178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0995 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0995  amidohydrolase 2  100 
 
 		 287 aa  601  1.0000000000000001e-171  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0275  amidohydrolase 2  79.09 
 
 		 287 aa  491  9.999999999999999e-139  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000138051  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4401  amidohydrolase 2  79.72 
 
 		 288 aa  484  1e-136  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400198  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0606  amidohydrolase 2  78.75 
 
 		 291 aa  483  1e-135  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.47355 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4537  amidohydrolase 2  76.92 
 
 		 295 aa  477  1e-133  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1557  amidohydrolase 2  67.83 
 
 		 289 aa  402  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4025  amidohydrolase 2  65.86 
 
 		 294 aa  379  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0646692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2868  amidohydrolase 2  59.03 
 
 		 290 aa  341  8e-93  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.341603  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1611  amidohydrolase 2  56.6 
 
 		 299 aa  332  3e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0376  amidohydrolase 2  56.64 
 
 		 286 aa  328  5.0000000000000004e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4901  amidohydrolase 2  58.89 
 
 		 293 aa  320  1.9999999999999998e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0686596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1417  amidohydrolase 2  54.9 
 
 		 289 aa  318  7.999999999999999e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1397  amidohydrolase 2  55.05 
 
 		 289 aa  314  9e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.70619  normal  0.985512 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4678  amidohydrolase 2  53.85 
 
 		 289 aa  310  2e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2836  amidohydrolase 2  50.17 
 
 		 291 aa  306  2.0000000000000002e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.192303  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1655  putative amidohydrolase  53 
 
 		 294 aa  305  5.0000000000000004e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4144  amidohydrolase 2  50.71 
 
 		 297 aa  291  1e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.46392  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3823  amidohydrolase 2  46.42 
 
 		 297 aa  275  7e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4952  amidohydrolase 2  44.52 
 
 		 300 aa  261  1e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260366 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4394  amidohydrolase 2  44.68 
 
 		 298 aa  256  4e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.247071  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4481  amidohydrolase 2  44.68 
 
 		 298 aa  256  4e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4775  amidohydrolase 2  43.66 
 
 		 298 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2871  amidohydrolase 2  39.5 
 
 		 289 aa  212  7e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1017  amidohydrolase 2  37.98 
 
 		 293 aa  202  7e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0756102  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2837  amidohydrolase 2  37.63 
 
 		 269 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0179  amidohydrolase 2  35.62 
 
 		 294 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0918  amidohydrolase 2  28.98 
 
 		 265 aa  120  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000146298  normal  0.0660058 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6447  amidohydrolase 2  38.1 
 
 		 286 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000000469414  unclonable  4.69579e-18 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3097  amidohydrolase 2  31.13 
 
 		 279 aa  118  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2856  amidohydrolase 2  29.25 
 
 		 270 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.156395 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4910  amidohydrolase 2  31.63 
 
 		 279 aa  111  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.177504 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4417  amidohydrolase 2  27.75 
 
 		 286 aa  106  4e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0364  amidohydrolase 2  27.23 
 
 		 312 aa  106  5e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2759  amidohydrolase 2  24.74 
 
 		 278 aa  105  9e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.82576  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1757  amidohydrolase 2  28.37 
 
 		 293 aa  102  5e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000243959  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2538  putative amidohydrolase  28.94 
 
 		 283 aa  102  7e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.332826 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2574  amidohydrolase 2  29.09 
 
 		 288 aa  102  8e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000906856  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4940  amidohydrolase 2  27.43 
 
 		 305 aa  102  8e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.207078  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1842  amidohydrolase 2  30.32 
 
 		 279 aa  100  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2147  amidohydrolase 2  32.56 
 
 		 286 aa  100  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1435  amidohydrolase 2  32.41 
 
 		 282 aa  100  4e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1278  amidohydrolase family protein  24.89 
 
 		 276 aa  97.4  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00759688  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2819  amidohydrolase 2  31.94 
 
 		 282 aa  97.1  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13544  hypothetical protein  27.98 
 
 		 278 aa  95.5  9e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.70136e-92  hitchhiker  0.000000875537 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5104  amidohydrolase 2  32.96 
 
 		 294 aa  94  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361285  normal  0.325348 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3599  amidohydrolase 2  28.12 
 
 		 288 aa  92.4  7e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0548656  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3852  amidohydrolase 2  25.11 
 
 		 283 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12326  antibiotic-resistance protein  27.84 
 
 		 307 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2684  amidohydrolase 2  27.41 
 
 		 287 aa  91.7  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1437  amidohydrolase 2  25.23 
 
 		 277 aa  91.3  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3529  hypothetical protein  27.4 
 
 		 287 aa  90.1  4e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8361  amidohydrolase 2  27.86 
 
 		 287 aa  89.7  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1590  amidohydrolase 2  24.89 
 
 		 276 aa  89.7  5e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00255924  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3173  amidohydrolase 2  26.94 
 
 		 287 aa  89.7  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.820351  normal  0.79914 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1562  amidohydrolase 2  28.11 
 
 		 285 aa  89.4  6e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.216517  normal  0.222343 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0495  amidohydrolase 2  23.74 
 
 		 278 aa  89.4  7e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2839  amidohydrolase 2  26.75 
 
 		 287 aa  88.2  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.975955  normal  0.522178 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4198  amidohydrolase 2  28.08 
 
 		 293 aa  87.4  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.200057  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2231  amidohydrolase 2  25.58 
 
 		 300 aa  87.8  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.211376  normal  0.186133 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2575  amidohydrolase  28.38 
 
 		 281 aa  84  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.457647 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0928  hypothetical protein  29.09 
 
 		 285 aa  79.7  0.00000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2701  amidohydrolase 2  26.61 
 
 		 291 aa  79  0.00000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0561  amidohydrolase 2  27.17 
 
 		 283 aa  78.2  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4348  amidohydrolase 2  26.04 
 
 		 279 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1996  amidohydrolase 2  25.65 
 
 		 279 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5107  amidohydrolase 2  27.52 
 
 		 258 aa  76.6  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.433963  normal  0.583494 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2032  amidohydrolase 2  26.11 
 
 		 283 aa  76.6  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1776  amidohydrolase 2  25.52 
 
 		 277 aa  75.5  0.0000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.938541  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1823  amidohydrolase 2  25.52 
 
 		 277 aa  75.5  0.0000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.979278  normal  0.694594 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43860  Amidohydrolase  29.15 
 
 		 283 aa  74.3  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.106274  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3788  amidohydrolase 2  26.91 
 
 		 313 aa  74.7  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0676519  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5612  amidohydrolase 2  26.34 
 
 		 277 aa  73.6  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8667  amidohydrolase 2  28.81 
 
 		 279 aa  73.2  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1757  amidohydrolase 2  25 
 
 		 277 aa  73.2  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.990764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2965  amidohydrolase 2  31.36 
 
 		 264 aa  71.6  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1007  amidohydrolase 2  27.31 
 
 		 301 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.36488 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0855  amidohydrolase 2  29.33 
 
 		 280 aa  70.1  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000589459  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2944  amidohydrolase 2  27.22 
 
 		 294 aa  69.3  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.19972  normal  0.105005 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2759  amidohydrolase 2  25.69 
 
 		 245 aa  68.6  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.0590433 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1607  amidohydrolase 2  29.89 
 
 		 332 aa  68.6  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1297  amidohydrolase family protein  26.13 
 
 		 262 aa  67.4  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0950172  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1291  amidohydrolase 2  27.17 
 
 		 288 aa  67.8  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.127908  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3429  amidohydrolase 2  23.64 
 
 		 301 aa  65.9  0.0000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.671238 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0547  amidohydrolase 2  25.97 
 
 		 285 aa  64.7  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00750  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  26.51 
 
 		 300 aa  65.5  0.000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3070  amidohydrolase 2  23.26 
 
 		 304 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0243811  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13940  amidohydrolase 2  26.05 
 
 		 244 aa  64.3  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0383348  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1748  amidohydrolase 2  27.59 
 
 		 347 aa  64.3  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3033  amidohydrolase 2  25.69 
 
 		 246 aa  63.2  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.277355  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2058  amidohydrolase 2  23.74 
 
 		 303 aa  62.8  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0236729  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1455  hypothetical protein  24.42 
 
 		 282 aa  62.4  0.000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00169486  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0637  amidohydrolase 2  24.15 
 
 		 301 aa  62  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3634  putative amidohydrolase  22.71 
 
 		 345 aa  61.6  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645114  normal  0.429944 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3998  amidohydrolase 2  23.47 
 
 		 310 aa  61.2  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.166388  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0499  amidohydrolase 2  28.43 
 
 		 271 aa  60.8  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07730  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  25.79 
 
 		 289 aa  60.1  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3105  amidohydrolase 2  22.76 
 
 		 317 aa  60.5  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0508507  normal  0.867387 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4140  amidohydrolase 2  22.96 
 
 		 261 aa  60.1  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2586  amidohydrolase 2  29.35 
 
 		 262 aa  60.1  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000259256  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1805  amidohydrolase 2  23.89 
 
 		 310 aa  60.1  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000310667  hitchhiker  0.00134282 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>