101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3518 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012791  Vapar_3518  heat shock protein Hsp20  100 
 
 
123 aa  248  2e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3264  heat shock protein Hsp20  52.27 
 
 
133 aa  124  4.0000000000000003e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.609526  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2381  heat shock protein HSP20  48.41 
 
 
126 aa  114  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.531579  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1656  heat shock protein Hsp20  45.67 
 
 
152 aa  107  6e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.687584  normal  0.354925 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2152  molecular chaperone  48.41 
 
 
124 aa  106  9.000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2311  CS protein  44.7 
 
 
132 aa  101  3e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2822  CS protein  44.7 
 
 
146 aa  101  4e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.661839  normal  0.344601 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1396  molecular chaperone-like protein  28 
 
 
152 aa  68.2  0.00000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.610569 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1100  heat shock protein Hsp20  32.8 
 
 
140 aa  63.9  0.0000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000787218  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1099  heat shock protein Hsp20  31.15 
 
 
141 aa  62.8  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000114288  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2459  heat shock protein Hsp20  34.83 
 
 
142 aa  60.8  0.000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.134169  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3113  heat shock protein Hsp20  33.71 
 
 
142 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.800815  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2836  heat shock protein Hsp20  30.43 
 
 
197 aa  50.8  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00556978  normal  0.209218 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6221  heat shock protein Hsp20  29.73 
 
 
151 aa  50.4  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1292  heat shock protein Hsp20  28.09 
 
 
170 aa  50.4  0.000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0518729  normal  0.504399 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4132  heat shock protein Hsp20  26.4 
 
 
144 aa  50.4  0.000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3386  heat shock protein Hsp20  28.91 
 
 
147 aa  50.4  0.000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5914  heat shock protein Hsp20  28.42 
 
 
144 aa  49.7  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0664313  normal  0.562292 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14610  heat shock protein Hsp20  31.19 
 
 
143 aa  50.1  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000610495  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1537  heat shock protein Hsp20  30 
 
 
142 aa  48.9  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1474  heat shock protein Hsp20  29.35 
 
 
151 aa  49.3  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.242626  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1029  Hsp20/alpha crystallin family protein  28.85 
 
 
146 aa  48.5  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00339514  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1110  heat shock protein Hsp20  26.32 
 
 
145 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.339847  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1528  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
153 aa  47.8  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00309172  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2379  heat shock protein Hsp20  32.06 
 
 
160 aa  47.8  0.00005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4198  heat shock protein Hsp20  32.69 
 
 
152 aa  47.4  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1869  putative small heat shock protein  28.43 
 
 
142 aa  47  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.309197  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1445  putative heat shock protein  30 
 
 
167 aa  47  0.00009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000891901  normal  0.866362 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0537  heat shock protein Hsp20  29.67 
 
 
173 aa  47  0.00009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0220395 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0859  heat shock protein Hsp20  27.43 
 
 
153 aa  46.6  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0505  heat shock protein Hsp20  26.72 
 
 
158 aa  46.6  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3125  heat shock protein Hsp20  26.85 
 
 
149 aa  46.6  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1810  heat shock protein Hsp20  34.62 
 
 
176 aa  46.6  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1657  heat shock protein Hsp20  31.46 
 
 
174 aa  46.6  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.760781 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1856  heat shock protein Hsp20  30.26 
 
 
176 aa  46.2  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6187  heat shock protein Hsp20  28.42 
 
 
144 aa  46.2  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.306682 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  28.79 
 
 
148 aa  47  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_25657  22-kDa heat-shock protein  28.71 
 
 
138 aa  46.2  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.136563  normal  0.824287 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  27.78 
 
 
147 aa  45.8  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0183  heat shock protein Hsp20  25.93 
 
 
132 aa  45.8  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0939501  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0391  heat shock protein Hsp20  29.25 
 
 
143 aa  46.2  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000478859  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2409  HSP20 family protein  25.69 
 
 
132 aa  45.1  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.996502  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2301  heat shock protein Hsp20  27.35 
 
 
142 aa  45.4  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.46681  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0640  heat shock protein Hsp20  29.9 
 
 
170 aa  45.1  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.402449  normal  0.271447 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_54150  heat shock protein Hsp20  36.49 
 
 
363 aa  45.1  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  26.98 
 
 
147 aa  44.7  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2475  heat shock protein Hsp20  27.83 
 
 
162 aa  45.1  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0538746  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3917  heat shock protein Hsp20  26.67 
 
 
142 aa  44.7  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1214  molecular chaperone (small heat shock protein)  32.97 
 
 
260 aa  44.3  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.318766  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1631  heat shock protein Hsp20  28.26 
 
 
145 aa  44.7  0.0005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2302  heat shock protein Hsp20  31.87 
 
 
153 aa  44.7  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.276703 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6439  heat shock protein Hsp20  29.13 
 
 
153 aa  44.7  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.024706  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3412  small HspC2 heat shock protein  27.27 
 
 
189 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.260583  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1170  heat shock protein Hsp20  29.21 
 
 
170 aa  44.3  0.0006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2312  heat shock protein Hsp20  24.14 
 
 
149 aa  43.9  0.0007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2802  heat shock protein Hsp20  28.57 
 
 
167 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.20157 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1171  heat shock protein Hsp20  25.76 
 
 
189 aa  43.9  0.0008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.726376  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1199  heat shock protein Hsp20  23.08 
 
 
143 aa  43.9  0.0008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.76992  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1620  heat shock protein Hsp20  30.38 
 
 
175 aa  43.5  0.0009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.192454  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0370  heat shock protein Hsp20  25.81 
 
 
140 aa  43.5  0.0009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.733353  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3350  heat shock protein Hsp20  27.12 
 
 
172 aa  43.1  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0865  heat shock protein Hsp20  28.43 
 
 
134 aa  43.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.303654  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3394  heat shock protein Hsp20  28.03 
 
 
189 aa  43.5  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219016  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2058  heat shock protein Hsp20  26.36 
 
 
141 aa  42.7  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2287  heat shock protein Hsp20  26.52 
 
 
189 aa  43.5  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0762  heat shock protein Hsp20  28.43 
 
 
134 aa  43.1  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1706  heat shock protein Hsp20  27 
 
 
132 aa  43.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00808314  hitchhiker  0.000432661 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0629  heat shock protein Hsp20  25.76 
 
 
189 aa  42.7  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.185609 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1366  heat shock protein Hsp20  25.6 
 
 
176 aa  43.5  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.74874  normal  0.190619 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1230  heat shock protein Hsp20  32.46 
 
 
164 aa  43.1  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1115  heat shock protein Hsp20  26.98 
 
 
162 aa  42.4  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0741755  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2321  stress response protein  24.51 
 
 
513 aa  42.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0314  heat shock protein Hsp20  25 
 
 
132 aa  42.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1127  heat shock protein Hsp20  27.19 
 
 
142 aa  42.7  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1122  heat shock protein Hsp20  26.02 
 
 
170 aa  42.7  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.421321  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0774  heat shock protein Hsp20  29.41 
 
 
139 aa  42.4  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2132  heat shock protein Hsp20  25.2 
 
 
164 aa  42.4  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.585874 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1806  small heat shock protein  32.04 
 
 
152 aa  42  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0513  heat shock protein Hsp20  22.43 
 
 
147 aa  42  0.003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0233  small heat shock protein  25.21 
 
 
145 aa  42  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.818598  normal  0.0970629 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0472  heat shock protein Hsp20  27.37 
 
 
115 aa  41.6  0.003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00129647  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1165  heat shock protein Hsp20  25.74 
 
 
145 aa  41.6  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.245253  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2370  HSP20 type chaperone  32.31 
 
 
125 aa  41.6  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.40451 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6390  heat shock protein Hsp20  30.77 
 
 
187 aa  41.2  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.065602 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0102  heat shock protein Hsp20  25.98 
 
 
142 aa  41.6  0.004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6093  heat shock protein Hsp20  29.91 
 
 
187 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0037  heat shock protein  23.66 
 
 
159 aa  41.2  0.005  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.487724  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0610  heat shock protein Hsp20  28.81 
 
 
137 aa  41.2  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.127052  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0593  heat shock protein Hsp20  25 
 
 
191 aa  41.2  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.95349  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3580  molecular chaperone (small heat shock protein)  25.56 
 
 
141 aa  40.8  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1840  heat shock protein Hsp20  28.74 
 
 
127 aa  40.8  0.006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.388818 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0383  heat shock protein Hsp20  25.74 
 
 
158 aa  40.8  0.007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1307  heat shock protein Hsp20  26.37 
 
 
143 aa  40.4  0.008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4635  heat shock protein Hsp20  25.18 
 
 
169 aa  40.4  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2056  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
137 aa  40.4  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  21.71 
 
 
146 aa  40.4  0.009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  21.71 
 
 
146 aa  40.4  0.009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3241  heat shock protein Hsp20  30.16 
 
 
166 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.406826  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0720  heat shock protein Hsp20  27.96 
 
 
120 aa  40.4  0.009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00436062  normal  0.512737 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2898  heat shock protein Hsp20  29.01 
 
 
149 aa  40.4  0.009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.828136  normal  0.116226 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>