65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1696 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011661  Dtur_1696  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  100 
 
 		 368 aa  758    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2026  xylose isomerase-like TIM barrel  50.42 
 
 		 380 aa  375  1e-102  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0401  xylose isomerase-like TIM barrel  29.43 
 
 		 354 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0010085  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7362  xylose isomerase  24.26 
 
 		 326 aa  101  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.730487  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0704  xylose isomerase  28.42 
 
 		 386 aa  101  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2884  xylose isomerase  27.46 
 
 		 389 aa  100  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0695  xylose isomerase  26.84 
 
 		 387 aa  100  5e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00591309 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2618  xylose isomerase  27.16 
 
 		 389 aa  99.8  7e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3592  xylose isomerase  26.95 
 
 		 395 aa  96.7  6e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.239598  normal  0.862129 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19520  xylose isomerase  28.52 
 
 		 354 aa  95.9  9e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0150  xylose isomerase  26.17 
 
 		 381 aa  95.1  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0857233 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22690  xylose isomerase  25.15 
 
 		 389 aa  94.7  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6687  xylose isomerase  25.3 
 
 		 389 aa  94.7  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.39813 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3973  xylose isomerase  27.03 
 
 		 395 aa  95.1  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.025652 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5559  xylose isomerase  24.43 
 
 		 385 aa  93.6  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.324328 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1262  xylose isomerase  24.39 
 
 		 382 aa  91.3  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00467888 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2375  xylose isomerase  25.3 
 
 		 387 aa  91.3  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1795  xylose isomerase  25.54 
 
 		 379 aa  91.3  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000406384  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2692  xylose isomerase  26.21 
 
 		 403 aa  90.5  4e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2430  xylose isomerase  26.81 
 
 		 395 aa  90.5  4e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.404245  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1247  xylose isomerase  24.92 
 
 		 382 aa  89.4  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2175  xylose isomerase  26.09 
 
 		 395 aa  88.2  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000407625 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0903  xylose isomerase  24.31 
 
 		 385 aa  85.9  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.122683 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2644  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.04 
 
 		 332 aa  84.7  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00164635  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3254  xylose isomerase  24.92 
 
 		 390 aa  85.1  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.150364 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1603  xylose isomerase  25.32 
 
 		 385 aa  85.1  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0353  Xylose isomerase  23.17 
 
 		 383 aa  84  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.539165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5294  xylose isomerase  24.72 
 
 		 407 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.196576 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2985  xylose isomerase  24.57 
 
 		 396 aa  81.6  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0777216  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0987  xylose isomerase  26.26 
 
 		 390 aa  82  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0405  xylose isomerase domain-containing protein  23.62 
 
 		 298 aa  80.5  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.601416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0246  xylose isomerase domain-containing protein  23.21 
 
 		 296 aa  80.5  0.00000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.483047  normal  0.792489 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2064  xylose isomerase  25.93 
 
 		 407 aa  79.7  0.00000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1762  xylose isomerase  26.3 
 
 		 386 aa  78.2  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3307  xylose isomerase  26.39 
 
 		 393 aa  76.6  0.0000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0151761 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0708  xylose isomerase domain-containing protein  24.44 
 
 		 371 aa  76.3  0.0000000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00278763  hitchhiker  0.000000000165231 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0645  xylose isomerase  23.72 
 
 		 396 aa  75.5  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.12173  normal  0.0105473 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4665  xylose isomerase  24.58 
 
 		 405 aa  75.1  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.025606  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45308  ribokinase  24.75 
 
 		 709 aa  74.7  0.000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.394155  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0466  xylose isomerase  23.85 
 
 		 392 aa  73.2  0.000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01690  xylose isomerase  26.58 
 
 		 397 aa  72.4  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0181  xylose isomerase  23.99 
 
 		 397 aa  72  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0272  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.1 
 
 		 308 aa  71.6  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2827  xylose isomerase  22.7 
 
 		 384 aa  69.7  0.00000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06190  xylose isomerase  26.91 
 
 		 393 aa  68.9  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2108  xylose isomerase-like  22.62 
 
 		 323 aa  64.7  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.546252  normal  0.693114 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0438  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.94 
 
 		 383 aa  61.6  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000351893  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1673  L-rhamnose isomerase  25.19 
 
 		 382 aa  58.5  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0909219  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05810  L-rhamnose isomerase  25.09 
 
 		 391 aa  55.8  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2253  L-rhamnose isomerase  24.43 
 
 		 408 aa  53.5  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000884653  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0706  L-rhamnose isomerase  25.38 
 
 		 409 aa  51.2  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.422023  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4811  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.14 
 
 		 403 aa  50.8  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1680  rhamnose isomerase related  24.71 
 
 		 405 aa  49.3  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0758424  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19530  xylose isomerase  26.47 
 
 		 439 aa  48.9  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2180  xylose isomerase  27.41 
 
 		 441 aa  48.1  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000174675  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0428  L-rhamnose isomerase  24.44 
 
 		 390 aa  48.5  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3045  L-rhamnose isomerase  23.16 
 
 		 396 aa  47.8  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0111676  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0427  L-rhamnose isomerase  22.73 
 
 		 397 aa  47.8  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0217069  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1757  xylose isomerase  27.13 
 
 		 444 aa  47.4  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3883  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.23 
 
 		 424 aa  47  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0130  xylose isomerase  24.38 
 
 		 448 aa  45.8  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00829449  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4924  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.79 
 
 		 424 aa  45.8  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000076523  normal  0.290794 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0692  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.38 
 
 		 428 aa  44.3  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.822847  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2455  rhamnose isomerase-related protein  23.81 
 
 		 396 aa  44.7  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0226  xylose isomerase  26.57 
 
 		 438 aa  42.7  0.01  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.829605  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>