More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0861 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0861  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 		 230 aa  458  9.999999999999999e-129  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1676  hypothetical protein  46.98 
 
 		 217 aa  188  5.999999999999999e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.223351 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0280  OmpA family outer membrane protein  38.33 
 
 		 533 aa  66.2  0.0000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0307  OmpA/MotB  37.5 
 
 		 533 aa  66.2  0.0000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0310  Type I secretion outer membrane protein, TolC  37.74 
 
 		 607 aa  63.2  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4259  hypothetical protein  38.27 
 
 		 143 aa  60.1  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00984605 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0958  OmpA/MotB domain-containing protein  41.1 
 
 		 243 aa  60.1  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6517  hypothetical protein  38.27 
 
 		 143 aa  60.1  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6620  hypothetical protein  38.27 
 
 		 143 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6338  hypothetical protein  29.86 
 
 		 185 aa  59.7  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.258634 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04698  OmpA family domain protein  33.04 
 
 		 268 aa  59.3  0.00000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0684754  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  41.67 
 
 		 242 aa  58.5  0.00000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  30.53 
 
 		 240 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  41.1 
 
 		 219 aa  57.8  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4921  OmpA/MotB domain protein  38.05 
 
 		 320 aa  57  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.730269  normal  0.0282337 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2463  OmpA/MotB domain-containing protein  39.73 
 
 		 218 aa  57.4  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.249955 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1397  OmpA/MotB domain protein  39.73 
 
 		 218 aa  57.4  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  39.73 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1689  OmpA family protein  35.29 
 
 		 352 aa  56.2  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000195152  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1572  OmpA/MotB  38.36 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00161285  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3825  OmpA/MotB domain-containing protein  33.06 
 
 		 729 aa  55.8  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.263673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2789  OmpA/MotB domain-containing protein  37.5 
 
 		 210 aa  55.1  0.0000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000026968  hitchhiker  0.00127263 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2237  putative signal peptide protein  39.73 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237192  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1621  OmpA/MotB domain protein  39.74 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  31.73 
 
 		 319 aa  54.7  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_007948  Bpro_1796  OmpA/MotB  36.99 
 
 		 214 aa  54.7  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0221039  unclonable  0.00000303101 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1944  OmpA/MotB domain protein  33.04 
 
 		 445 aa  53.9  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000859012 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5155  OmpA/MotB domain protein  32.41 
 
 		 187 aa  53.5  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.688009  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0313  OmpA/MotB domain-containing protein  37.8 
 
 		 537 aa  53.5  0.000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0125359  hitchhiker  0.00574347 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0058  putative lipoprotein  26.67 
 
 		 172 aa  53.5  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0492  OmpA/MotB domain-containing protein  29.85 
 
 		 187 aa  53.5  0.000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000142767  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  35.21 
 
 		 525 aa  53.5  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6107  DotU family type IV/VI secretion system protein  37.74 
 
 		 410 aa  53.1  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.513822 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3364  OmpA/MotB domain protein  35.29 
 
 		 216 aa  53.5  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.823034  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4014  OmpA/MotB domain-containing protein  35.29 
 
 		 216 aa  53.5  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0053  putative lipoprotein  26.67 
 
 		 172 aa  52.8  0.000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1563  OmpA/MotB domain protein  34.29 
 
 		 231 aa  52.8  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398665  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1985  OmpA/MotB domain-containing protein  38.89 
 
 		 221 aa  53.1  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3730  OmpA/MotB domain protein  27.52 
 
 		 440 aa  52.4  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0749  OmpA/MotB  35.09 
 
 		 225 aa  52.8  0.000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4235  OmpA/MotB domain-containing protein  30.08 
 
 		 347 aa  52.4  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3762  Type I secretion outer membrane protein, TolC  33.96 
 
 		 609 aa  52.4  0.000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.789361  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0172  putative outer membrane lipoprotein  39.25 
 
 		 220 aa  52  0.000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1316  OmpA/MotB domain protein  29.1 
 
 		 188 aa  52  0.000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000829076  hitchhiker  6.79334e-27 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3924  putative outer membrane lipoprotein  39.05 
 
 		 220 aa  51.2  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.835288 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2050  outer membrane protein  35.58 
 
 		 235 aa  51.6  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3968  putative outer membrane lipoprotein  39.05 
 
 		 220 aa  51.2  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.508971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3859  putative outer membrane lipoprotein  39.05 
 
 		 220 aa  51.2  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4028  putative outer membrane lipoprotein  39.05 
 
 		 220 aa  51.2  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0388504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04793  OmpA family protein  37.14 
 
 		 241 aa  51.6  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188001  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3840  putative outer membrane lipoprotein  39.05 
 
 		 220 aa  51.2  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2738  OmpA/MotB domain-containing protein  37.5 
 
 		 289 aa  51.6  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00376202  hitchhiker  0.000469935 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4955  OmpA/MotB domain-containing protein  35.14 
 
 		 170 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.782858 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1506  ompA family protein  34.78 
 
 		 260 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2570  OmpA/MotB domain-containing protein  36.11 
 
 		 289 aa  50.8  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000124837  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6431  OmpA/MotB domain protein  27.54 
 
 		 449 aa  50.8  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15220  outer membrane protein, OmpA/MotB family  34.75 
 
 		 270 aa  50.8  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1220  OmpA/MotB domain protein  33.98 
 
 		 168 aa  50.8  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.936608 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06262  hypothetical protein  39.44 
 
 		 334 aa  50.4  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1204  OmpA family protein  37.5 
 
 		 220 aa  50.1  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1167  OmpA family protein  37.5 
 
 		 243 aa  50.1  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4435  OmpA/MotB domain-containing protein  35.14 
 
 		 170 aa  50.1  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0232251  hitchhiker  0.000146268 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  35.87 
 
 		 296 aa  49.7  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0502  OmpA/MotB  32.12 
 
 		 463 aa  49.7  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.605644 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0051  OmpA/MotB domain protein  30.43 
 
 		 333 aa  49.3  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000573223 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1851  OmpA/MotB domain-containing protein  34.72 
 
 		 297 aa  49.7  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000146772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10918  outer membrane protein A ompA  31.3 
 
 		 326 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2141  OmpA/MotB domain-containing protein  32.06 
 
 		 520 aa  49.3  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0276844  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1075  OmpA/MotB domain-containing protein  34.86 
 
 		 220 aa  49.3  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.19452  normal  0.568242 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1262  OmpA/MotB  37.5 
 
 		 217 aa  49.3  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.140432  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2146  OmpA/MotB domain-containing protein  38.36 
 
 		 218 aa  49.3  0.00005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47635  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0053  OmpA/MotB domain protein  28.57 
 
 		 333 aa  49.3  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0258  OmpA/MotB domain-containing protein  32.43 
 
 		 231 aa  49.3  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.686752  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0753  OmpA domain-containing protein  34.95 
 
 		 464 aa  48.9  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.767935 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2956  OmpA domain-containing protein  34.48 
 
 		 311 aa  48.9  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1591  OmpA/MotB  33.65 
 
 		 227 aa  48.9  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.237315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2087  OmpA/MotB  28.36 
 
 		 217 aa  48.9  0.00007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26560  putative outer membrane protein precursor  34.13 
 
 		 269 aa  48.9  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.304401  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0160  OmpA/MotB domain protein  38.1 
 
 		 219 aa  48.5  0.00008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4047  putative outer membrane lipoprotein  38.1 
 
 		 219 aa  48.5  0.00008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3854  surface antigen protein  35.85 
 
 		 221 aa  48.5  0.00008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.415864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1251  flagellar motor protein MotD  34.21 
 
 		 263 aa  48.5  0.00008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3873  putative outer membrane lipoprotein  38.1 
 
 		 219 aa  48.5  0.00008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4928  putative outer membrane lipoprotein  38.1 
 
 		 219 aa  48.5  0.00008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.843277 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0995  OmpA/MotB domain protein  26.56 
 
 		 179 aa  48.5  0.00008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0164  putative outer membrane lipoprotein  38.1 
 
 		 219 aa  48.5  0.00008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3753  putative outer membrane lipoprotein  38.1 
 
 		 219 aa  48.5  0.00008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03402  predicted outer membrane lipoprotein  37.38 
 
 		 219 aa  48.5  0.00009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3149  ompA family protein  34.48 
 
 		 310 aa  48.5  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2828  OmpA domain-containing protein  34.48 
 
 		 310 aa  48.5  0.00009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1715  ompA family protein  34.48 
 
 		 310 aa  48.5  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.706939  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3974  putative outer membrane lipoprotein  38.1 
 
 		 219 aa  48.5  0.00009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1865  OmpA family protein  32.38 
 
 		 241 aa  48.5  0.00009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  26.32 
 
 		 537 aa  48.5  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1793  OmpA/MotB domain-containing protein  32.38 
 
 		 241 aa  48.5  0.00009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.224575  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0052  ompA family protein  34.48 
 
 		 310 aa  48.5  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.757478  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03353  hypothetical protein  37.38 
 
 		 219 aa  48.5  0.00009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3635  OmpA family domain-containing protein  34.48 
 
 		 310 aa  48.5  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.837065  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5258  OmpA/MotB domain-containing protein  35.24 
 
 		 170 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0603  OmpA family protein  35.51 
 
 		 207 aa  47.8  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>