240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0345 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_0345  heat shock protein Hsp20  100 
 
 
184 aa  350  7e-96  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.123231 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1704  heat shock protein Hsp20  34.97 
 
 
140 aa  88.2  5e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3667  heat shock protein Hsp20  35.36 
 
 
139 aa  87.4  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1417  heat shock protein Hsp20  34.64 
 
 
152 aa  81.3  0.000000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1758  heat shock protein Hsp20  32.97 
 
 
223 aa  73.2  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1928  heat shock protein Hsp20  33.1 
 
 
191 aa  70.9  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1076  heat shock protein Hsp20  30.25 
 
 
148 aa  68.9  0.00000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.713568  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0593  heat shock protein Hsp20  28.43 
 
 
191 aa  68.6  0.00000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.95349  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3125  heat shock protein Hsp20  30.87 
 
 
149 aa  65.1  0.0000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0982  heat shock protein Hsp20  34.88 
 
 
133 aa  64.3  0.0000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.506219 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1122  heat shock protein Hsp20  30 
 
 
170 aa  63.5  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.421321  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6187  heat shock protein Hsp20  28.57 
 
 
144 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.306682 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2325  stress response protein  28.65 
 
 
141 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.908249  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3219  heat shock protein  28.09 
 
 
144 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1432  HSP20/alpha crystallin family protein  28.09 
 
 
144 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.614633  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0588  heat shock protein, molecular chaperone  32.81 
 
 
141 aa  60.5  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.648467  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3093  heat shock protein  28.09 
 
 
144 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2035  stress response protein  29.32 
 
 
144 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3612  hypothetical protein  33.11 
 
 
177 aa  60.1  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5914  heat shock protein Hsp20  28 
 
 
144 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0664313  normal  0.562292 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1059  stress response protein  29.32 
 
 
144 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1345  stress response protein  29.32 
 
 
144 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.260788  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1869  putative small heat shock protein  30.11 
 
 
142 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.309197  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06090  small heat shock protein  26.38 
 
 
148 aa  58.2  0.00000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.473161  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0580  heat shock protein Hsp20  28.4 
 
 
145 aa  57.8  0.00000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000199173  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0865  heat shock protein Hsp20  28.87 
 
 
134 aa  57.8  0.00000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.303654  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  31.5 
 
 
147 aa  57.4  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2290  HSP20 family protein  31.78 
 
 
145 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.581771  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2106  HSP20 family protein  31.78 
 
 
145 aa  57.4  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.291359  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2045  heat shock protein  31.78 
 
 
145 aa  57.4  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00409698  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2043  heat shock protein  31.78 
 
 
145 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467829  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1528  heat shock protein Hsp20  28.49 
 
 
153 aa  57.4  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00309172  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2262  HSP20 family protein  31.78 
 
 
145 aa  57.4  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.378643  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2287  heat shock protein, Hsp20 family  31.78 
 
 
145 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.58706e-24 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2372  heat shock protein, Hsp20 family  30.15 
 
 
145 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0601479  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03555  30 kDa heat shock protein (Broad)  29.92 
 
 
180 aa  56.2  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.728354  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  28.57 
 
 
147 aa  56.2  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0505  heat shock protein Hsp20  28.42 
 
 
158 aa  56.2  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2242  heat shock protein, Hsp20 family  30.15 
 
 
145 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00889609  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0463  heat shock protein Hsp20  29.71 
 
 
166 aa  56.6  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0344  heat shock protein Hsp20  34.41 
 
 
141 aa  56.2  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.727239  normal  0.120456 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3113  heat shock protein Hsp20  29.58 
 
 
142 aa  55.8  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.800815  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1294  heat shock protein Hsp20  28.09 
 
 
159 aa  55.8  0.0000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.770288 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1806  small heat shock protein  28.72 
 
 
152 aa  55.5  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3078  heat shock protein Hsp20  31.01 
 
 
145 aa  55.5  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000700712  normal  0.0754711 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1292  heat shock protein Hsp20  32.35 
 
 
170 aa  55.5  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0518729  normal  0.504399 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0859  heat shock protein Hsp20  23.94 
 
 
153 aa  55.1  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1170  heat shock protein Hsp20  28.68 
 
 
170 aa  54.7  0.0000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0539  heat shock protein Hsp20  28.65 
 
 
161 aa  54.3  0.0000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1543  heat shock protein Hsp20  27.1 
 
 
146 aa  54.3  0.0000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000494204  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2321  stress response protein  28.57 
 
 
513 aa  53.9  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1651  heat shock protein Hsp20  28.57 
 
 
155 aa  54.3  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000431905  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4819  heat shock protein Hsp20  26.32 
 
 
146 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.414421 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1368  heat shock molecular chaperone  26.57 
 
 
167 aa  53.1  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0052  heat shock protein Hsp20  25.28 
 
 
151 aa  53.5  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_25657  22-kDa heat-shock protein  28.57 
 
 
138 aa  52.8  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.136563  normal  0.824287 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0788  heat shock protein Hsp20  28.91 
 
 
143 aa  52.8  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.351008  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0833  heat shock protein Hsp20  26.03 
 
 
169 aa  52.8  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2316  heat shock protein Hsp20  28.79 
 
 
139 aa  52  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0611291  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0926  heat shock protein Hsp20  29.58 
 
 
152 aa  52  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3076  heat shock protein Hsp20  26.56 
 
 
148 aa  52  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1660  heat shock protein Hsp20  28.99 
 
 
145 aa  52  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.870911  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1929  heat shock protein Hsp20  26.44 
 
 
149 aa  51.6  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.638493  normal  0.0128011 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1347  heat shock protein Hsp20  28.4 
 
 
148 aa  51.2  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.452932  normal  0.819182 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1983  heat shock protein Hsp20  24.02 
 
 
153 aa  51.6  0.000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00684856  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1648  heat shock protein, Hsp20 family  28.4 
 
 
148 aa  51.2  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.715277  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0836  heat shock protein Hsp20  28.12 
 
 
143 aa  51.2  0.000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.534587  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02530  30 kDa heat shock protein [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P40920]  28.79 
 
 
181 aa  51.2  0.000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.730469  normal  0.668337 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2049  heat shock protein Hsp20  28.07 
 
 
164 aa  51.2  0.000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0000140473  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0762  heat shock protein Hsp20  26.14 
 
 
134 aa  50.8  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2159  heat shock protein Hsp20  26.39 
 
 
139 aa  50.8  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0146906  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0982  HSP20 family protein  26.47 
 
 
176 aa  50.1  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2279  HSP20 family protein  26.19 
 
 
153 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000417657  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2643  heat shock protein Hsp20  25 
 
 
151 aa  49.7  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.840862  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1977  heat shock protein Hsp20  26.62 
 
 
139 aa  50.1  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.334288  normal  0.643075 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02640  low molecular weight heat shock protein  29.92 
 
 
158 aa  50.1  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2232  heat shock protein, Hsp20 family  25.4 
 
 
154 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00154952  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3468  heat shock protein Hsp20  25.43 
 
 
148 aa  50.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.282569  normal  0.556723 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4859  heat shock protein Hsp20  26.09 
 
 
204 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0774  heat shock protein Hsp20  29.58 
 
 
139 aa  49.7  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3903  heat shock protein Hsp20  26.81 
 
 
194 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.534424 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14610  heat shock protein Hsp20  25 
 
 
143 aa  50.1  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000610495  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4461  heat shock protein Hsp20  27.91 
 
 
163 aa  50.1  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2635  heat shock protein Hsp20  25.43 
 
 
148 aa  49.7  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1110  heat shock protein Hsp20  30.08 
 
 
145 aa  49.3  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.339847  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2094  HSP20 family protein  26.19 
 
 
153 aa  49.3  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.016336  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2034  heat shock protein  26.19 
 
 
153 aa  49.3  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000604095  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2032  heat shock protein  26.19 
 
 
153 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000873203  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2360  heat shock protein, Hsp20 family  25.4 
 
 
154 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000177338  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3092  heat shock protein, Hsp20 family  26.19 
 
 
153 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000535786  decreased coverage  5.9903300000000006e-24 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2275  heat shock protein, Hsp20 family  26.19 
 
 
153 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.79952e-50 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2250  HSP20 family protein  26.19 
 
 
153 aa  49.3  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000163363  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0200  heat shock protein Hsp20  27.34 
 
 
176 aa  48.9  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.377048  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2938  heat shock protein Hsp20  24.32 
 
 
145 aa  48.9  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000491843  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4812  heat shock protein Hsp20  26.01 
 
 
155 aa  48.9  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00238667  normal  0.807841 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2459  heat shock protein Hsp20  26.76 
 
 
142 aa  48.9  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.134169  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2860  heat shock protein Hsp20  22.88 
 
 
184 aa  48.9  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793853  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1921  heat shock protein Hsp20  26.56 
 
 
167 aa  48.5  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.985705  n/a   
 
 
-
 
NC_011771  BCAH820_C0008  Hsp  22.7 
 
 
146 aa  48.5  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1445  putative heat shock protein  25.81 
 
 
167 aa  48.1  0.00006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000891901  normal  0.866362 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>