184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2871 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_2871  amidohydrolase 2  100 
 
 
289 aa  595  1e-169  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1017  amidohydrolase 2  88.32 
 
 
293 aa  530  1e-149  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0756102  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2836  amidohydrolase 2  39.72 
 
 
291 aa  226  2e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.192303  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1611  amidohydrolase 2  43.71 
 
 
299 aa  219  3e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4401  amidohydrolase 2  39.72 
 
 
288 aa  214  9.999999999999999e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400198  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0275  amidohydrolase 2  37.54 
 
 
287 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000138051  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0995  amidohydrolase 2  39.5 
 
 
287 aa  212  7e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0606  amidohydrolase 2  37.89 
 
 
291 aa  211  1e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.47355 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4144  amidohydrolase 2  39.72 
 
 
297 aa  209  6e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.46392  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4537  amidohydrolase 2  38.03 
 
 
295 aa  208  1e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136824  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3823  amidohydrolase 2  39.29 
 
 
297 aa  207  2e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4901  amidohydrolase 2  41.92 
 
 
293 aa  205  8e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0686596  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1557  amidohydrolase 2  39.16 
 
 
289 aa  199  5e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4025  amidohydrolase 2  40.83 
 
 
294 aa  195  9e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0646692  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4678  amidohydrolase 2  39.16 
 
 
289 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0376  amidohydrolase 2  39.78 
 
 
286 aa  193  2e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1397  amidohydrolase 2  38.3 
 
 
289 aa  192  4e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.70619  normal  0.985512 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1417  amidohydrolase 2  38.3 
 
 
289 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1655  putative amidohydrolase  39.37 
 
 
294 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2868  amidohydrolase 2  36.43 
 
 
290 aa  185  8e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.341603  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0179  amidohydrolase 2  36.2 
 
 
294 aa  185  9e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4952  amidohydrolase 2  34.86 
 
 
300 aa  180  2e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.260366 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2837  amidohydrolase 2  35.27 
 
 
269 aa  177  2e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4394  amidohydrolase 2  35.36 
 
 
298 aa  176  3e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.247071  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4481  amidohydrolase 2  35.36 
 
 
298 aa  176  3e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4775  amidohydrolase 2  35.36 
 
 
298 aa  176  3e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1278  amidohydrolase family protein  31.43 
 
 
276 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00759688  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2759  amidohydrolase 2  29.29 
 
 
278 aa  124  3e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.82576  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1590  amidohydrolase 2  28.57 
 
 
276 aa  122  6e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00255924  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0495  amidohydrolase 2  29.55 
 
 
278 aa  119  7.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0364  amidohydrolase 2  29.39 
 
 
312 aa  112  9e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0918  amidohydrolase 2  30 
 
 
265 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000146298  normal  0.0660058 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4417  amidohydrolase 2  31.58 
 
 
286 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1437  amidohydrolase 2  28.9 
 
 
277 aa  109  5e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12326  antibiotic-resistance protein  29.32 
 
 
307 aa  108  1e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3097  amidohydrolase 2  28.27 
 
 
279 aa  105  9e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5104  amidohydrolase 2  30.59 
 
 
294 aa  104  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361285  normal  0.325348 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2856  amidohydrolase 2  32.23 
 
 
270 aa  103  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.156395 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3852  amidohydrolase 2  26.37 
 
 
283 aa  103  5e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3529  hypothetical protein  27.24 
 
 
287 aa  99.8  4e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2839  amidohydrolase 2  27.16 
 
 
287 aa  97.8  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.975955  normal  0.522178 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2538  putative amidohydrolase  28.94 
 
 
283 aa  96.3  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.332826 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1757  amidohydrolase 2  29.08 
 
 
293 aa  96.3  6e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000243959  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1842  amidohydrolase 2  29.34 
 
 
279 aa  96.3  6e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2819  amidohydrolase 2  30.23 
 
 
282 aa  95.9  7e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3173  amidohydrolase 2  26.02 
 
 
287 aa  95.9  7e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.820351  normal  0.79914 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13544  hypothetical protein  27.56 
 
 
278 aa  95.9  7e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.70136e-92  hitchhiker  0.000000875537 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4198  amidohydrolase 2  28.48 
 
 
293 aa  95.1  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.200057  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4940  amidohydrolase 2  27.84 
 
 
305 aa  94.4  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.207078  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1435  amidohydrolase 2  29.67 
 
 
282 aa  94.4  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2944  amidohydrolase 2  31.79 
 
 
294 aa  94  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.19972  normal  0.105005 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5612  amidohydrolase 2  27.48 
 
 
277 aa  92.8  6e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2575  amidohydrolase  27.27 
 
 
281 aa  92  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.457647 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4910  amidohydrolase 2  26.33 
 
 
279 aa  87  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.177504 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2147  amidohydrolase 2  28.29 
 
 
286 aa  86.7  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3788  amidohydrolase 2  25.87 
 
 
313 aa  84.7  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0676519  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2231  amidohydrolase 2  27.44 
 
 
300 aa  81.6  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.211376  normal  0.186133 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6447  amidohydrolase 2  30.19 
 
 
286 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000000469414  unclonable  4.69579e-18 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2061  amidohydrolase 2  26.59 
 
 
331 aa  80.1  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.523278  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1805  amidohydrolase 2  32.96 
 
 
310 aa  78.6  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000310667  hitchhiker  0.00134282 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8667  amidohydrolase 2  26.01 
 
 
279 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5107  amidohydrolase 2  26.48 
 
 
258 aa  77.8  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.433963  normal  0.583494 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1776  amidohydrolase 2  25.83 
 
 
277 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.938541  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1823  amidohydrolase 2  25.83 
 
 
277 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.979278  normal  0.694594 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26550  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  26.59 
 
 
268 aa  77  0.0000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000376652  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4348  amidohydrolase 2  25.42 
 
 
279 aa  76.3  0.0000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0561  amidohydrolase 2  23.57 
 
 
283 aa  75.9  0.0000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1757  amidohydrolase 2  25.42 
 
 
277 aa  75.9  0.0000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.990764  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2701  amidohydrolase 2  25.81 
 
 
291 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2032  amidohydrolase 2  25.99 
 
 
283 aa  74.7  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1238  amidohydrolase 2  29.61 
 
 
296 aa  73.9  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.1941  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1562  amidohydrolase 2  26.19 
 
 
285 aa  72.8  0.000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.216517  normal  0.222343 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8361  amidohydrolase 2  24.19 
 
 
287 aa  72.8  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3033  amidohydrolase 2  27.75 
 
 
246 aa  72.8  0.000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.277355  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2965  amidohydrolase 2  25.8 
 
 
264 aa  72.4  0.000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0926  amidohydrolase 2  30.23 
 
 
358 aa  72.4  0.000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.514632  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3202  amidohydrolase 2  31.43 
 
 
297 aa  72  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.763184  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43860  Amidohydrolase  23.6 
 
 
283 aa  70.9  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.106274  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2058  amidohydrolase 2  28.3 
 
 
303 aa  71.6  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0236729  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1996  amidohydrolase 2  24.17 
 
 
279 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2586  amidohydrolase 2  24.82 
 
 
262 aa  69.7  0.00000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000259256  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0547  amidohydrolase 2  20.95 
 
 
285 aa  69.7  0.00000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6430  amidohydrolase family protein  28.65 
 
 
309 aa  68.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467968  hitchhiker  0.00713466 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2978  amidohydrolase 2  30.29 
 
 
297 aa  68.6  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.33934 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1291  amidohydrolase 2  27.93 
 
 
288 aa  67.8  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.127908  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5357  amidohydrolase 2  28.98 
 
 
333 aa  67.4  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0424  amidohydrolase 2  30 
 
 
311 aa  66.2  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2763  amidohydrolase 2  27.49 
 
 
244 aa  63.9  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165032  normal  0.0238203 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0928  hypothetical protein  24.91 
 
 
285 aa  63.5  0.000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2750  amidohydrolase 2  24.9 
 
 
387 aa  63.5  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3966  amidohydrolase 2  27.01 
 
 
884 aa  63.2  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.657438  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2759  amidohydrolase 2  26.75 
 
 
245 aa  62.4  0.000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.0590433 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2574  amidohydrolase 2  23.83 
 
 
288 aa  62  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000906856  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3920  amidohydrolase 2  29.56 
 
 
286 aa  61.6  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6825  amidohydrolase 2  26.7 
 
 
297 aa  62  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2152  2-amino-3-carboxymuconate-6-semialdehyde decarboxylase  25.25 
 
 
345 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1073  amidohydrolase 2  25.89 
 
 
275 aa  61.6  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.270435  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0984  amidohydrolase 2  28.16 
 
 
268 aa  60.5  0.00000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.127508 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2684  amidohydrolase 2  25.82 
 
 
287 aa  60.8  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4140  amidohydrolase 2  22.01 
 
 
261 aa  59.7  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>