More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2008 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_2008  HSP20 family protein  100 
 
 		 122 aa  246  7e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.291255  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0311  heat shock protein Hsp20  58.68 
 
 		 142 aa  155  2e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.368561 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1608  heat shock protein Hsp20  62.07 
 
 		 142 aa  152  1e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0383  heat shock protein Hsp20  35.96 
 
 		 166 aa  71.2  0.000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.170778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4342  heat shock protein Hsp20  30.09 
 
 		 147 aa  70.5  0.000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.204531 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2366  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 		 151 aa  68.9  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.550987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0197  heat shock protein Hsp20  30.91 
 
 		 147 aa  68.2  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0542117 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2063  heat shock protein Hsp20  32.26 
 
 		 155 aa  65.5  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.21571  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1725  heat shock protein Hsp20  34.26 
 
 		 142 aa  65.1  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3146  heat shock protein Hsp20  28.91 
 
 		 167 aa  64.7  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.754957 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2522  heat shock protein Hsp20  30.08 
 
 		 150 aa  61.6  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0200  heat shock protein Hsp20  34.78 
 
 		 176 aa  62  0.000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.377048  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0838  heat shock protein Hsp20  28.16 
 
 		 162 aa  61.6  0.000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2212  heat shock protein Hsp20  31.3 
 
 		 171 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0735  heat shock protein Hsp20  29.6 
 
 		 145 aa  60.8  0.000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000037192  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1528  heat shock protein Hsp20  27.56 
 
 		 153 aa  60.5  0.000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00309172  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3406  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.11522  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2074  heat shock protein Hsp20  30.23 
 
 		 173 aa  59.7  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.145284  normal  0.308358 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1568  heat shock protein Hsp20  36.79 
 
 		 251 aa  58.9  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.458268 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3680  heat shock protein Hsp20  30.71 
 
 		 185 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.626967 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3724  heat shock protein Hsp20  30.71 
 
 		 185 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0954  Hsp20/alpha crystallin family protein  25.24 
 
 		 162 aa  58.2  0.00000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.154946  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0936  heat shock protein Hsp20  28.32 
 
 		 155 aa  58.9  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.172536  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2957  HSP20 family protein  29.03 
 
 		 143 aa  58.5  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1762  heat shock protein Hsp20  27.35 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0539  heat shock protein Hsp20  31.48 
 
 		 161 aa  57  0.00000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2355  heat shock protein Hsp20  29.23 
 
 		 165 aa  57  0.00000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20966  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4118  heat shock protein Hsp20  27.69 
 
 		 172 aa  57  0.00000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.513744 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0320  heat shock protein Hsp20  31.67 
 
 		 150 aa  57  0.00000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4463  heat shock protein Hsp20  34.29 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1127  heat shock protein Hsp20  25.2 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2643  heat shock protein Hsp20  29.81 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.840862  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_825  HSP20/alpha crystallin  25.24 
 
 		 162 aa  56.6  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3076  heat shock protein Hsp20  24.77 
 
 		 148 aa  56.6  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4128  heat shock protein Hsp20  28.46 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.226976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2477  heat shock protein Hsp20  28.16 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0445  heat shock protein Hsp20  29.09 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3312  heat shock protein, putative  32.71 
 
 		 129 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.267805  normal  0.275059 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3666  heat shock protein Hsp20  28.57 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0021013  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4859  heat shock protein Hsp20  25.76 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0383  heat shock protein Hsp20  25 
 
 		 158 aa  56.2  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14610  heat shock protein Hsp20  26.13 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000610495  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2635  heat shock protein Hsp20  28.97 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2898  heat shock protein Hsp20  29.41 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.828136  normal  0.116226 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2657  heat shock protein Hsp20  30.47 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.498697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0580  heat shock protein Hsp20  27.97 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000199173  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3774  heat shock protein Hsp20  27.62 
 
 		 132 aa  54.7  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4061  heat shock protein Hsp20  27.36 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3765  heat shock protein Hsp20  28.04 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02640  low molecular weight heat shock protein  28.57 
 
 		 158 aa  54.7  0.0000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1170  heat shock protein Hsp20  30.39 
 
 		 170 aa  54.7  0.0000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4023  heat shock protein Hsp20  27.36 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1171  heat shock protein Hsp20  25.93 
 
 		 189 aa  54.3  0.0000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.726376  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3314  HSP20 family protein  30.4 
 
 		 151 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.284188 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1365  heat shock protein Hsp20  26.98 
 
 		 160 aa  53.9  0.0000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.117276  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0719  heat shock protein Hsp20  24.79 
 
 		 137 aa  53.9  0.0000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00433386  normal  0.504335 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3468  heat shock protein Hsp20  28.04 
 
 		 148 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.282569  normal  0.556723 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1292  heat shock protein Hsp20  27.2 
 
 		 170 aa  53.9  0.0000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0518729  normal  0.504399 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1434  low molecular weight heat shock protein  26.98 
 
 		 160 aa  53.9  0.0000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1742  heat shock protein Hsp20  30.08 
 
 		 152 aa  53.5  0.0000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.314982  hitchhiker  0.000988198 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0629  heat shock protein Hsp20  25.19 
 
 		 189 aa  53.5  0.0000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.185609 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0052  heat shock protein Hsp20  26.5 
 
 		 151 aa  53.5  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3241  heat shock protein Hsp20  25.19 
 
 		 166 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.406826  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2132  heat shock protein Hsp20  31.13 
 
 		 164 aa  53.1  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.585874 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  26.67 
 
 		 150 aa  53.1  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0143  heat shock protein Hsp20  27.66 
 
 		 156 aa  53.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0370  heat shock protein Hsp20  26.05 
 
 		 140 aa  53.1  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.733353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3412  small HspC2 heat shock protein  25.93 
 
 		 189 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.260583  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3739  heat shock protein Hsp20  29.1 
 
 		 182 aa  52.8  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0809036 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0369  HSP20 family protein  25.4 
 
 		 153 aa  52.4  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.93231e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0250  HSP20 family protein  30.77 
 
 		 139 aa  52.8  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.962825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0924  heat shock protein  28.97 
 
 		 180 aa  52.4  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0788  heat shock protein Hsp20  29.03 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.351008  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1697  hypothetical protein  31.19 
 
 		 145 aa  52.4  0.000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_36981  heat shock protein Hsp20  29.03 
 
 		 181 aa  52  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0315  heat shock protein Hsp20  25.62 
 
 		 149 aa  52  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5194  heat shock protein Hsp20  26.15 
 
 		 169 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0987038  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0982  HSP20 family protein  26.17 
 
 		 176 aa  51.6  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6104  heat shock protein Hsp20  27.56 
 
 		 158 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0249434 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3527  putative HspC2 heat shock protein  30.77 
 
 		 173 aa  52  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0868338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1429  heat shock protein Hsp20  28.57 
 
 		 169 aa  52  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0926  heat shock protein Hsp20  26.53 
 
 		 152 aa  51.6  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2532  HSP20 family protein  28.45 
 
 		 144 aa  51.2  0.000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2564  heat shock protein Hsp20  32.1 
 
 		 123 aa  51.2  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3376  heat shock protein Hsp20  27.83 
 
 		 130 aa  51.6  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0188  heat shock protein Hsp20  31.48 
 
 		 150 aa  51.6  0.000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0762  heat shock protein Hsp20  23.89 
 
 		 134 aa  51.2  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  26.19 
 
 		 147 aa  51.2  0.000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2188  heat shock protein Hsp20  29.52 
 
 		 156 aa  51.2  0.000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.345525  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3905  heat shock protein Hsp20  22.94 
 
 		 147 aa  51.2  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000984381  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  21.1 
 
 		 149 aa  51.2  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3063  heat shock protein Hsp20  22.22 
 
 		 158 aa  51.2  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.89361 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25770  heat shock Hsp20 protein  32 
 
 		 198 aa  50.8  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3903  heat shock protein Hsp20  24.24 
 
 		 194 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.534424 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0622  HSP20 family protein  24.14 
 
 		 132 aa  50.8  0.000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2642  heat shock protein Hsp20  24.78 
 
 		 134 aa  50.4  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0891  heat shock protein Hsp20  22.86 
 
 		 137 aa  50.8  0.000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.805469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4198  heat shock protein Hsp20  26.98 
 
 		 152 aa  50.4  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0460  heat shock protein Hsp20  22.66 
 
 		 155 aa  50.4  0.000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2118  heat shock protein Hsp20  25.42 
 
 		 166 aa  50.4  0.000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>