16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1083 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1083  hypothetical protein  100 
 
 		 183 aa  365  1e-100  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0231  heat shock protein Hsp20  41.94 
 
 		 176 aa  65.1  0.0000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0640  heat shock protein Hsp20  35.95 
 
 		 170 aa  62  0.000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.402449  normal  0.271447 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1856  heat shock protein Hsp20  32.73 
 
 		 176 aa  58.5  0.00000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0537  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 		 173 aa  57.4  0.0000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0220395 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0447  heat shock protein Hsp20  32.47 
 
 		 171 aa  56.2  0.0000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1810  heat shock protein Hsp20  30.67 
 
 		 176 aa  55.5  0.0000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1657  heat shock protein Hsp20  30.43 
 
 		 174 aa  55.5  0.0000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.760781 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1620  heat shock protein Hsp20  32.92 
 
 		 175 aa  55.1  0.0000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.192454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0010  heat shock protein HSP20  32.88 
 
 		 163 aa  52.4  0.000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0907  putative heat shock protein  30.49 
 
 		 175 aa  49.3  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.606312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3021  heat shock protein HSP20  29.27 
 
 		 176 aa  46.6  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0658  heat shock protein Hsp20  29.63 
 
 		 130 aa  44.3  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1104  hypothetical protein  29.33 
 
 		 309 aa  42  0.005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.283801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1492  heat shock protein Hsp20  29.66 
 
 		 182 aa  41.6  0.006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0906  hypothetical protein  27.89 
 
 		 165 aa  41.2  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0942345  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>