91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_19520 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011899  Hore_19520  xylose isomerase  100 
 
 		 354 aa  721    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0401  xylose isomerase-like TIM barrel  52.94 
 
 		 354 aa  388  1e-106  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0010085  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7362  xylose isomerase  30 
 
 		 326 aa  130  5.0000000000000004e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.730487  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2108  xylose isomerase-like  27.68 
 
 		 323 aa  127  3e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.546252  normal  0.693114 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0272  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.37 
 
 		 308 aa  124  2e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0405  xylose isomerase domain-containing protein  28.37 
 
 		 298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.601416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45308  ribokinase  24.53 
 
 		 709 aa  105  1e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.394155  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0246  xylose isomerase domain-containing protein  27.88 
 
 		 296 aa  103  4e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.483047  normal  0.792489 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2644  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.36 
 
 		 332 aa  103  5e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00164635  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1696  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.52 
 
 		 368 aa  95.9  9e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2026  xylose isomerase-like TIM barrel  26.47 
 
 		 380 aa  91.7  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0438  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.81 
 
 		 383 aa  77  0.0000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000351893  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1680  rhamnose isomerase related  25.37 
 
 		 405 aa  63.9  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0758424  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1673  L-rhamnose isomerase  25.42 
 
 		 382 aa  63.5  0.000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0909219  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0695  xylose isomerase  25.35 
 
 		 387 aa  59.7  0.00000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00591309 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4924  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.44 
 
 		 424 aa  59.3  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000076523  normal  0.290794 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0708  xylose isomerase domain-containing protein  23.2 
 
 		 371 aa  58.5  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00278763  hitchhiker  0.000000000165231 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3883  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.51 
 
 		 424 aa  57.8  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2253  L-rhamnose isomerase  26.98 
 
 		 408 aa  57  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000884653  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4214  xylose isomerase domain-containing protein  25.28 
 
 		 424 aa  57  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0943011  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0704  xylose isomerase  24.64 
 
 		 386 aa  56.6  0.0000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2856  L-rhamnose isomerase  25.15 
 
 		 396 aa  56.2  0.0000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3592  xylose isomerase  25.27 
 
 		 395 aa  56.2  0.0000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.239598  normal  0.862129 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2064  xylose isomerase  26 
 
 		 407 aa  55.8  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1604  xylose isomerase  24.19 
 
 		 442 aa  54.3  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2827  xylose isomerase  28 
 
 		 384 aa  53.9  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0427  L-rhamnose isomerase  24.57 
 
 		 397 aa  53.5  0.000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0217069  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1262  xylose isomerase  22.57 
 
 		 382 aa  52.8  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00467888 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0645  xylose isomerase  25.19 
 
 		 396 aa  52.4  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.12173  normal  0.0105473 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1247  xylose isomerase  24.89 
 
 		 382 aa  52.4  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2884  xylose isomerase  24.71 
 
 		 389 aa  51.2  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6687  xylose isomerase  24.52 
 
 		 389 aa  50.8  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.39813 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0353  Xylose isomerase  25.85 
 
 		 383 aa  51.2  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.539165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2985  xylose isomerase  23.78 
 
 		 396 aa  50.4  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0777216  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22690  xylose isomerase  25.85 
 
 		 389 aa  50.8  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2820  xylose isomerase  23.78 
 
 		 436 aa  50.4  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.489798  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0987  xylose isomerase  23.37 
 
 		 390 aa  50.1  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1804  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.75 
 
 		 424 aa  50.1  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3307  xylose isomerase  25.35 
 
 		 393 aa  49.7  0.00008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0151761 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1762  xylose isomerase  24.08 
 
 		 386 aa  48.9  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0454  xylose isomerase  22.58 
 
 		 399 aa  48.9  0.0001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1726  xylose isomerase-like TIM barrel  23.68 
 
 		 429 aa  49.3  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.302713  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5806  L-rhamnose catabolism isomerase  24.16 
 
 		 430 aa  48.9  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142354  normal  0.0518605 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2618  xylose isomerase  24.71 
 
 		 389 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0181  xylose isomerase  29.36 
 
 		 397 aa  48.9  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0150  xylose isomerase  24.17 
 
 		 381 aa  49.3  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0857233 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1733  xylose isomerase  22.58 
 
 		 436 aa  48.9  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.382603  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3648  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.17 
 
 		 286 aa  48.1  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0394614 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4665  xylose isomerase  26.97 
 
 		 405 aa  48.1  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.025606  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2001  xylose isomerase  25.31 
 
 		 441 aa  48.1  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0222  L-rhamnose catabolism isomerase  23.42 
 
 		 430 aa  47.4  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.206591 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06190  xylose isomerase  24.25 
 
 		 393 aa  47  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3573  L-rhamnose catabolism isomerase  23.85 
 
 		 430 aa  47  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6706  L-rhamnose catabolism isomerase  23.12 
 
 		 430 aa  47  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.161678 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3254  xylose isomerase  23.62 
 
 		 390 aa  46.6  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.150364 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2175  xylose isomerase  26.35 
 
 		 395 aa  46.6  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000407625 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1387  L-rhamnose isomerase  23.85 
 
 		 398 aa  46.6  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.568177  normal  0.0266628 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5294  xylose isomerase  22.22 
 
 		 407 aa  46.2  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.196576 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2692  xylose isomerase  21.43 
 
 		 403 aa  46.2  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0509  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.75 
 
 		 289 aa  45.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.440598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2213  L-rhamnose catabolism isomerase  22.54 
 
 		 429 aa  45.4  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.118721 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2504  xylose isomerase  23.76 
 
 		 443 aa  45.8  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.149653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0779  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.49 
 
 		 276 aa  46.2  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1698  xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  23.63 
 
 		 268 aa  45.4  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2911  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.57 
 
 		 297 aa  45.8  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.180268  normal  0.124085 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01690  xylose isomerase  29.27 
 
 		 397 aa  45.4  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6712  L-rhamnose isomerase  26.09 
 
 		 388 aa  45.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.583299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1929  xylose isomerase  23.53 
 
 		 442 aa  45.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.116682  normal  0.849458 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2430  xylose isomerase  28.44 
 
 		 395 aa  45.1  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.404245  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3944  AP endonuclease  25.82 
 
 		 285 aa  44.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0718494  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1757  xylose isomerase  22.96 
 
 		 444 aa  45.4  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4772  L-rhamnose isomerase  23.89 
 
 		 382 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3973  xylose isomerase  22.66 
 
 		 395 aa  44.3  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.025652 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05810  L-rhamnose isomerase  24.19 
 
 		 391 aa  44.3  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2806  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.46 
 
 		 297 aa  44.7  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3832  xylose isomerase  22.56 
 
 		 435 aa  44.3  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.100149  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4478  L-rhamnose isomerase  23.3 
 
 		 382 aa  43.9  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4869  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.35 
 
 		 310 aa  43.9  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1176  xylose isomerase  22.42 
 
 		 433 aa  43.9  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0800628  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4391  rhamnose isomerase related  23.3 
 
 		 382 aa  43.9  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0558803  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4673  L-rhamnose isomerase  26.41 
 
 		 388 aa  43.9  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.239648  normal  0.828695 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2838  xylose isomerase  22.42 
 
 		 433 aa  43.9  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0695629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0653  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.16 
 
 		 285 aa  43.5  0.006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0547  xylose isomerase  21.95 
 
 		 435 aa  43.5  0.006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3624  L-rhamnose isomerase  24.63 
 
 		 388 aa  43.5  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.000224876  normal  0.0801622 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2615  xylose isomerase  23.35 
 
 		 433 aa  43.5  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.242694 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1603  xylose isomerase  28.44 
 
 		 385 aa  43.1  0.008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3045  L-rhamnose isomerase  25.7 
 
 		 396 aa  42.7  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0111676  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2455  rhamnose isomerase-related protein  25.48 
 
 		 396 aa  42.7  0.009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1795  xylose isomerase  23.01 
 
 		 379 aa  42.7  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000406384  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0466  xylose isomerase  25.71 
 
 		 392 aa  42.7  0.01  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>