136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2624 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_4654  type III effector Hrp-dependent outers  88.84 
 
 		 422 aa  719    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0582595  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2624  type III effector Hrp-dependent outers  100 
 
 		 437 aa  846    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.194247 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1132  type III effector Hrp-dependent outers  76.12 
 
 		 424 aa  586  1e-166  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.669095  normal  0.332912 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1856  type III effector Hrp-dependent outers  68.4 
 
 		 425 aa  539  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5010  type III effector Hrp-dependent outers  66.82 
 
 		 426 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.447343  normal  0.232988 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5306  type III effector Hrp-dependent outers  66.2 
 
 		 426 aa  531  1e-150  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.795374 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2087  type III effector Hrp-dependent outers  66.35 
 
 		 425 aa  527  1e-148  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1025  type III effector Hrp-dependent outers  69.81 
 
 		 426 aa  518  1e-146  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2899  hypothetical protein  71.39 
 
 		 396 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.328998  normal  0.0946557 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4319  type III effector Hrp-dependent outers  68.24 
 
 		 426 aa  513  1e-144  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.369903  normal  0.109983 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2429  type III effector Hrp-dependent outer protein  64.22 
 
 		 424 aa  448  1e-125  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.668681  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3211  type III effector Hrp-dependent outers  53.16 
 
 		 433 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5156  type III effector Hrp-dependent outers  53.16 
 
 		 433 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.426256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4551  type III effector Hrp-dependent outers  52.69 
 
 		 432 aa  396  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.408285 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5123  type III effector Hrp-dependent outers  52.93 
 
 		 433 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1426  Type III effector Hrp-dependent outers  53.17 
 
 		 432 aa  393  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0125236  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0477  Type III effector Hrp-dependent outer proteins  52.46 
 
 		 433 aa  390  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.626893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3499  type III effector Hrp-dependent outers  52.12 
 
 		 428 aa  388  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.692707  normal  0.226955 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1836  type III effector Hrp-dependent protein  54.31 
 
 		 422 aa  384  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0425276  normal  0.0754586 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4424  type III effector Hrp-dependent outers  52.31 
 
 		 439 aa  379  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.250365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5930  type III effector Hrp-dependent outers  51.97 
 
 		 436 aa  379  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5074  type III effector Hrp-dependent outers  52.69 
 
 		 432 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0465  HopAN1 protein  50.96 
 
 		 429 aa  372  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4878  type III effector Hrp-dependent outers  49.53 
 
 		 427 aa  372  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.289399  normal  0.88306 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1633  type III effector Hrp-dependent outers  46.82 
 
 		 425 aa  373  1e-102  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0471944  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2171  hypothetical protein  52.31 
 
 		 436 aa  370  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.23795 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2460  type III effector Hrp-dependent outers  51.29 
 
 		 423 aa  369  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0976  YgbK domain-containing protein  51.27 
 
 		 447 aa  367  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0891  hypothetical protein  51.5 
 
 		 447 aa  361  1e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6836  type III effector Hrp-dependent outers  48.93 
 
 		 432 aa  361  1e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.57785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3733  type III effector Hrp-dependent outers  51.72 
 
 		 437 aa  359  4e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2014  YgbK domain-containing protein  50.79 
 
 		 455 aa  359  5e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.423733  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0576  hypothetical protein  50.57 
 
 		 455 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0439  type III effector Hop protein  50.57 
 
 		 455 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1921  hypothetical protein  50.57 
 
 		 455 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.282546  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3179  type III effector Hrp-dependent outers  49.88 
 
 		 423 aa  355  1e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1858  hypothetical protein  49.67 
 
 		 463 aa  355  1e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2810  type III effector Hrp-dependent outers  50.12 
 
 		 427 aa  354  2e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403245 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0445  type III effector Hrp-dependent outers  49.53 
 
 		 423 aa  353  4e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3410  type III effector Hrp-dependent outers  51.52 
 
 		 437 aa  351  2e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3142  Type III effector Hrp-dependent outers  50.12 
 
 		 422 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0013  secretion system component  43.03 
 
 		 413 aa  337  2.9999999999999997e-91  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5061  HopAN1 protein  49.13 
 
 		 404 aa  336  5e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.819559  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3383  type III effector Hrp-dependent outers  51.3 
 
 		 419 aa  333  3e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.672659 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0117  type III effector Hrp-dependent outers  45.48 
 
 		 424 aa  332  1e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0111  type III effector Hrp-dependent outers  45.71 
 
 		 424 aa  331  2e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2550  type III effector Hrp-dependent outers  40.53 
 
 		 417 aa  322  9.999999999999999e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.170607  normal  0.0125986 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04751  4-hydroxythreonine-4-phosphate dehydrogenase  42.28 
 
 		 418 aa  321  9.999999999999999e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1491  type III effector Hrp-dependent outers  44.24 
 
 		 420 aa  320  3.9999999999999996e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3122  YgbK domain protein  43.06 
 
 		 420 aa  316  7e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.827819  normal  0.0402148 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3067  YgbK domain protein  43.06 
 
 		 420 aa  315  9e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.836536  normal  0.565897 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3038  YgbK domain protein  43.06 
 
 		 420 aa  315  9e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3226  YgbK domain-containing protein  43.06 
 
 		 420 aa  315  9e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.474263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3106  YgbK domain-containing protein  42.82 
 
 		 420 aa  311  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3034  YgbK domain-containing protein  42.11 
 
 		 420 aa  310  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2875  YgbK domain-containing protein  42.28 
 
 		 420 aa  309  6.999999999999999e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0975  type III effector Hrp-dependent outers  42.28 
 
 		 420 aa  309  6.999999999999999e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.847022  normal  0.745569 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5144  type III effector Hrp-dependent outers  49.77 
 
 		 422 aa  308  1.0000000000000001e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0133  hypothetical protein  45.67 
 
 		 424 aa  308  1.0000000000000001e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.875306  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02587  hypothetical protein  41.81 
 
 		 420 aa  306  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0148  hypothetical protein  45.19 
 
 		 424 aa  301  1e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2486  type III effector Hrp-dependent outers  44.06 
 
 		 511 aa  283  4.0000000000000003e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2826  type III effector Hrp-dependent outers  42.19 
 
 		 434 aa  280  4e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2748  hypothetical protein  42.19 
 
 		 434 aa  280  5e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.591939  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1458  hypothetical protein  41.96 
 
 		 434 aa  278  2e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.470793  normal  0.510032 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02552  hypothetical protein  41.12 
 
 		 390 aa  277  3e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0951  type III effector Hrp-dependent outers  40.98 
 
 		 388 aa  273  5.000000000000001e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1552  type III effector Hrp-dependent outers  43.41 
 
 		 466 aa  263  3e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1552  hypothetical protein  48.12 
 
 		 418 aa  257  2e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.531117 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2332  type III effector Hrp-dependent outers  44.08 
 
 		 416 aa  238  1e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.411817 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3730  type III effector Hrp-dependent outers  43.09 
 
 		 417 aa  226  5.0000000000000005e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1111  hypothetical protein  33.49 
 
 		 419 aa  180  4.999999999999999e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0178  hypothetical protein  30.84 
 
 		 423 aa  116  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00679678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0177  putative inner membrane protein  30.84 
 
 		 423 aa  116  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.182428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2923  type III effector Hrp-dependent outers  30.8 
 
 		 474 aa  115  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0181  hypothetical protein  31.18 
 
 		 423 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00188424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0194  putative inner membrane protein  30.84 
 
 		 423 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0205992  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2139  type III effector Hrp-dependent outers  27.45 
 
 		 461 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.22069  normal  0.491998 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1279  type III effector Hrp-dependent outers  30.28 
 
 		 432 aa  111  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.11969  normal  0.613819 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0128  hypothetical protein  29.11 
 
 		 427 aa  107  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0031  type III effector Hrp-dependent outers  30.58 
 
 		 449 aa  108  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7231  type III effector Hrp-dependent outers  31.36 
 
 		 448 aa  106  8e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2746  type III effector Hrp-dependent outers  27.25 
 
 		 469 aa  105  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3378  hypothetical protein  31.48 
 
 		 262 aa  104  3e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4761  type III effector Hrp-dependent outers  30.52 
 
 		 448 aa  104  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.410984  normal  0.655065 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0442  hypothetical protein  30.85 
 
 		 460 aa  102  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4650  type III effector Hrp-dependent outers  30.34 
 
 		 444 aa  100  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.393899  normal  0.347719 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0094  type III effector Hrp-dependent outers  30.8 
 
 		 457 aa  99.4  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3064  type III effector Hrp-dependent outers  33.86 
 
 		 429 aa  96.7  7e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.174455 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1449  type III effector Hrp-dependent outers  33.03 
 
 		 428 aa  95.1  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2027  type III effector Hrp-dependent outers  33.03 
 
 		 428 aa  95.5  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.808425  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5643  type III effector Hrp-dependent outer  27.68 
 
 		 469 aa  94.7  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.856897  hitchhiker  0.00122307 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1847  type III effector Hrp-dependent outer  26.64 
 
 		 463 aa  93.6  6e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0264815 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2589  type III effector Hrp-dependent protein  32.08 
 
 		 410 aa  92  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.735479 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3436  type III effector Hrp-dependent outers  30.39 
 
 		 455 aa  91.3  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.211838  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2623  type III effector Hrp-dependent outers  32.11 
 
 		 399 aa  90.5  6e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.687659  hitchhiker  0.00259914 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6106  hypothetical protein  29.25 
 
 		 432 aa  87.8  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2419  type III effector Hrp-dependent outers  30.2 
 
 		 458 aa  87  6e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.962689  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1535  type III effector Hrp-dependent outers  27.59 
 
 		 425 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6294  type III effector Hrp-dependent outers  27.59 
 
 		 425 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.830951  normal  0.498392 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>