19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0336 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0336  hypothetical protein  100 
 
 
229 aa  464  9.999999999999999e-131  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.705551 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0053  hypothetical protein  39.9 
 
 
204 aa  142  4e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0647937  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1488  hypothetical protein  30.43 
 
 
340 aa  79.3  0.00000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.560243  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2833  heat shock protein Hsp20  35.96 
 
 
183 aa  65.1  0.0000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0906  hypothetical protein  32.82 
 
 
165 aa  57.8  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0942345  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0640  heat shock protein Hsp20  38.96 
 
 
170 aa  53.5  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.402449  normal  0.271447 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1856  heat shock protein Hsp20  38.75 
 
 
176 aa  50.4  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0695  hypothetical protein  29.57 
 
 
183 aa  50.1  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.756333  normal  0.812325 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2547  putative heat shock protein  30.93 
 
 
132 aa  48.9  0.00006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.837495  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1246  heat shock protein, HSP20 family protein  25.41 
 
 
177 aa  48.9  0.00007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.143675  normal  0.0444206 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2140  heat shock protein Hsp20  37.68 
 
 
133 aa  48.9  0.00007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0907  putative heat shock protein  38.16 
 
 
175 aa  47.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.606312  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1494  hypothetical protein  29.81 
 
 
184 aa  47.4  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.911601  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0285  heat shock protein Hsp20  37.68 
 
 
133 aa  45.4  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0658  heat shock protein Hsp20  35.06 
 
 
130 aa  44.3  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3021  heat shock protein HSP20  34.15 
 
 
176 aa  44.7  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0231  heat shock protein Hsp20  35.8 
 
 
176 aa  44.3  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6439  heat shock protein Hsp20  28.57 
 
 
153 aa  42  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.024706  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1812  hypothetical protein  39.47 
 
 
170 aa  41.6  0.009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>