25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3579 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3579  heat shock protein Hsp20  100 
 
 		 177 aa  343  8.999999999999999e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3263  heat shock protein HSP20  93.22 
 
 		 177 aa  300  5.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.733553 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2833  heat shock protein Hsp20  26.95 
 
 		 183 aa  47  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4131  heat shock protein Hsp20  31.25 
 
 		 161 aa  46.2  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0285  heat shock protein Hsp20  33.8 
 
 		 133 aa  46.2  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0231  heat shock protein Hsp20  30.69 
 
 		 176 aa  45.4  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1246  heat shock protein, HSP20 family protein  30.93 
 
 		 177 aa  45.4  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.143675  normal  0.0444206 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1917  heat shock protein Hsp20  32.22 
 
 		 156 aa  45.1  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86534  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1856  heat shock protein Hsp20  27.88 
 
 		 176 aa  44.7  0.0006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0391  heat shock protein Hsp20  26.25 
 
 		 143 aa  44.3  0.0008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000478859  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2140  heat shock protein Hsp20  33.8 
 
 		 133 aa  44.3  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2678  HSP20 family protein  30.11 
 
 		 151 aa  43.1  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0658  heat shock protein Hsp20  29.87 
 
 		 130 aa  42.7  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2132  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 		 164 aa  43.5  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.585874 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2547  putative heat shock protein  32.93 
 
 		 132 aa  42.4  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.837495  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0320  heat shock protein Hsp20  30.11 
 
 		 150 aa  42.7  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0311  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 		 142 aa  42  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.368561 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1698  heat shock protein Hsp20  28.87 
 
 		 155 aa  42  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.010449 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1657  heat shock protein Hsp20  32.88 
 
 		 174 aa  41.6  0.005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.760781 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  29.9 
 
 		 146 aa  41.6  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2809  heat shock protein Hsp20  34.12 
 
 		 149 aa  41.6  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00105088  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  29.9 
 
 		 146 aa  41.6  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3080  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 		 230 aa  41.6  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1810  heat shock protein Hsp20  31.51 
 
 		 176 aa  40.8  0.009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0695  hypothetical protein  34.48 
 
 		 183 aa  40.8  0.009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.756333  normal  0.812325 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>