175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2833 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_2833  heat shock protein Hsp20  100 
 
 
183 aa  359  1e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1812  hypothetical protein  46.95 
 
 
170 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3021  heat shock protein HSP20  45.57 
 
 
176 aa  125  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0695  hypothetical protein  47.93 
 
 
183 aa  117  7e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.756333  normal  0.812325 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1246  heat shock protein, HSP20 family protein  40.12 
 
 
177 aa  111  7.000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.143675  normal  0.0444206 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0640  heat shock protein Hsp20  47.48 
 
 
170 aa  109  2.0000000000000002e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.402449  normal  0.271447 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1494  hypothetical protein  40.4 
 
 
184 aa  105  5e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.911601  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1810  heat shock protein Hsp20  46.62 
 
 
176 aa  102  3e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1657  heat shock protein Hsp20  48.78 
 
 
174 aa  100  1e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.760781 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1620  heat shock protein Hsp20  47.97 
 
 
175 aa  97.1  1e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.192454  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1856  heat shock protein Hsp20  46.09 
 
 
176 aa  97.1  1e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0231  heat shock protein Hsp20  42.75 
 
 
176 aa  94  1e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0537  heat shock protein Hsp20  44.72 
 
 
173 aa  93.2  2e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0220395 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0447  heat shock protein Hsp20  41.28 
 
 
171 aa  84.7  6e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1488  hypothetical protein  27.53 
 
 
340 aa  79.3  0.00000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.560243  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0906  hypothetical protein  32.26 
 
 
165 aa  76.3  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0942345  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1492  heat shock protein Hsp20  41.53 
 
 
182 aa  76.6  0.0000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0805  heat shock protein Hsp20  34.92 
 
 
195 aa  75.5  0.0000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0010  heat shock protein HSP20  43.64 
 
 
163 aa  72.8  0.000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0907  putative heat shock protein  30.6 
 
 
175 aa  71.6  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.606312  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0336  hypothetical protein  36.28 
 
 
229 aa  65.5  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.705551 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2140  heat shock protein Hsp20  32.32 
 
 
133 aa  63.5  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0053  hypothetical protein  31.48 
 
 
204 aa  62.8  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0647937  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2547  putative heat shock protein  40 
 
 
132 aa  61.6  0.000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.837495  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0285  heat shock protein Hsp20  35.71 
 
 
133 aa  58.9  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2444  putative heat shock protein  28.24 
 
 
175 aa  57.4  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1840  heat shock protein Hsp20  35.53 
 
 
127 aa  55.8  0.0000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.388818 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0472  heat shock protein Hsp20  38.37 
 
 
115 aa  54.7  0.0000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00129647  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0445  heat shock protein Hsp20  28.28 
 
 
150 aa  53.9  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0658  heat shock protein Hsp20  31.58 
 
 
130 aa  54.3  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0982  HSP20 family protein  28.71 
 
 
176 aa  53.1  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0369  HSP20 family protein  28.57 
 
 
153 aa  53.5  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.93231e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  35.79 
 
 
150 aa  53.5  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1324  heat shock protein Hsp20  29.35 
 
 
195 aa  53.1  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.317374  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  34.69 
 
 
147 aa  53.1  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0406  heat shock protein Hsp20  31.96 
 
 
137 aa  53.1  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0194442  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  33.67 
 
 
147 aa  53.1  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1562  small heat shock protein (HSP20-1)  32.58 
 
 
150 aa  52.4  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1648  heat shock protein Hsp20  37.5 
 
 
115 aa  52  0.000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2678  HSP20 family protein  26.32 
 
 
151 aa  52  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1354  heat shock protein Hsp20  27.37 
 
 
134 aa  52  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0222398  normal  0.226114 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3078  heat shock protein Hsp20  27.37 
 
 
145 aa  51.6  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000700712  normal  0.0754711 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2635  heat shock protein Hsp20  26.32 
 
 
195 aa  51.2  0.000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000662159  normal  0.965311 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1214  molecular chaperone (small heat shock protein)  29.47 
 
 
260 aa  50.4  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.318766  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1806  small heat shock protein  27.46 
 
 
152 aa  50.8  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1967  heat shock protein Hsp20  31.68 
 
 
178 aa  50.4  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3323  heat shock protein Hsp20  30 
 
 
228 aa  50.8  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2174  heat shock protein Hsp20  27.37 
 
 
169 aa  49.7  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.150669  normal  0.4191 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2250  heat shock protein Hsp20  30.39 
 
 
178 aa  49.7  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1732  HSP20 family protein  27.96 
 
 
167 aa  49.3  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.371108  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0735  heat shock protein Hsp20  32.26 
 
 
145 aa  49.3  0.00003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000037192  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1568  heat shock protein Hsp20  29.9 
 
 
251 aa  49.3  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.458268 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  25.49 
 
 
147 aa  48.9  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1594  heat shock protein Hsp20  39.19 
 
 
113 aa  48.9  0.00004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.386135 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2730  heat shock protein Hsp20  26.6 
 
 
148 aa  48.5  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3080  heat shock protein Hsp20  26.04 
 
 
230 aa  48.5  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1743  heat shock protein Hsp20  26.32 
 
 
132 aa  48.1  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.174126  hitchhiker  0.00103153 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1076  heat shock protein Hsp20  31.91 
 
 
148 aa  48.1  0.00007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.713568  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1986  heat shock protein Hsp20  29.91 
 
 
156 aa  48.1  0.00008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2370  HSP20 type chaperone  28.57 
 
 
125 aa  47.4  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.40451 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6892  heat shock protein Hsp20  26.88 
 
 
157 aa  47  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.862152  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1122  heat shock protein Hsp20  28.67 
 
 
170 aa  47  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.421321  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4131  heat shock protein Hsp20  27.1 
 
 
161 aa  46.6  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0160  heat shock protein Hsp20  30.85 
 
 
147 aa  46.2  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.248861  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5491  heat shock protein Hsp20  27.96 
 
 
211 aa  46.6  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.710483  normal  0.352797 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2043  putative heat shock protein  22.83 
 
 
127 aa  47  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.778686  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1333  heat shock protein Hsp20  30 
 
 
142 aa  47  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1704  heat shock protein Hsp20  29.79 
 
 
140 aa  46.2  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02640  low molecular weight heat shock protein  27.43 
 
 
158 aa  46.2  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0037  heat shock protein Hsp20  34.78 
 
 
142 aa  45.8  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2279  HSP20 family protein  29.79 
 
 
153 aa  45.4  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000417657  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2094  HSP20 family protein  29.79 
 
 
153 aa  45.4  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.016336  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2034  heat shock protein  29.79 
 
 
153 aa  45.4  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000604095  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2032  heat shock protein  29.79 
 
 
153 aa  45.4  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000873203  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0891  heat shock protein Hsp20  24.51 
 
 
137 aa  45.4  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.805469  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2564  heat shock protein Hsp20  28.57 
 
 
123 aa  45.8  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2250  HSP20 family protein  29.79 
 
 
153 aa  45.4  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000163363  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3170  Molecular chaperone (small heat shock protein)- like protein  25.77 
 
 
155 aa  45.8  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.257744  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2275  heat shock protein, Hsp20 family  29.79 
 
 
153 aa  45.4  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.79952e-50 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1651  heat shock protein Hsp20  29.03 
 
 
155 aa  45.4  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000431905  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1445  putative heat shock protein  34.38 
 
 
167 aa  45.4  0.0005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000891901  normal  0.866362 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1920  heat shock protein Hsp20  27.78 
 
 
162 aa  45.1  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.143113  normal  0.422548 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0816  hypothetical protein  25 
 
 
164 aa  45.4  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.111042  normal  0.178418 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3092  heat shock protein, Hsp20 family  29.79 
 
 
153 aa  45.4  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000535786  decreased coverage  5.9903300000000006e-24 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2365  heat shock protein Hsp20  27.37 
 
 
135 aa  45.4  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.181504  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6104  heat shock protein Hsp20  24.21 
 
 
158 aa  45.4  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0249434 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2360  heat shock protein, Hsp20 family  29.47 
 
 
154 aa  45.1  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000177338  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2532  HSP20 family protein  28.42 
 
 
144 aa  45.1  0.0006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2232  heat shock protein, Hsp20 family  29.47 
 
 
154 aa  45.1  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00154952  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2022  heat shock protein Hsp20  29.59 
 
 
144 aa  45.1  0.0006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.12456  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1320  Hsp20/alpha crystallin family protein  24.47 
 
 
151 aa  45.1  0.0006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1262  small heat shock protein  24.47 
 
 
151 aa  45.1  0.0006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.753574  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3313  heat shock protein, putative  25.51 
 
 
123 aa  45.1  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.257763  normal  0.279554 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0188  heat shock protein Hsp20  30.93 
 
 
150 aa  44.7  0.0007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0609  heat shock protein Hsp20  25.83 
 
 
156 aa  44.7  0.0007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.346897  normal  0.0142886 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  24.27 
 
 
147 aa  44.7  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2073  heat shock protein Hsp20  29.17 
 
 
155 aa  44.7  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00430311  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2505  heat shock protein Hsp20  29.29 
 
 
138 aa  44.7  0.0008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.239492  normal  0.0462479 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0446  heat shock protein Hsp20  27.96 
 
 
151 aa  44.3  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.281567  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3582  heat shock protein Hsp20  28.57 
 
 
166 aa  44.3  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>