More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1189 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1189  ROK family protein  100 
 
 		 418 aa  791    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.708792  normal  0.0977285 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24360  transcriptional regulator/sugar kinase  42.01 
 
 		 389 aa  225  1e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.20601  normal  0.121694 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2379  ROK family protein  41.04 
 
 		 395 aa  217  2e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4239  ROK family protein  41.34 
 
 		 393 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0397832  normal  0.0388456 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1506  ROK family protein  40.9 
 
 		 390 aa  207  3e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.809262  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3849  ROK family protein  41.09 
 
 		 393 aa  207  4e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1129  ROK family protein  41.29 
 
 		 436 aa  204  3e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0571556 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2670  ROK family protein  40.2 
 
 		 408 aa  204  3e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000218357  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5946  ROK family protein  42.08 
 
 		 422 aa  203  4e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.908629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6738  ROK family protein  41 
 
 		 413 aa  202  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.193033 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2271  ROK family protein  39 
 
 		 401 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0826731 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7617  transcriptional regulator, ROK family  38.56 
 
 		 408 aa  195  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.451753  normal  0.286241 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5295  ROK family protein  40 
 
 		 404 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.101654  normal  0.123744 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4482  ROK family protein  40.31 
 
 		 385 aa  177  5e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0138376  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1302  ROK family protein  35.34 
 
 		 400 aa  153  5.9999999999999996e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5569  ROK family protein  35.01 
 
 		 448 aa  153  7e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.575796  normal  0.481694 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  30.28 
 
 		 409 aa  147  4.0000000000000006e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3783  ROK family protein  34.94 
 
 		 457 aa  145  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00347065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1605  putative xylose repressor  32.68 
 
 		 417 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0116  ROK family protein  32.09 
 
 		 398 aa  135  1.9999999999999998e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2407  ROK family protein  34.62 
 
 		 403 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1794  ROK family protein  36.29 
 
 		 382 aa  134  3.9999999999999996e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00140797  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5226  ROK family protein  32.92 
 
 		 321 aa  133  6e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1809  ROK family protein  25 
 
 		 396 aa  132  7.999999999999999e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5345  ROK family protein  30.97 
 
 		 417 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2656  ROK family protein  31.67 
 
 		 418 aa  130  3e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28270  transcriptional regulator/sugar kinase  35.65 
 
 		 434 aa  129  7.000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3264  ROK family protein  33.92 
 
 		 387 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.198191  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0465  ROK family protein  31.27 
 
 		 410 aa  129  1.0000000000000001e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0180  ROK family protein  33.52 
 
 		 404 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0694  ROK family protein  35.91 
 
 		 382 aa  127  4.0000000000000003e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0157817 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  28.74 
 
 		 391 aa  127  5e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5489  ROK family protein  32.69 
 
 		 321 aa  126  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.269543 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6688  ROK family protein  38.97 
 
 		 406 aa  125  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.395851 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2381  ROK family protein  31.17 
 
 		 398 aa  125  2e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0149  ROK family protein  39.39 
 
 		 473 aa  125  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0514897 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2208  xylose repressor  26.98 
 
 		 364 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.308125  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1182  ROK family protein  28.91 
 
 		 386 aa  121  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4652  ROK family protein  31.82 
 
 		 422 aa  119  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.219121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1887  NagC family Transcriptional regulator  28.57 
 
 		 409 aa  119  9.999999999999999e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0103401  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0352  ROK family protein  34.48 
 
 		 391 aa  118  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3729  ROK family protein  33.85 
 
 		 390 aa  117  3e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.201606  normal  0.0168592 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4664  ROK family protein  31.93 
 
 		 409 aa  117  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.213413  normal  0.717223 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3199  ROK family protein  26.3 
 
 		 407 aa  116  6e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.845236 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1123  ROK family protein  40.78 
 
 		 836 aa  116  6.9999999999999995e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.210366  normal  0.224116 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  23.68 
 
 		 396 aa  116  6.9999999999999995e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1044  ROK family protein  32.9 
 
 		 383 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.339449  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  26.08 
 
 		 395 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1772  ROK family protein  31.43 
 
 		 386 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.415249  normal  0.404833 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22700  transcriptional regulator/sugar kinase  32.15 
 
 		 413 aa  115  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0159  ROK family protein  24.63 
 
 		 400 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3173  ROK domain-containing protein  28.01 
 
 		 435 aa  114  3e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.66636  normal  0.682387 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1294  transcriptional repressor of the xylose operon  32.89 
 
 		 401 aa  114  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2298  ROK family protein  29.38 
 
 		 391 aa  113  5e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.193884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0225  ROK family protein  25.08 
 
 		 398 aa  113  6e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.10258  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1608  putative xylose repressor  31.49 
 
 		 416 aa  113  8.000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000726705  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0421  ROK  23.79 
 
 		 410 aa  113  8.000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0799462 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01680  transcriptional regulator/sugar kinase  32.54 
 
 		 392 aa  112  1.0000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1730  transcriptional repressor of the xylose operon  32.3 
 
 		 396 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.332399  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3083  ROK family protein  32.43 
 
 		 407 aa  112  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.048241  normal  0.411127 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0705  ROK family protein  30.85 
 
 		 374 aa  112  2.0000000000000002e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3727  transcriptional repressor of the xylose operon  32.25 
 
 		 397 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00469917  normal  0.342647 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1260  ROK family protein  32.3 
 
 		 397 aa  112  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464207 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2683  ROK domain-containing protein  31.2 
 
 		 400 aa  110  3e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4416  ROK family protein  30.3 
 
 		 396 aa  111  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  23.36 
 
 		 408 aa  110  6e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0855  ROK family protein  22.74 
 
 		 385 aa  109  9.000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5021  ROK family protein  33.23 
 
 		 387 aa  108  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2620  ROK family protein  32.09 
 
 		 425 aa  109  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.92 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0260  ROK family protein  30.9 
 
 		 404 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  31.47 
 
 		 401 aa  108  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2133  ROK family protein  28.95 
 
 		 417 aa  108  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2309  glucokinase  30 
 
 		 323 aa  108  2e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00114411  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2843  ROK family protein  29.81 
 
 		 425 aa  108  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2512  ROK family protein  33.08 
 
 		 401 aa  108  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0112  ROK family protein  38.46 
 
 		 313 aa  108  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0430819 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4041  ROK family protein  22.46 
 
 		 390 aa  107  3e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.787367  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2875  ROK domain-containing protein  30.38 
 
 		 303 aa  107  4e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0985025 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1105  ROK family protein  27.32 
 
 		 396 aa  107  4e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.348719  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  25.19 
 
 		 396 aa  107  4e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1217  ROK family protein  29.55 
 
 		 316 aa  107  6e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1181  xylose operon repressor  28.88 
 
 		 425 aa  106  7e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2781  ROK family protein  30.15 
 
 		 391 aa  106  9e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000000764975  hitchhiker  0.000282521 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2357  ROK family protein  25.3 
 
 		 397 aa  106  9e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2995  ROK family protein  24.48 
 
 		 408 aa  105  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00770  ROK family protein  24.23 
 
 		 378 aa  105  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000483979  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1680  ROK family protein  23.43 
 
 		 376 aa  104  2e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0832  glucokinase  30.31 
 
 		 315 aa  104  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.618047 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0837  ROK family protein  25.51 
 
 		 378 aa  105  2e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2826  ROK family protein  32.08 
 
 		 403 aa  104  3e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2265  ROK  29.68 
 
 		 311 aa  103  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2517  ROK family protein  32.58 
 
 		 418 aa  103  4e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5676  ROK family protein  29.85 
 
 		 400 aa  103  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0716593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27730  transcriptional regulator/sugar kinase  29.54 
 
 		 410 aa  103  4e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.514205 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0693  ROK family protein  27.59 
 
 		 402 aa  103  5e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0088  ROK family protein  31.13 
 
 		 313 aa  103  5e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7220  ROK family protein  31.01 
 
 		 402 aa  103  7e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.501197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3061  transcriptional regulator, ROK family  34.23 
 
 		 407 aa  103  8e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.756873  normal  0.372783 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3037  ROK family protein  22.55 
 
 		 381 aa  103  8e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00862886  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0176  ROK family protein  38.58 
 
 		 379 aa  102  9e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>