More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3247 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_3247  major facilitator transporter  100 
 
 		 449 aa  847    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.116449 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4446  major facilitator superfamily MFS_1  83.45 
 
 		 428 aa  613  9.999999999999999e-175  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.118945  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3710  major facilitator transporter  73.91 
 
 		 410 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.13632 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0276  major facilitator superfamily MFS_1  71.28 
 
 		 411 aa  496  1e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1558  major facilitator transporter  70.18 
 
 		 438 aa  465  9.999999999999999e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.880315 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1837  major facilitator superfamily MFS_1  70.53 
 
 		 417 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.380991  normal  0.250808 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1683  major facilitator superfamily MFS_1  71.91 
 
 		 417 aa  464  1e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.231948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2232  major facilitator transporter  37.63 
 
 		 432 aa  233  7.000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.265115 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2467  major facilitator family transporter  37.97 
 
 		 417 aa  231  2e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4227  major facilitator transporter  39.86 
 
 		 425 aa  230  4e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0992586  normal  0.574471 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3356  major facilitator transporter  38.84 
 
 		 420 aa  228  2e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.515977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4910  major facilitator transporter  38.38 
 
 		 424 aa  227  3e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.300482 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3004  major facilitator transporter  40.99 
 
 		 423 aa  227  3e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4332  major facilitator transporter  38.74 
 
 		 424 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0947643 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1628  major facilitator transporter  38.6 
 
 		 420 aa  226  9e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3425  major facilitator transporter  36.83 
 
 		 439 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.246848 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2331  major facilitator superfamily MFS_1  39.07 
 
 		 442 aa  219  7.999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2491  major facilitator transporter  35.68 
 
 		 439 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.6286 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1990  major facilitator transporter  39.69 
 
 		 434 aa  216  5e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2714  major facilitator superfamily MFS_1  35.21 
 
 		 439 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.413206  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0516  major facilitator superfamily MFS_1  37.28 
 
 		 411 aa  203  5e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2419  major facilitator superfamily MFS_1  35.29 
 
 		 438 aa  203  6e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5003  major facilitator superfamily MFS_1  39.73 
 
 		 421 aa  197  3e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.408823  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4401  major facilitator transporter  40.11 
 
 		 419 aa  195  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.897754  normal  0.140113 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2389  major facilitator superfamily MFS_1  37.43 
 
 		 420 aa  193  5e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1056  major facilitator superfamily MFS_1  37.89 
 
 		 428 aa  191  2e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12481  integral membrane transport protein  34.73 
 
 		 418 aa  191  2e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6319  major facilitator transporter  38.08 
 
 		 421 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.248436 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3123  major facilitator transporter  36.13 
 
 		 451 aa  183  6e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.554502 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3444  major facilitator superfamily MFS_1  36.13 
 
 		 451 aa  183  7e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6496  major facilitator transporter  37.84 
 
 		 421 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237094  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6731  major facilitator transporter  37.84 
 
 		 421 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.947065 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3320  major facilitator superfamily MFS_1  35.37 
 
 		 453 aa  178  2e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.290278  normal  0.330714 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03962  MFS transporter  39.67 
 
 		 407 aa  169  1e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6055  major facilitator superfamily MFS_1  32.33 
 
 		 436 aa  163  7e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.921375  normal  0.153234 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2054  major facilitator transporter  37.22 
 
 		 403 aa  162  8.000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6619  major facilitator transporter  36.07 
 
 		 446 aa  160  3e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0215095  normal  0.396718 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0283  major facilitator transporter  37.36 
 
 		 433 aa  160  3e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.156067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7368  major facilitator superfamily MFS_1  36.58 
 
 		 453 aa  160  6e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00609058  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5646  major facilitator transporter  31.78 
 
 		 419 aa  156  7e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3541  MFS permease  31.73 
 
 		 431 aa  154  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.72043  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2223  major facilitator transporter  31.32 
 
 		 419 aa  153  5e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1823  major facilitator transporter  31.91 
 
 		 419 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0410288 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2343  major facilitator transporter  31.32 
 
 		 419 aa  153  7e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6392  major facilitator transporter  33.84 
 
 		 452 aa  153  8e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.948234 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1692  major facilitator transporter  31.59 
 
 		 419 aa  150  4e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2304  major facilitator transporter  31.59 
 
 		 419 aa  150  4e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2327  major facilitator transporter  31.59 
 
 		 419 aa  150  4e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0588452  normal  0.321822 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1492  major facilitator transporter  31.44 
 
 		 426 aa  148  2.0000000000000003e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3527  major facilitator transporter  34.81 
 
 		 451 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2953  major facilitator transporter  30.32 
 
 		 417 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.767453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0974  major facilitator transporter  30.94 
 
 		 420 aa  144  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0994  major facilitator superfamily protein  30.79 
 
 		 420 aa  144  3e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3213  major facilitator transporter  34.04 
 
 		 426 aa  144  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.817677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1521  major facilitator superfamily MFS_1  29.89 
 
 		 417 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.584523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1208  major facilitator transporter  31.06 
 
 		 422 aa  136  9e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0420  major facilitator transporter  31.85 
 
 		 416 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1902  major facilitator superfamily protein  30.52 
 
 		 415 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0337  major facilitator transporter  30.52 
 
 		 415 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1054  major facilitator transporter  30.52 
 
 		 415 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0814  major facilitator transporter  30.52 
 
 		 415 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1216  major facilitator transporter  30.41 
 
 		 420 aa  131  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0301654  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2785  major facilitator superfamily permease  29.9 
 
 		 439 aa  125  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.673288  normal  0.140286 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0169  major facilitator superfamily transporter  34.73 
 
 		 405 aa  123  8e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.177304  hitchhiker  0.00140228 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1145  major facilitator transporter  31.28 
 
 		 386 aa  120  6e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.044656 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1276  major facilitator superfamily MFS_1  31.1 
 
 		 452 aa  107  5e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.234019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1367  major facilitator superfamily protein  29.9 
 
 		 372 aa  99  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47253  predicted protein  23.71 
 
 		 473 aa  96.3  9e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0136621  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4214  major facilitator superfamily MFS_1  34.78 
 
 		 414 aa  67  0.0000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4004  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.57 
 
 		 498 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.074494 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4300  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  28.57 
 
 		 504 aa  57  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4515  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.82 
 
 		 396 aa  57  0.0000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3103  major facilitator transporter  25.28 
 
 		 454 aa  56.2  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.973708  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2294  major facilitator family transporter  27.68 
 
 		 458 aa  56.2  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.843575  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2887  major facilitator superfamily MFS_1  27.05 
 
 		 455 aa  56.2  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3066  major facilitator transporter  25.28 
 
 		 456 aa  56.2  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03040  putative MFS transporter  30.72 
 
 		 501 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.479989  hitchhiker  0.0000743098 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3246  major facilitator transporter  25.28 
 
 		 454 aa  56.2  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0331  MFS family transporter  30.72 
 
 		 515 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0543  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily protein  31.62 
 
 		 400 aa  55.5  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00469398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2050  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.67 
 
 		 516 aa  55.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.851205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0858  hypothetical protein  26.54 
 
 		 470 aa  54.3  0.000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.392282  normal  0.20959 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3147  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.52 
 
 		 541 aa  53.5  0.000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0303  major facilitator superfamily MFS_1  29.68 
 
 		 243 aa  53.5  0.000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.394138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0571  major facilitator superfamily MFS_1  22.19 
 
 		 388 aa  53.5  0.000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2678  major facilitator superfamily MFS_1  26.88 
 
 		 408 aa  53.1  0.000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0388  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.65 
 
 		 532 aa  52.8  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2378  major facilitator superfamily MFS_1  37.23 
 
 		 415 aa  52.8  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1358  major facilitator superfamily MFS_1  32.47 
 
 		 489 aa  52  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.5787  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1928  major facilitator transporter  32.54 
 
 		 539 aa  52.4  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00178599  normal  0.278275 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4425  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.57 
 
 		 483 aa  52  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.146647  normal  0.357206 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0457  major facilitator superfamily permease  27.66 
 
 		 487 aa  52  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000209922  normal  0.207287 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1951  major facilitator superfamily transporter  26.46 
 
 		 440 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2286  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.12 
 
 		 495 aa  51.6  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.349328  normal  0.456862 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1274  major facilitator superfamily MFS_1  34.48 
 
 		 517 aa  51.2  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.131373  normal  0.0158431 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2117  major facilitator superfamily MFS_1  32.33 
 
 		 391 aa  51.2  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000191868  normal  0.363164 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2172  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.21 
 
 		 524 aa  51.6  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.632286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0894  major facilitator transporter  24.65 
 
 		 453 aa  51.6  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.298012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.82 
 
 		 519 aa  51.6  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.306727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3298  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.05 
 
 		 538 aa  51.6  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>