65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2381 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_2381  heat shock protein HSP20  100 
 
 
126 aa  249  1e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.531579  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1656  heat shock protein Hsp20  66.14 
 
 
152 aa  161  3e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.687584  normal  0.354925 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2152  molecular chaperone  63.28 
 
 
124 aa  151  2.9999999999999998e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2311  CS protein  56.49 
 
 
132 aa  139  9.999999999999999e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2822  CS protein  56.49 
 
 
146 aa  139  9.999999999999999e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.661839  normal  0.344601 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3518  heat shock protein Hsp20  48.41 
 
 
123 aa  114  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3264  heat shock protein Hsp20  48.31 
 
 
133 aa  100  6e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.609526  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2459  heat shock protein Hsp20  32.03 
 
 
142 aa  62.4  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.134169  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3113  heat shock protein Hsp20  30.16 
 
 
142 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.800815  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1396  molecular chaperone-like protein  30.52 
 
 
152 aa  57  0.00000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.610569 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1029  Hsp20/alpha crystallin family protein  26.71 
 
 
146 aa  53.9  0.0000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00339514  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2312  heat shock protein Hsp20  27.83 
 
 
149 aa  52  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1292  heat shock protein Hsp20  28.69 
 
 
170 aa  51.6  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0518729  normal  0.504399 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0774  heat shock protein Hsp20  28.12 
 
 
139 aa  48.5  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3125  heat shock protein Hsp20  28.71 
 
 
149 aa  48.5  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1165  heat shock protein Hsp20  27.83 
 
 
145 aa  48.1  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.245253  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0865  heat shock protein Hsp20  27.05 
 
 
134 aa  48.1  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.303654  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3350  heat shock protein Hsp20  29.75 
 
 
172 aa  47.8  0.00006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6221  heat shock protein Hsp20  27.17 
 
 
151 aa  47  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1445  putative heat shock protein  29.7 
 
 
167 aa  47  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000891901  normal  0.866362 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0762  heat shock protein Hsp20  27.59 
 
 
134 aa  45.8  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2316  heat shock protein Hsp20  29.9 
 
 
139 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0611291  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2058  heat shock protein Hsp20  30.3 
 
 
141 aa  45.4  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  22.32 
 
 
146 aa  45.1  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  22.32 
 
 
146 aa  45.1  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1869  putative small heat shock protein  27.27 
 
 
142 aa  45.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.309197  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1856  heat shock protein Hsp20  25 
 
 
176 aa  45.4  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2043  putative heat shock protein  33.33 
 
 
127 aa  45.1  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.778686  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0102  heat shock protein Hsp20  24.74 
 
 
142 aa  44.7  0.0005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1149  heat shock protein Hsp20  30 
 
 
140 aa  44.7  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1219  heat shock protein Hsp20  30 
 
 
140 aa  44.7  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0907  putative heat shock protein  26.14 
 
 
175 aa  44.3  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.606312  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2301  heat shock protein Hsp20  26.06 
 
 
142 aa  44.3  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.46681  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3078  heat shock protein Hsp20  27.88 
 
 
145 aa  43.9  0.0008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000700712  normal  0.0754711 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0250  HSP20 family protein  23.4 
 
 
139 aa  43.5  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.962825  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1167  heat shock protein Hsp20  26.04 
 
 
149 aa  43.1  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2210  heat shock protein Hsp20  26.13 
 
 
139 aa  43.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0417447  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1122  heat shock protein Hsp20  27.62 
 
 
170 aa  43.1  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.421321  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1528  heat shock protein Hsp20  27.78 
 
 
153 aa  43.5  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00309172  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1262  heat shock protein Hsp20  31.82 
 
 
136 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142057  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1440  HSP20 family protein  30 
 
 
133 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1471  HSP20 family protein  30 
 
 
133 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.43946  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0529  HSP20 family protein  30 
 
 
133 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1977  heat shock protein Hsp20  23.08 
 
 
139 aa  42.4  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.334288  normal  0.643075 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1127  heat shock protein Hsp20  20.69 
 
 
142 aa  42.7  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0781  heat shock protein Hsp20  31.82 
 
 
136 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0625  HSP20 family protein  30 
 
 
133 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1199  heat shock protein Hsp20  25.81 
 
 
143 aa  42.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.76992  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0859  heat shock protein Hsp20  22.32 
 
 
153 aa  42.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1571  putative heat shock protein  30 
 
 
133 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.483559  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1234  heat shock protein Hsp20  31.82 
 
 
136 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.308291  normal  0.243977 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1110  heat shock protein Hsp20  24.41 
 
 
145 aa  42.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.339847  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4649  heat shock protein Hsp20  32.97 
 
 
137 aa  42.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.54341  normal  0.729236 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1246  HSP20 family protein  30 
 
 
133 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2810  HSP20 family protein  28.89 
 
 
131 aa  41.6  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0175635  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1706  heat shock protein Hsp20  26.32 
 
 
132 aa  41.6  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00808314  hitchhiker  0.000432661 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6187  heat shock protein Hsp20  25.27 
 
 
144 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.306682 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0184  molecular chaperone (small heat shock protein)  22.22 
 
 
149 aa  41.2  0.004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000642495  hitchhiker  0.000185759 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5151  heat shock protein Hsp20  30.43 
 
 
135 aa  41.2  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_25657  22-kDa heat-shock protein  23.4 
 
 
138 aa  40.8  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.136563  normal  0.824287 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1324  heat shock protein Hsp20  33.7 
 
 
195 aa  40.4  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.317374  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6439  heat shock protein Hsp20  26.76 
 
 
153 aa  40.4  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.024706  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1892  HSP20 family protein  27.18 
 
 
132 aa  40.4  0.008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.684879  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5914  heat shock protein Hsp20  23.4 
 
 
144 aa  40.4  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0664313  normal  0.562292 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1731  HSP20 family protein  28.45 
 
 
126 aa  40  0.01  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.13098  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>