261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_19200 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_19200  DNA/RNA helicase, superfamily I  100 
 
 		 1083 aa  2077    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.11601  normal  0.0259599 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2474  UvrD/REP helicase  40.42 
 
 		 1076 aa  474  1e-132  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.719714  hitchhiker  0.00582507 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27650  DNA/RNA helicase, superfamily I  39.17 
 
 		 1124 aa  459  1e-127  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.292433  normal  0.663943 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0711  UvrD/REP helicase  34.69 
 
 		 1059 aa  457  1e-127  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2479  UvrD/REP helicase  33.99 
 
 		 1115 aa  434  1e-120  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000159355 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06800  DNA/RNA helicase, superfamily I  36.43 
 
 		 1066 aa  419  9.999999999999999e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.860602  normal  0.467007 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0852  UvrD/REP helicase  35.9 
 
 		 1050 aa  404  1e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.986974  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13225  ATP-dependent DNA helicase  33.24 
 
 		 1055 aa  397  1e-109  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0523  putative ATP-dependent DNA helicase  34.46 
 
 		 1044 aa  395  1e-108  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4583  UvrD/REP helicase  35.29 
 
 		 1040 aa  391  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.542582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2757  UvrD/REP helicase  33.48 
 
 		 1150 aa  387  1e-106  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.21598  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4244  UvrD/REP helicase  36.6 
 
 		 1062 aa  387  1e-106  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.664691  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1403  UvrD/REP helicase  34.81 
 
 		 1051 aa  381  1e-104  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2902  UvrD/REP helicase  36.45 
 
 		 1085 aa  383  1e-104  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.401068  normal  0.0918032 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1421  UvrD/REP helicase  34.81 
 
 		 1051 aa  381  1e-104  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2974  UvrD/REP helicase  35.22 
 
 		 1074 aa  377  1e-103  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3754  UvrD/REP helicase  34.5 
 
 		 1059 aa  380  1e-103  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.216008  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8377  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  35.27 
 
 		 1051 aa  379  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1801  UvrD/REP helicase  35.48 
 
 		 1038 aa  373  1e-102  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.078646 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4131  UvrD/REP helicase  36.38 
 
 		 1096 aa  374  1e-102  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.81155  normal  0.92786 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3501  UvrD/REP helicase  34.58 
 
 		 1129 aa  367  1e-100  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.235136  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3822  UvrD/REP helicase  34.28 
 
 		 1060 aa  369  1e-100  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0180671  hitchhiker  0.00809927 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1457  UvrD/REP helicase  34.32 
 
 		 1051 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0431152  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15100  DNA/RNA helicase, superfamily I  34.23 
 
 		 1145 aa  362  1e-98  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4666  UvrD/REP helicase  33.48 
 
 		 1038 aa  355  2.9999999999999997e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0501158  normal  0.218907 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0779  UvrD/REP helicase  40.69 
 
 		 1197 aa  329  2.0000000000000001e-88  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0925  UvrD/REP helicase  31.71 
 
 		 1135 aa  306  1.0000000000000001e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.963076 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3800  UvrD/REP helicase  34.35 
 
 		 1103 aa  298  5e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0835078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7808  UvrD/REP helicase  30.25 
 
 		 1134 aa  297  6e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3749  UvrD/REP helicase  37.19 
 
 		 1144 aa  295  3e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.612436  normal  0.203306 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1508  UvrD/REP helicase  32.1 
 
 		 1060 aa  294  6e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2143  UvrD/REP helicase  32.65 
 
 		 1099 aa  289  2e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.23473  hitchhiker  0.00187143 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1171  UvrD/REP helicase  40.37 
 
 		 1098 aa  265  2e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.132239  normal  0.301474 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1776  UvrD/REP helicase  35.05 
 
 		 1095 aa  264  6.999999999999999e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.337618 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11360  DNA/RNA helicase, superfamily I  32.25 
 
 		 1058 aa  252  3e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.556014  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1131  UvrD/REP helicase  35.57 
 
 		 1094 aa  213  2e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0955  superfamily I DNA and RNA helicase  35.86 
 
 		 1428 aa  90.9  1e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0563  UvrD/REP helicase  22.76 
 
 		 743 aa  78.6  0.0000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0641932  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2233  ATP-dependent DNA helicase  23.45 
 
 		 658 aa  74.7  0.000000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1154  hypothetical protein  20.69 
 
 		 1528 aa  70.9  0.0000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.193707 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0524  putative DNA helicase  28.49 
 
 		 1108 aa  68.2  0.0000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.98499  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2143  ATP-dependent DNA helicase Rep  22.57 
 
 		 658 aa  68.2  0.0000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3362  UvrD family helicase  20.42 
 
 		 630 aa  67  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.753608  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2947  UvrD/REP helicase  22.1 
 
 		 678 aa  65.5  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03620  ATP-dependent DNA helicase Rep  24.1 
 
 		 640 aa  65.1  0.000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0776  UvrD/REP helicase  27.79 
 
 		 1143 aa  64.7  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.240899 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1337  UvrD/REP helicase  22.81 
 
 		 678 aa  63.9  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0599  DNA-dependent helicase II  23.36 
 
 		 717 aa  63.5  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2440  UvrD/REP helicase  23.69 
 
 		 786 aa  63.2  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.605331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3223  UvrD/REP helicase  27.93 
 
 		 1075 aa  63.2  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.124845 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4124  ATP-dependent DNA helicase Rep  21.96 
 
 		 707 aa  63.2  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1212  ATP-dependent DNA helicase UvrD  27.3 
 
 		 892 aa  62.8  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.771972  normal  0.554 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0964  UvrD/REP helicase  18.51 
 
 		 735 aa  62.4  0.00000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4139  ATP-dependent DNA helicase Rep  21.92 
 
 		 674 aa  62  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4242  ATP-dependent DNA helicase Rep  21.92 
 
 		 674 aa  62  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.907548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0748  UvrD/REP helicase  24.91 
 
 		 653 aa  62  0.00000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00311747  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4301  ATP-dependent DNA helicase Rep  21.92 
 
 		 674 aa  62  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.165801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0050  ATP-dependent DNA helicase Rep  22.65 
 
 		 658 aa  61.6  0.00000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0153579  normal  0.502615 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4193  ATP-dependent DNA helicase Rep  21.92 
 
 		 674 aa  60.8  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2580  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.84 
 
 		 754 aa  60.8  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0253  ATP-dependent DNA helicase Rep  22.35 
 
 		 669 aa  60.8  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0932  putative DNA helicase II  23.74 
 
 		 816 aa  60.5  0.0000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.156274  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1422  UvrD/REP helicase  27.19 
 
 		 1089 aa  59.7  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1937  UvrD/REP helicase  26.09 
 
 		 726 aa  59.7  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2756  UvrD/REP helicase  26.49 
 
 		 1183 aa  59.7  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3440  UvrD/REP helicase  24.89 
 
 		 682 aa  59.7  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.155249  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2235  DNA helicase II protein  24.77 
 
 		 829 aa  59.3  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1202  UvrD/REP helicase  25.11 
 
 		 1112 aa  59.3  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2878  DNA and RNA helicase  26.18 
 
 		 1050 aa  58.9  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.015904  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0959  UvrD/REP helicase  22.39 
 
 		 705 aa  58.9  0.0000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47860  ATP-dependent DNA helicase Rep protein  23.11 
 
 		 669 aa  58.9  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0092  ATP-dependent DNA helicase rep  21.93 
 
 		 671 aa  58.9  0.0000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.157816  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3473  ATP-dependent DNA helicase Rep  21.93 
 
 		 669 aa  58.9  0.0000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.406551 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0849  UvrD/REP helicase  25.12 
 
 		 845 aa  58.9  0.0000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.462782  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2047  UvrD/REP helicase  24.82 
 
 		 786 aa  58.9  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2014  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.87 
 
 		 729 aa  58.5  0.0000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4007  ATP-dependent DNA helicase Rep  21.46 
 
 		 673 aa  58.5  0.0000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00646067 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3374  ATP-dependent DNA helicase Rep  25.17 
 
 		 671 aa  58.5  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.654782  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0113  ATP-dependent DNA helicase Rep  20.68 
 
 		 669 aa  58.2  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0151  ATP-dependent DNA helicase Rep  21.69 
 
 		 674 aa  58.2  0.0000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2836  DNA helicase II  22.06 
 
 		 858 aa  58.2  0.0000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03656  DNA helicase and single-stranded DNA-dependent ATPase  21.23 
 
 		 673 aa  57.4  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0354982  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5264  ATP-dependent DNA helicase Rep  22.25 
 
 		 669 aa  57.8  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03605  hypothetical protein  21.23 
 
 		 673 aa  57.4  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0230376  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0864  ATP-dependent DNA helicase UvrD  24.16 
 
 		 786 aa  57.4  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5316  ATP-dependent DNA helicase Rep  22.25 
 
 		 669 aa  57.8  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.640166  normal  0.0761543 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0322  UvrD/REP helicase  24.14 
 
 		 795 aa  57.4  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0222  UvrD/REP helicase  18.51 
 
 		 666 aa  57.4  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000045018  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0757  ATP-dependent DNA helicase PcrA  22.9 
 
 		 773 aa  57.4  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.476102  hitchhiker  0.0068011 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4288  ATP-dependent DNA helicase Rep  21.23 
 
 		 673 aa  57.4  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69910  ATP-dependent DNA helicase Rep  20.11 
 
 		 669 aa  57.4  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0398  UvrD/REP helicase  24.25 
 
 		 798 aa  57.8  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.970559 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5211  ATP-dependent DNA helicase Rep  21.23 
 
 		 673 aa  57.8  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0625  UvrD/REP helicase  26.3 
 
 		 1019 aa  57.8  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.243128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0317  UvrD/REP helicase  27.17 
 
 		 1032 aa  57.8  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.907606  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6070  ATP-dependent DNA helicase Rep  20.28 
 
 		 706 aa  58.2  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4143  ATP-dependent DNA helicase Rep  21.23 
 
 		 673 aa  58.2  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5174  ATP-dependent DNA helicase Rep  22.25 
 
 		 669 aa  57.8  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0902161 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4223  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.37 
 
 		 768 aa  57.8  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.80047  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4015  ATP-dependent DNA helicase Rep  21.87 
 
 		 675 aa  57  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>