 173 aa  41.6  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00130938  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0805  heat shock protein Hsp20  27.59 
 
 		 195 aa  41.6  0.005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5194  heat shock protein Hsp20  25.19 
 
 		 169 aa  41.6  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0987038  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1967  heat shock protein Hsp20  26.67 
 
 		 178 aa  41.6  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2250  heat shock protein Hsp20  26.67 
 
 		 178 aa  41.6  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3579  heat shock protein Hsp20  30.12 
 
 		 177 aa  41.6  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2140  heat shock protein Hsp20  28.57 
 
 		 133 aa  41.6  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2444  putative heat shock protein  24.81 
 
 		 175 aa  41.6  0.006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4119  heat shock protein Hsp20  27.96 
 
 		 149 aa  41.6  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00303961 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3323  heat shock protein Hsp20  25.27 
 
 		 228 aa  41.6  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2008  HSP20 family protein  26.09 
 
 		 122 aa  41.6  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.291255  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02640  low molecular weight heat shock protein  23.36 
 
 		 158 aa  40.8  0.01  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1758  heat shock protein Hsp20  29.35 
 
 		 223 aa  40.8  0.01  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>