93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1747 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_1747  YG repeat-containing glycosyl hydrolase family 70 protein  100 
 
 
1527 aa  3110    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1752  glycosyl hydrolase  53.77 
 
 
1514 aa  1323    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0857  glycosyl hydrolase  52.59 
 
 
2821 aa  1286    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0544  YG repeat-containing glycosyl hydrolase  52.86 
 
 
1475 aa  1321    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1346  dextransucrase  38.78 
 
 
1363 aa  577  1.0000000000000001e-163  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0490  cell wall binding repeat-containing protein  28.33 
 
 
1557 aa  87.4  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14530  glucan-binding domain-containing protein  28.37 
 
 
602 aa  84  0.00000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.259034 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0606  cell wall binding repeat-containing protein/zinc carboxypeptidase family protein  29.25 
 
 
550 aa  83.6  0.00000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.907737  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0605  cell wall binding repeat-containing protein/mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase domain-containing protein  32.61 
 
 
807 aa  80.9  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.187255  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07880  glucan-binding domain-containing protein  23.83 
 
 
651 aa  77  0.000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00352799 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11330  putative cell wall binding protein  29.5 
 
 
502 aa  75.9  0.000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.307599  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08300  glycosyl hydrolase family 25  29.39 
 
 
592 aa  75.5  0.000000000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.39526 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25520  conserved repeat protein  24.48 
 
 
613 aa  74.3  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00880  putative cell wall binding protein  32.11 
 
 
478 aa  73.6  0.00000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.938683  normal  0.955176 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14450  glucan-binding domain-containing protein  24.92 
 
 
532 aa  71.2  0.0000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.521361  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04260  putative cell wall binding protein  36.09 
 
 
465 aa  70.9  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.878918  normal  0.401989 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16990  glucan-binding domain-containing protein  26.21 
 
 
342 aa  69.7  0.0000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14460  glucan-binding domain-containing protein  25.75 
 
 
757 aa  69.7  0.0000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.706218  normal  0.855897 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0611  cell wall binding repeat-containing protein  26.89 
 
 
430 aa  68.9  0.0000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1355  hypothetical protein  24.52 
 
 
532 aa  68.2  0.000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0180624  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14440  subtilase family protease  25.96 
 
 
817 aa  67.4  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06260  glucan-binding domain-containing protein  26.76 
 
 
324 aa  67.4  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14470  putative cell wall binding protein  24.52 
 
 
512 aa  65.9  0.000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.437968  normal  0.444931 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0151  S-layer domain ribonuclease  28.95 
 
 
1131 aa  65.9  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.965938  hitchhiker  0.000000320353 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0121  S-layer domain-containing ribonuclease  28.95 
 
 
1131 aa  65.9  0.000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00104142 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00230  dipeptidase  27.6 
 
 
750 aa  65.5  0.000000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00762022 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1387  cytoplasmic alpha-amylase  24.17 
 
 
496 aa  65.1  0.000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0077  S-layer protein  28.82 
 
 
697 aa  64.3  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0803176  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05950  glucan-binding domain-containing protein  22.91 
 
 
753 aa  63.5  0.00000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000330124  hitchhiker  0.0000000000107499 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06430  M6 family metalloprotease domain-containing protein  31.5 
 
 
811 aa  63.5  0.00000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0919314 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1410  hypothetical protein  26.84 
 
 
1025 aa  62.8  0.00000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0550  cell wall binding repeat-containing protein  29.93 
 
 
330 aa  62  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.515915  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16000  putative cell wall binding protein  26.73 
 
 
316 aa  60.5  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000272933 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0607  cell wall binding repeat-containing protein  26.57 
 
 
454 aa  60.1  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3200  cytoplasmic alpha-amylase  22.87 
 
 
513 aa  59.7  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.570134  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0593  cell wall binding repeat-containing protein  23.91 
 
 
552 aa  59.7  0.0000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000201841  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0891  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  25.21 
 
 
762 aa  59.7  0.0000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0223841  normal  0.138276 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00690  putative cell wall binding protein  26.21 
 
 
2495 aa  59.3  0.0000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2409  cytoplasmic alpha-amylase  23.65 
 
 
494 aa  58.9  0.0000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1719  alpha amylase catalytic region  21.55 
 
 
495 aa  58.9  0.0000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2162  cytoplasmic alpha-amylase  21.74 
 
 
495 aa  58.5  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3551  cytoplasmic alpha-amylase  22.36 
 
 
513 aa  58.2  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3508  cytoplasmic alpha-amylase  22.56 
 
 
513 aa  58.2  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3291  cytoplasmic alpha-amylase  22.36 
 
 
513 aa  58.2  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000922062  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1254  cytoplasmic alpha-amylase  21.74 
 
 
495 aa  58.5  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.345137 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1712  cytoplasmic alpha-amylase  21.74 
 
 
495 aa  57.8  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.118098 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2027  cytoplasmic alpha-amylase  21.74 
 
 
495 aa  58.5  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0013  peptidoglycan hydrolase  26.04 
 
 
589 aa  57.4  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0013556  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2702  cytoplasmic alpha-amylase  21.5 
 
 
495 aa  57.4  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.363407 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3261  cytoplasmic alpha-amylase  23.28 
 
 
513 aa  57  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0208363  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5584  cell wall binding repeat-containing protein  26.53 
 
 
737 aa  56.6  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05190  putative cell wall binding protein  29.56 
 
 
440 aa  56.6  0.000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1057  cytoplasmic alpha-amylase  21.5 
 
 
495 aa  56.6  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0627984  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3487  cytoplasmic alpha-amylase  22.74 
 
 
513 aa  56.6  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0859  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.9 
 
 
399 aa  55.8  0.000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000303579  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0888  cell wall hydrolase/autolysin  24.25 
 
 
890 aa  54.7  0.00001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000852469  normal  0.142876 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0591  cell wall binding repeat-containing protein/zinc carboxypeptidase family protein  25.56 
 
 
573 aa  53.9  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000159659  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1411  hypothetical protein  25.66 
 
 
1002 aa  53.9  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2526  cytoplasmic alpha-amylase  21.71 
 
 
495 aa  53.9  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1758  cytoplasmic alpha-amylase  22.19 
 
 
513 aa  53.5  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.591182  normal  0.938186 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1094  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.4 
 
 
399 aa  53.9  0.00003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000219862  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00310  CHAP domain-containing protein  29.7 
 
 
302 aa  53.1  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1409  hypothetical protein  30.41 
 
 
1009 aa  52.8  0.00005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1364  NLP/P60 protein  27.75 
 
 
420 aa  52.4  0.00006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.123178  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0592  cell wall binding repeat-containing protein/mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  28.11 
 
 
891 aa  52.4  0.00007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0288009  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0091  hypothetical protein  27 
 
 
587 aa  52  0.00009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1537  cytoplasmic alpha-amylase  22.19 
 
 
483 aa  52  0.00009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0143259  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1263  alpha amylase catalytic region  21.24 
 
 
499 aa  52  0.00009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.796062 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2178  cytoplasmic alpha-amylase  20.74 
 
 
494 aa  51.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.170616  normal  0.0297459 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11960  putative cell wall binding protein  29.09 
 
 
578 aa  51.6  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000480831  normal  0.155715 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1367  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  27.16 
 
 
474 aa  51.6  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000955772  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0597  surface protein pspA precursor  24.12 
 
 
434 aa  50.8  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05679  cytoplasmic alpha-amylase  23.59 
 
 
507 aa  50.4  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09550  putative cell wall binding protein  23.82 
 
 
331 aa  50.1  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0189396  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03309  alpha-amylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G15150)  21.22 
 
 
576 aa  50.4  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.979768  normal  0.838039 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3273  cytoplasmic alpha-amylase  20.78 
 
 
549 aa  50.1  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1812  cytoplasmic alpha-amylase  21.34 
 
 
492 aa  49.3  0.0005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0328907  normal  0.0314505 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1500  cytoplasmic alpha-amylase  23.68 
 
 
483 aa  49.3  0.0006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.132711  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1157  cytoplasmic alpha-amylase  20.79 
 
 
494 aa  48.9  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00381479  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02530  glucan-binding domain-containing protein  26.42 
 
 
377 aa  48.1  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.459016  normal  0.0379723 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18640  calcineurin-like phosphoesterase  33 
 
 
1732 aa  47.8  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.993356 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0421  pullulanase, type I  28.67 
 
 
601 aa  47.4  0.002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2120  cytoplasmic alpha-amylase  26.39 
 
 
494 aa  47  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.070724  normal  0.352748 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000056  cytoplasmic alpha-amylase  24.25 
 
 
507 aa  47  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0351894  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1336  cell wall binding repeat-containing protein  31.36 
 
 
184 aa  47  0.003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2125  cytoplasmic alpha-amylase  25.69 
 
 
494 aa  46.2  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.172028  hitchhiker  0.0000021601 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0595  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  25.6 
 
 
350 aa  46.2  0.005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0114709  normal  0.325418 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2808  alpha amylase catalytic region  25.27 
 
 
481 aa  46.2  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00730774  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2176  cytoplasmic alpha-amylase  29.52 
 
 
488 aa  45.8  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0543  glycogen debranching enzyme GlgX  26.03 
 
 
704 aa  45.4  0.008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0247855  normal  0.604467 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1280  cytoplasmic alpha-amylase  26.92 
 
 
494 aa  45.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0337681  normal  0.462612 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2010  glycogen debranching enzyme GlgX  23.44 
 
 
788 aa  45.4  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.680457 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2050  NLP/P60 protein  22.39 
 
 
696 aa  45.1  0.01  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.426387  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>