More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_3312 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_3312  acriflavin resistance protein  100 
 
 
1008 aa  1994    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2563  AcrB/AcrD/AcrF family protein  29.44 
 
 
1019 aa  466  9.999999999999999e-131  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2427  acriflavin resistance protein  32.96 
 
 
1019 aa  461  9.999999999999999e-129  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000179675 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2235  acriflavin resistance protein  30.25 
 
 
1022 aa  457  1e-127  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0745  AcrB/AcrD/AcrF family protein  28.2 
 
 
1027 aa  450  1e-125  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1311  acriflavin resistance protein  30.69 
 
 
1023 aa  445  1e-123  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3001  cation-multidrug efflux pump  30.9 
 
 
1025 aa  437  1e-121  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1147  acriflavin resistance protein  30.21 
 
 
1021 aa  431  1e-119  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0187  acriflavin resistance protein  29.3 
 
 
1027 aa  427  1e-118  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3279  AcrB/AcrD/AcrF family protein  31.29 
 
 
1026 aa  424  1e-117  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1324  acriflavin resistance protein  31.46 
 
 
1038 aa  425  1e-117  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.778616  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1295  acriflavin resistance protein  30.57 
 
 
1026 aa  423  1e-117  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1245  acriflavin resistance protein  30.67 
 
 
1026 aa  422  1e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1315  acriflavin resistance protein  30.6 
 
 
1026 aa  422  1e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0188093  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1389  acriflavin resistance protein  29.75 
 
 
1022 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2974  acriflavin resistance protein  29.75 
 
 
1022 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.128373  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2988  acriflavin resistance protein  29.75 
 
 
1022 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1925  acriflavin resistance protein  28.88 
 
 
1020 aa  414  1e-114  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.553474  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3132  acriflavin resistance protein  29.55 
 
 
1022 aa  414  1e-114  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3113  acriflavin resistance protein  29.65 
 
 
1030 aa  410  1e-113  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1118  hypothetical protein  28.22 
 
 
1009 aa  410  1e-113  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1266  acriflavin resistance protein  28.14 
 
 
1040 aa  412  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1277  acriflavin resistance protein  29.5 
 
 
1023 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00411319  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2343  acriflavin resistance protein  30.75 
 
 
1022 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.763441 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2636  acriflavin resistance protein  29.46 
 
 
1025 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.545015  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1315  acriflavin resistance protein  30.31 
 
 
1029 aa  402  9.999999999999999e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.549537  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2558  acriflavin resistance protein  28.67 
 
 
1035 aa  400  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0417174  normal  0.272072 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1654  transmembrane drug efflux protein  27.57 
 
 
1039 aa  397  1e-109  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.556775 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1967  RND family multidrug efflux protein  28.07 
 
 
1045 aa  399  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.585173  normal  0.0103305 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04840  acriflavin resistance protein  30.43 
 
 
1018 aa  396  1e-109  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1569  acriflavin resistance protein  29.86 
 
 
1026 aa  399  1e-109  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2293  acriflavin resistance protein  28.21 
 
 
1042 aa  397  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.497633  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1753  acriflavin resistance protein  28.54 
 
 
1048 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1373  acriflavin resistance protein  28.12 
 
 
1036 aa  394  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.167404  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1563  acriflavin resistance protein  27.55 
 
 
1039 aa  394  1e-108  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.324661  normal  0.366734 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6339  acriflavin resistance protein  28.06 
 
 
1049 aa  395  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.45388  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1740  acriflavin resistance protein  28.06 
 
 
1049 aa  395  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112228  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1892  acriflavin resistance protein  27.45 
 
 
1039 aa  390  1e-107  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.71237  normal  0.251919 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3232  acriflavin resistance protein  28 
 
 
1029 aa  390  1e-107  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.133576  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5036  acriflavin resistance protein  27.96 
 
 
1048 aa  388  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.809284 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5275  acriflavin resistance protein  27.85 
 
 
1054 aa  387  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0105172  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1519  acriflavin resistance protein  28.12 
 
 
1050 aa  389  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.352898  normal  0.340247 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4735  acriflavin resistance protein  28.98 
 
 
1029 aa  386  1e-105  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.130909  normal  0.265642 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1942  acriflavin resistance protein  28.12 
 
 
1036 aa  385  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.427834  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2172  acriflavin resistance protein  28.56 
 
 
1016 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.244345  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2294  acriflavin resistance protein  31.35 
 
 
1012 aa  382  1e-104  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4928  acriflavin resistance protein  28.95 
 
 
1019 aa  380  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1661  acriflavin resistance protein  27.77 
 
 
1047 aa  382  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.349766  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5369  acriflavin resistance protein  28.22 
 
 
1023 aa  380  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.575486 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1661  acriflavin resistance protein  27.57 
 
 
1047 aa  382  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.302634  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3981  acriflavin resistance protein  26.38 
 
 
1014 aa  379  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0670  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  28.32 
 
 
1010 aa  376  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1126  acriflavin resistance protein  27.72 
 
 
1049 aa  374  1e-102  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0566476  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1556  acriflavin resistance protein  29.16 
 
 
1056 aa  373  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2039  acriflavin resistance protein  27.9 
 
 
1018 aa  375  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0940765 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3409  acriflavin resistance protein  27.59 
 
 
1018 aa  371  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.532755 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2039  RND family mulitdrug efflux protein  27.76 
 
 
1025 aa  371  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1065  acriflavin resistance protein  29.64 
 
 
1049 aa  371  1e-101  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.494981  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3460  acriflavin resistance protein  29.09 
 
 
1073 aa  367  1e-100  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5089  acriflavin resistance protein  28.28 
 
 
1023 aa  368  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0880645  normal  0.0178395 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1207  acriflavin resistance protein  27.53 
 
 
1049 aa  368  1e-100  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.372484 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0057  acriflavin resistance protein  26.99 
 
 
1019 aa  369  1e-100  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.663476  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2288  AcrB/AcrD/AcrF family protein  27.53 
 
 
1057 aa  367  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.651759  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1357  acriflavin resistance protein  26.42 
 
 
1046 aa  369  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.776005  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2796  acriflavin resistance protein  29.34 
 
 
1059 aa  368  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.963935  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3350  acriflavin resistance protein  28.47 
 
 
1024 aa  367  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.497047  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3757  acriflavin resistance protein  27.47 
 
 
1047 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3538  acriflavin resistance protein  26.7 
 
 
1057 aa  369  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0731  acriflavin resistance protein  29.13 
 
 
1013 aa  366  1e-99  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.693134 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1461  acriflavin resistance protein  27.39 
 
 
1067 aa  366  1e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.680288  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1308  AcrB/AcrD/AcrF family protein  28.27 
 
 
1036 aa  365  2e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2179  acriflavin resistance protein  29.13 
 
 
1051 aa  365  2e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.381595  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1612  acriflavin resistance protein  28.07 
 
 
1040 aa  363  7.0000000000000005e-99  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0953  AcrB/AcrD/AcrF family protein  27.04 
 
 
1056 aa  363  1e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2509  acriflavin resistance protein  27.27 
 
 
1051 aa  363  1e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3469  acriflavin resistance protein  27.25 
 
 
1048 aa  363  1e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2104  AcrB/AcrD/AcrF family protein  27.04 
 
 
1056 aa  362  2e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.110742  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2296  AcrB/AcrD/AcrF family protein  27.04 
 
 
1056 aa  362  2e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2163  AcrB/AcrD/AcrF family protein  27.04 
 
 
1056 aa  362  2e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3774  acriflavin resistance protein  27.05 
 
 
1050 aa  361  4e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.693497  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4901  acriflavin resistance protein  26.73 
 
 
1045 aa  360  8e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.626163  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4206  acriflavin resistance protein  27.58 
 
 
1021 aa  359  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.355818 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1535  acriflavin resistance protein  28.71 
 
 
1030 aa  359  9.999999999999999e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.455491  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4101  acriflavin resistance protein  27.45 
 
 
1021 aa  359  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.585633  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00488  AcrB/AcrD/AcrF family protein  27.98 
 
 
1048 aa  358  1.9999999999999998e-97  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1517  acriflavin resistance protein  27.58 
 
 
1021 aa  357  6.999999999999999e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.850738  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2546  acriflavin resistance protein  26.21 
 
 
1047 aa  357  6.999999999999999e-97  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0226103 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1080  acriflavin resistance protein  27.82 
 
 
1022 aa  355  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.756494 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1002  acriflavin resistance protein  25.98 
 
 
1028 aa  354  5e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.507874  normal  0.0489892 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8532  acriflavin resistance protein  28.88 
 
 
1036 aa  353  7e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5233  acriflavin resistance protein  25.91 
 
 
1020 aa  353  8e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2827  acriflavin resistance protein  28.1 
 
 
1053 aa  352  2e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0321922 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3222  acriflavin resistance protein  27.48 
 
 
1020 aa  351  4e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1463  RND efflux transporter  28.09 
 
 
1025 aa  351  4e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1311  acriflavin resistance protein  28.14 
 
 
1039 aa  350  5e-95  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.203129  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5080  acriflavin resistance protein  25.91 
 
 
1017 aa  351  5e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.373906 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3213  putative efflux protein  27.2 
 
 
1027 aa  350  8e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2021  acriflavin resistance protein  26.16 
 
 
1038 aa  348  2e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.86587  normal  0.343149 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5173  acriflavin resistance protein  25.81 
 
 
1017 aa  348  3e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.181965  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0289  acriflavin resistance protein  26.09 
 
 
1021 aa  348  4e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.461457 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>