More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1705 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1705  ABC transporter related  100 
 
 		 236 aa  475  1e-133  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.143912 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0621  ABC transporter related  42.31 
 
 		 246 aa  171  6.999999999999999e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.958584  normal  0.980042 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0221  ABC transporter related  39.51 
 
 		 253 aa  163  2.0000000000000002e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.207021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0454  ABC transporter related  39.6 
 
 		 251 aa  155  4e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1835  ABC transporter related  37.83 
 
 		 295 aa  154  9e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2664  ABC transporter related  39.91 
 
 		 296 aa  152  5.9999999999999996e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000181001  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18810  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  37.22 
 
 		 291 aa  150  1e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.222917 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4743  ABC transporter related  36.6 
 
 		 267 aa  150  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.249045  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3995  ABC transporter related  38.77 
 
 		 286 aa  149  3e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.259313  normal  0.940234 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3211  ABC transporter ATP-binding protein  36.13 
 
 		 307 aa  148  7e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00761631  normal  0.0394821 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1984  ABC transporter related  35.48 
 
 		 295 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1168  ABC transporter related protein  39.82 
 
 		 288 aa  146  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12100  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  36.32 
 
 		 299 aa  145  7.0000000000000006e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1163  ABC transporter related  35.45 
 
 		 303 aa  144  9e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0914  ABC transporter related  37.21 
 
 		 290 aa  144  1e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2277  ABC transporter related  35.59 
 
 		 293 aa  144  1e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3435  ABC transporter-like protein  38.7 
 
 		 295 aa  144  2e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21580  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  37.34 
 
 		 244 aa  144  2e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.114361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1219  ABC transporter related  37.95 
 
 		 299 aa  142  7e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.538125  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0094  ABC transporter, ATP-binding protein  34.17 
 
 		 255 aa  141  9e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0351427 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3051  ABC transporter related  36.74 
 
 		 309 aa  141  9e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2521  ABC transporter related  35.89 
 
 		 284 aa  140  9.999999999999999e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.436198 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2870  ABC transporter related protein  40 
 
 		 296 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1415  ABC transporter related protein  37.67 
 
 		 286 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0785  ABC transporter related  39.04 
 
 		 300 aa  139  3e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1955  ABC transporter, ATP-binding protein  36.53 
 
 		 282 aa  137  1e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26380  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  36.89 
 
 		 251 aa  137  1e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0843722 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3471  gliding motility-associated ABC transporter ATP- binding subunit GldA  36.44 
 
 		 305 aa  135  4e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000514218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2669  ABC transporter related  36.32 
 
 		 308 aa  135  6.0000000000000005e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0475955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0819  ABC transporter related protein  34.96 
 
 		 287 aa  135  7.000000000000001e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.989778  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1458  ABC transporter related  35.78 
 
 		 290 aa  134  9.999999999999999e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.237048  normal  0.276078 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3248  ABC transporter related  34.36 
 
 		 235 aa  134  9.999999999999999e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.013922 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1414  ABC transporter related  34.96 
 
 		 263 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.916121 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3078  ABC transporter, ATP-binding protein  35.78 
 
 		 314 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.437201  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0682  ABC transporter related  36.49 
 
 		 310 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.30246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1094  ABC transporter, ATP-binding protein  34.62 
 
 		 290 aa  133  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0536636  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3089  ABC transporter, ATP-binding protein  33.78 
 
 		 301 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.742999  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3103  ABC transporter ATP-binding protein  33.78 
 
 		 302 aa  132  6e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3349  ABC transporter ATP-binding protein  33.78 
 
 		 302 aa  132  6e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1516  ABC transporter related  33.78 
 
 		 298 aa  131  6.999999999999999e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2982  ABC transporter related protein  40.1 
 
 		 288 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0636  ABC transporter, ATPase subunit  41.35 
 
 		 318 aa  130  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0297  ABC transporter related protein  40.1 
 
 		 289 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1545  ABC-type multidrug transporter, ATP-binding protein; gliding motility-associated protein  35.75 
 
 		 305 aa  129  3e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000116898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0670  ABC transporter related  41.12 
 
 		 318 aa  129  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4207  ABC transporter related  36.92 
 
 		 236 aa  129  4.0000000000000003e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0670  ABC transporter-related protein  41.12 
 
 		 318 aa  129  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.708326  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3319  ABC transporter, ATP-binding protein  33.8 
 
 		 301 aa  128  6e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1770  ABC transporter related protein  39.38 
 
 		 308 aa  128  6e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.471072  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0482  ABC transporter related protein  32.93 
 
 		 247 aa  128  7.000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2644  ABC transporter, ATPase subunit  34.43 
 
 		 317 aa  128  7.000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1980  ABC transporter related  34.4 
 
 		 294 aa  128  7.000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.240272  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2859  ABC transporter related  36.63 
 
 		 301 aa  128  9.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13250  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  37.25 
 
 		 234 aa  127  1.0000000000000001e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.451187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0376  ABC transporter related  37.76 
 
 		 339 aa  127  1.0000000000000001e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2203  ABC transporter related protein  34.93 
 
 		 336 aa  127  1.0000000000000001e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000598238  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0451  ABC transporter related  33.33 
 
 		 234 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000589964  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1619  ABC transporter, ATP-binding protein  36.65 
 
 		 313 aa  126  3e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.54081  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05240  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  34.44 
 
 		 239 aa  126  3e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1171  ABC transporter related protein  38.71 
 
 		 230 aa  126  3e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1723  ABC transporter related  38.42 
 
 		 324 aa  126  3e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0159508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0134  ABC transporter related  36.68 
 
 		 255 aa  126  3e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4023  ABC transporter related  38.12 
 
 		 344 aa  125  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000171205 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1501  ABC transporter  36.65 
 
 		 313 aa  126  4.0000000000000003e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3073  ABC transporter related  34.76 
 
 		 307 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2631  ABC transporter related  35.05 
 
 		 295 aa  126  4.0000000000000003e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.789941  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0949  ABC transporter related  36.18 
 
 		 289 aa  126  4.0000000000000003e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1561  ABC transporter, ATP-binding protein  35.48 
 
 		 312 aa  125  6e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.327811  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2945  ABC transporter related  33.5 
 
 		 314 aa  125  8.000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.760604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2181  ABC transporter related  36.41 
 
 		 326 aa  124  9e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0681  ABC transporter related  40.62 
 
 		 339 aa  124  1e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.249966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1365  ABC transporter related  36.46 
 
 		 313 aa  124  1e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2586  ABC transporter related protein  34.55 
 
 		 287 aa  124  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3144  ABC transporter related  33.03 
 
 		 306 aa  123  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2796  ABC transporter related  35.45 
 
 		 326 aa  123  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.982119 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2645  ABC transporter related  36.63 
 
 		 325 aa  124  2e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6081  ABC transporter related protein  35.12 
 
 		 317 aa  122  3e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1760  ABC transporter related  37.04 
 
 		 292 aa  122  3e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0496  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.41 
 
 		 316 aa  122  6e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.516721  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2810  ABC transporter related protein  36.08 
 
 		 315 aa  122  7e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000850582  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1076  ABC transporter related  31.3 
 
 		 301 aa  121  8e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2678  ABC transporter related protein  37.82 
 
 		 301 aa  121  8e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.448412  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07370  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  33.04 
 
 		 301 aa  121  9.999999999999999e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.171579  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1187  ABC transporter, ATP-binding protein  35.91 
 
 		 293 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0691  ABC transporter related  38.97 
 
 		 319 aa  121  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.711895  normal  0.844705 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1061  ABC transporter related protein  32.66 
 
 		 311 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1750  ABC transporter, ATP-binding protein  33.94 
 
 		 292 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0358  ABC transporter related  35.51 
 
 		 303 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4399  ABC transporter related  35.75 
 
 		 327 aa  120  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.104293  normal  0.447508 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0068  ATPase  37.17 
 
 		 329 aa  119  3.9999999999999996e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0222  hypothetical protein  30.4 
 
 		 308 aa  119  3.9999999999999996e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.238657 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0214  ABC transporter related  34.72 
 
 		 303 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000423562  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3977  ABC transporter related  37.37 
 
 		 315 aa  119  4.9999999999999996e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.319275 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05031  putative multidrug efflux ABC transporter  36.15 
 
 		 337 aa  119  4.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.123969 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1780  multidrug ABC transporter  36.15 
 
 		 337 aa  118  6e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1559  ABC transporter related  34.39 
 
 		 292 aa  119  6e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2791  ABC transporter related  34.39 
 
 		 292 aa  119  6e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0537  ABC transporter related  35.39 
 
 		 256 aa  119  6e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1530  ABC transporter related  31.9 
 
 		 304 aa  118  7e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.653437  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1588  ABC transporter related  33.64 
 
 		 292 aa  118  7e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>