37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1562 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1562  small heat shock protein (HSP20-1)  100 
 
 		 150 aa  306  5e-83  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0800  small heat shock protein (HSP20-1)  31.58 
 
 		 147 aa  65.5  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.581704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1657  heat shock protein Hsp20  34.59 
 
 		 174 aa  64.3  0.0000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.760781 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0907  putative heat shock protein  34.69 
 
 		 175 aa  63.9  0.0000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.606312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0537  heat shock protein Hsp20  31.21 
 
 		 173 aa  63.2  0.000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0220395 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0906  hypothetical protein  30.61 
 
 		 165 aa  58.9  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0942345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1810  heat shock protein Hsp20  31.51 
 
 		 176 aa  59.3  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0447  heat shock protein Hsp20  25.71 
 
 		 171 aa  58.9  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1620  heat shock protein Hsp20  30.23 
 
 		 175 aa  58.5  0.00000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.192454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2444  putative heat shock protein  31.01 
 
 		 175 aa  54.3  0.0000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0640  heat shock protein Hsp20  26.51 
 
 		 170 aa  53.5  0.0000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.402449  normal  0.271447 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1492  heat shock protein Hsp20  29.29 
 
 		 182 aa  53.5  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2833  heat shock protein Hsp20  32.58 
 
 		 183 aa  52  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1856  heat shock protein Hsp20  27.81 
 
 		 176 aa  51.6  0.000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0231  heat shock protein Hsp20  28.15 
 
 		 176 aa  51.6  0.000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2547  putative heat shock protein  37.11 
 
 		 132 aa  47.8  0.00005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.837495  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0010  heat shock protein HSP20  27.52 
 
 		 163 aa  47.4  0.00007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2140  heat shock protein Hsp20  39.44 
 
 		 133 aa  45.4  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3021  heat shock protein HSP20  26.23 
 
 		 176 aa  45.1  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0695  hypothetical protein  32.47 
 
 		 183 aa  44.7  0.0005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.756333  normal  0.812325 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0658  heat shock protein Hsp20  36 
 
 		 130 aa  43.9  0.0007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0285  heat shock protein Hsp20  39.44 
 
 		 133 aa  43.5  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2807  heat shock protein Hsp20  27.88 
 
 		 148 aa  42.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0373255  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2370  HSP20 type chaperone  36.99 
 
 		 125 aa  42.7  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.40451 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19240  heat shock protein Hsp20  27.06 
 
 		 144 aa  42.4  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00295622  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0690  heat shock protein Hsp20  28.85 
 
 		 147 aa  41.6  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000202005  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0805  heat shock protein Hsp20  28.83 
 
 		 195 aa  41.2  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2132  heat shock protein Hsp20  31.33 
 
 		 164 aa  41.2  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.585874 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0675  heat shock protein Hsp20  26.97 
 
 		 163 aa  41.2  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000000558694  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2564  heat shock protein Hsp20  27.17 
 
 		 123 aa  40.8  0.006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0406  heat shock protein Hsp20  26 
 
 		 137 aa  40.8  0.006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0194442  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0603  heat shock protein Hsp20  25.25 
 
 		 147 aa  40.4  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00208688  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1488  hypothetical protein  26.67 
 
 		 340 aa  40.4  0.007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.560243  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3074  heat shock protein Hsp20  26.73 
 
 		 144 aa  40.8  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0617  heat shock protein Hsp20  26.26 
 
 		 147 aa  40.4  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.23773e-35 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0053  hypothetical protein  28.95 
 
 		 204 aa  40.4  0.008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0647937  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2605  heat shock protein Hsp20  27.27 
 
 		 144 aa  40  0.01  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.325564  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>