63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3264 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_3264  heat shock protein Hsp20  100 
 
 
133 aa  267  2.9999999999999997e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.609526  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3518  heat shock protein Hsp20  52.27 
 
 
123 aa  124  4.0000000000000003e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1656  heat shock protein Hsp20  48.31 
 
 
152 aa  103  6e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.687584  normal  0.354925 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2381  heat shock protein HSP20  48.31 
 
 
126 aa  100  6e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.531579  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2152  molecular chaperone  43.18 
 
 
124 aa  100  8e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2822  CS protein  43.59 
 
 
146 aa  94.4  4e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.661839  normal  0.344601 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2311  CS protein  43.59 
 
 
132 aa  94.4  5e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1396  molecular chaperone-like protein  30 
 
 
152 aa  59.3  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.610569 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5914  heat shock protein Hsp20  34.26 
 
 
144 aa  57  0.00000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0664313  normal  0.562292 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2459  heat shock protein Hsp20  34.65 
 
 
142 aa  54.7  0.0000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.134169  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1099  heat shock protein Hsp20  31.82 
 
 
141 aa  53.9  0.0000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000114288  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1100  heat shock protein Hsp20  30.65 
 
 
140 aa  52.8  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000787218  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3113  heat shock protein Hsp20  31.68 
 
 
142 aa  52.4  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.800815  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6187  heat shock protein Hsp20  34 
 
 
144 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.306682 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3125  heat shock protein Hsp20  30.84 
 
 
149 aa  51.6  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6221  heat shock protein Hsp20  25.37 
 
 
151 aa  50.1  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3788  heat shock protein Hsp20  28.18 
 
 
144 aa  48.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1528  heat shock protein Hsp20  35.56 
 
 
153 aa  47.8  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00309172  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1856  heat shock protein Hsp20  32.18 
 
 
176 aa  47.8  0.00005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1110  heat shock protein Hsp20  30.91 
 
 
145 aa  47.4  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.339847  normal 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_25657  22-kDa heat-shock protein  27.62 
 
 
138 aa  46.2  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.136563  normal  0.824287 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3765  heat shock protein Hsp20  28.45 
 
 
143 aa  46.6  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1292  heat shock protein Hsp20  28.89 
 
 
170 aa  46.6  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0518729  normal  0.504399 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0102  heat shock protein Hsp20  31.76 
 
 
142 aa  46.2  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1165  heat shock protein Hsp20  25.52 
 
 
145 aa  45.8  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.245253  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1869  putative small heat shock protein  28.91 
 
 
142 aa  45.4  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.309197  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1474  heat shock protein Hsp20  29.36 
 
 
151 aa  45.8  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.242626  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3386  heat shock protein Hsp20  28.71 
 
 
147 aa  44.7  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2796  heat shock protein  27.36 
 
 
152 aa  44.7  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.300285  normal  0.746249 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0593  heat shock protein Hsp20  26.06 
 
 
191 aa  44.3  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.95349  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0513  heat shock protein Hsp20  24.56 
 
 
147 aa  43.9  0.0007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3219  heat shock protein  28.89 
 
 
144 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2035  stress response protein  28.89 
 
 
144 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2116  global stress protein GspA  25.2 
 
 
166 aa  43.5  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1345  stress response protein  28.89 
 
 
144 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.260788  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1059  stress response protein  28.89 
 
 
144 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1370  small heat shock protein  31.11 
 
 
144 aa  43.5  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0982961  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1445  putative heat shock protein  29.67 
 
 
167 aa  43.1  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000891901  normal  0.866362 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1432  HSP20/alpha crystallin family protein  28.89 
 
 
144 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.614633  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3093  heat shock protein  28.89 
 
 
144 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0762  heat shock protein Hsp20  32.73 
 
 
134 aa  42.7  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2141  global stress protein GspA  25.2 
 
 
166 aa  42.7  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1149  heat shock protein Hsp20  28.57 
 
 
140 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  25 
 
 
150 aa  42.7  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1219  heat shock protein Hsp20  28.57 
 
 
140 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2312  heat shock protein Hsp20  26.44 
 
 
149 aa  42.4  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2836  heat shock protein Hsp20  28.72 
 
 
197 aa  42.4  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00556978  normal  0.209218 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2325  stress response protein  28.89 
 
 
141 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.908249  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1122  heat shock protein Hsp20  25.81 
 
 
170 aa  42.7  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.421321  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2321  stress response protein  28.89 
 
 
513 aa  42.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0622  HSP20 family protein  30.33 
 
 
132 aa  42  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1167  heat shock protein Hsp20  30.23 
 
 
149 aa  42  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0104  heat shock protein Hsp20  25.81 
 
 
144 aa  42  0.003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.529827 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1307  heat shock protein Hsp20  26.32 
 
 
143 aa  42  0.003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0599  heat shock protein Hsp20  27.06 
 
 
176 aa  41.2  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.187967  normal  0.122676 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2043  putative heat shock protein  33.75 
 
 
127 aa  41.6  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.778686  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  31.11 
 
 
148 aa  41.6  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1029  Hsp20/alpha crystallin family protein  23.6 
 
 
146 aa  41.2  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00339514  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1543  heat shock protein Hsp20  25.23 
 
 
146 aa  40.8  0.006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000494204  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0383  heat shock protein Hsp20  27.27 
 
 
158 aa  40.8  0.007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6093  heat shock protein Hsp20  26.87 
 
 
187 aa  40.4  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0859  heat shock protein Hsp20  24.55 
 
 
153 aa  40.4  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7806  putative small heat-shock protein molecular chaperone  34.21 
 
 
146 aa  40.4  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00540773  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>